RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.04■□□□□ 0.96
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.58■□□□□ 0.56
CASQ1-202ENST00000467691 ABCC9O60706 1549 aa18.05■□□□□ 0.48
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.58■□□□□ 0.4
CASQ1-202ENST00000467691 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-202ENST00000467691 NACADO15069 1562 aa17.43■□□□□ 0.38
CASQ1-202ENST00000467691 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.41■□□□□ 0.38
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.37■□□□□ 0.37
CASQ1-202ENST00000467691 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.36■□□□□ 0.37
CASQ1-202ENST00000467691 SCRIBQ14160 1630 aa17.04■□□□□ 0.32
CASQ1-202ENST00000467691 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-202ENST00000467691 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
CASQ1-202ENST00000467691 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-202ENST00000467691 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.83■□□□□ 0.28
CASQ1-202ENST00000467691 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CASQ1-202ENST00000467691 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.39■□□□□ 0.21
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.38■□□□□ 0.21
CASQ1-202ENST00000467691 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.31■□□□□ 0.2
CASQ1-202ENST00000467691 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCA4P51532 1647 aa16.28■□□□□ 0.2
CASQ1-202ENST00000467691 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-202ENST00000467691 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.14■□□□□ 0.17
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCA2P51531 1590 aa16.13■□□□□ 0.17
CASQ1-202ENST00000467691 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-202ENST00000467691 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-202ENST00000467691 NCAPD3P42695 1498 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-202ENST00000467691 WIZO95785 1651 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-202ENST00000467691 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CASQ1-202ENST00000467691 HMGXB3Q12766 1538 aa16.02■□□□□ 0.15
CASQ1-202ENST00000467691 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-202ENST00000467691 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-202ENST00000467691 NESP48681 1621 aa15.68■□□□□ 0.1
CASQ1-202ENST00000467691 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.64■□□□□ 0.09
CASQ1-202ENST00000467691 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.63■□□□□ 0.09
CASQ1-202ENST00000467691 CFTRP13569 1480 aa15.59■□□□□ 0.09
CASQ1-202ENST00000467691 ERCC6Q03468 1493 aa15.54■□□□□ 0.08
CASQ1-202ENST00000467691 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.53■□□□□ 0.08
CASQ1-202ENST00000467691 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-202ENST00000467691 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.47■□□□□ 0.07
CASQ1-202ENST00000467691 PRDM2Q13029 1718 aa15.46■□□□□ 0.07
CASQ1-202ENST00000467691 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.44■□□□□ 0.06
CASQ1-202ENST00000467691 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CASQ1-202ENST00000467691 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.36■□□□□ 0.05
CASQ1-202ENST00000467691 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CASQ1-202ENST00000467691 WDR62O43379 1518 aa15.3■□□□□ 0.04
CASQ1-202ENST00000467691 CUX2O14529 1486 aa15.26■□□□□ 0.03
CASQ1-202ENST00000467691 TOPBP1Q92547 1522 aa15.25■□□□□ 0.03
CASQ1-202ENST00000467691 ABCC8Q09428 1581 aa15.24■□□□□ 0.03
CASQ1-202ENST00000467691 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.24■□□□□ 0.03
CASQ1-202ENST00000467691 CUX1P39880 1505 aa15.22■□□□□ 0.03
CASQ1-202ENST00000467691 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
CASQ1-202ENST00000467691 SYNJ1O43426 1573 aa15.15■□□□□ 0.02
CASQ1-202ENST00000467691 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.14■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 TOP2BQ02880 1626 aa15.13■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.11■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 IFT140Q96RY7 1462 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 SOGA1O94964 1423 aa15.09■□□□□ 0.01
CASQ1-202ENST00000467691 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM41Q8WV44 630 aa15.01□□□□□ -0.01
CASQ1-202ENST00000467691 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CASQ1-202ENST00000467691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
CASQ1-202ENST00000467691 WDR97A6NE52 1622 aa14.98□□□□□ -0.01
CASQ1-202ENST00000467691 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.97□□□□□ -0.01
CASQ1-202ENST00000467691 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CASQ1-202ENST00000467691 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.95□□□□□ -0.02
CASQ1-202ENST00000467691 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.91□□□□□ -0.02
CASQ1-202ENST00000467691 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.9□□□□□ -0.02
CASQ1-202ENST00000467691 GRIN2BQ13224 1484 aa14.87□□□□□ -0.03
CASQ1-202ENST00000467691 KIF27Q86VH2 1401 aa14.86□□□□□ -0.03
CASQ1-202ENST00000467691 PBRM1Q86U86 1689 aa14.86□□□□□ -0.03
CASQ1-202ENST00000467691 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.84□□□□□ -0.03
CASQ1-202ENST00000467691 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.82□□□□□ -0.04
CASQ1-202ENST00000467691 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CASQ1-202ENST00000467691 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.8□□□□□ -0.04
CASQ1-202ENST00000467691 FBLN2P98095 1184 aa14.79□□□□□ -0.04
CASQ1-202ENST00000467691 IGF1RP08069 1367 aa14.77□□□□□ -0.04
CASQ1-202ENST00000467691 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS12P58397 1594 aa14.75□□□□□ -0.05
CASQ1-202ENST00000467691 SYNJ2O15056 1496 aa14.75□□□□□ -0.05
CASQ1-202ENST00000467691 CHD1O14646 1710 aa14.74□□□□□ -0.05
CASQ1-202ENST00000467691 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.74□□□□□ -0.05
CASQ1-202ENST00000467691 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CASQ1-202ENST00000467691 CUL7Q14999 1698 aa14.71□□□□□ -0.06
CASQ1-202ENST00000467691 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.7□□□□□ -0.06
CASQ1-202ENST00000467691 EEA1Q15075 1411 aa14.69□□□□□ -0.06
CASQ1-202ENST00000467691 OSCARQ8IYS5 282 aa14.69□□□□□ -0.06
CASQ1-202ENST00000467691 GRIN2AQ12879 1464 aa14.69□□□□□ -0.06
CASQ1-202ENST00000467691 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.68□□□□□ -0.06
CASQ1-202ENST00000467691 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.63□□□□□ -0.07
CASQ1-202ENST00000467691 CEP170Q5SW79 1584 aa14.61□□□□□ -0.07
CASQ1-202ENST00000467691 PRXQ9BXM0 1461 aa14.61□□□□□ -0.07
CASQ1-202ENST00000467691 NUP160Q12769 1436 aa14.59□□□□□ -0.07
CASQ1-202ENST00000467691 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.57□□□□□ -0.08
CASQ1-202ENST00000467691 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.56□□□□□ -0.08
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.56□□□□□ -0.08
CASQ1-202ENST00000467691 KIF21BO75037 1637 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms