RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466223.1

AGRN-204, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 459 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-204ENST00000466223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.02■■■■□ 3.68
AGRN-204ENST00000466223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.71■■■□□ 2.99
AGRN-204ENST00000466223 ABCC9O60706 1549 aa32.78■■■□□ 2.84
AGRN-204ENST00000466223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.84■■■□□ 2.69
AGRN-204ENST00000466223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
AGRN-204ENST00000466223 NACADO15069 1562 aa31.67■■■□□ 2.66
AGRN-204ENST00000466223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.66■■■□□ 2.66
AGRN-204ENST00000466223 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.51■■■□□ 2.63
AGRN-204ENST00000466223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.47■■■□□ 2.63
AGRN-204ENST00000466223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.88■■■□□ 2.53
AGRN-204ENST00000466223 SCRIBQ14160 1630 aa30.78■■■□□ 2.52
AGRN-204ENST00000466223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.51
AGRN-204ENST00000466223 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.6■■■□□ 2.49
AGRN-204ENST00000466223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.36■■■□□ 2.45
AGRN-204ENST00000466223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.27■■■□□ 2.44
AGRN-204ENST00000466223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
AGRN-204ENST00000466223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.65■■■□□ 2.34
AGRN-204ENST00000466223 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.56■■■□□ 2.32
AGRN-204ENST00000466223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
AGRN-204ENST00000466223 SMARCA4P51532 1647 aa29.45■■■□□ 2.31
AGRN-204ENST00000466223 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.29■■■□□ 2.28
AGRN-204ENST00000466223 SMARCA2P51531 1590 aa29.26■■■□□ 2.27
AGRN-204ENST00000466223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.23■■■□□ 2.27
AGRN-204ENST00000466223 NCAPD3P42695 1498 aa29.19■■■□□ 2.26
AGRN-204ENST00000466223 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.14■■■□□ 2.26
AGRN-204ENST00000466223 HMGXB3Q12766 1538 aa29.06■■■□□ 2.24
AGRN-204ENST00000466223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
AGRN-204ENST00000466223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
AGRN-204ENST00000466223 WIZO95785 1651 aa29■■■□□ 2.23
AGRN-204ENST00000466223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
AGRN-204ENST00000466223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
AGRN-204ENST00000466223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.41■■■□□ 2.14
AGRN-204ENST00000466223 NESP48681 1621 aa28.4■■■□□ 2.14
AGRN-204ENST00000466223 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.38■■■□□ 2.13
AGRN-204ENST00000466223 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.38■■■□□ 2.13
AGRN-204ENST00000466223 ERCC6Q03468 1493 aa28.3■■■□□ 2.12
AGRN-204ENST00000466223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.26■■■□□ 2.11
AGRN-204ENST00000466223 CFTRP13569 1480 aa28.23■■■□□ 2.11
AGRN-204ENST00000466223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.1■■■□□ 2.09
AGRN-204ENST00000466223 PRDM2Q13029 1718 aa28.06■■■□□ 2.08
AGRN-204ENST00000466223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.05■■■□□ 2.08
AGRN-204ENST00000466223 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.01■■■□□ 2.07
AGRN-204ENST00000466223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.93■■■□□ 2.06
AGRN-204ENST00000466223 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.9■■■□□ 2.06
AGRN-204ENST00000466223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
AGRN-204ENST00000466223 CUX2O14529 1486 aa27.86■■■□□ 2.05
AGRN-204ENST00000466223 WDR62O43379 1518 aa27.77■■■□□ 2.04
AGRN-204ENST00000466223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
AGRN-204ENST00000466223 ABCC8Q09428 1581 aa27.7■■■□□ 2.03
AGRN-204ENST00000466223 TOPBP1Q92547 1522 aa27.61■■■□□ 2.01
AGRN-204ENST00000466223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.6■■■□□ 2.01
AGRN-204ENST00000466223 CUX1P39880 1505 aa27.46■■□□□ 1.99
AGRN-204ENST00000466223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
AGRN-204ENST00000466223 IFT140Q96RY7 1462 aa27.41■■□□□ 1.98
AGRN-204ENST00000466223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
AGRN-204ENST00000466223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.37■■□□□ 1.97
AGRN-204ENST00000466223 SOGA1O94964 1423 aa27.33■■□□□ 1.97
AGRN-204ENST00000466223 TOP2BQ02880 1626 aa27.31■■□□□ 1.96
AGRN-204ENST00000466223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.3■■□□□ 1.96
AGRN-204ENST00000466223 SYNJ1O43426 1573 aa27.29■■□□□ 1.96
AGRN-204ENST00000466223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.27■■□□□ 1.96
AGRN-204ENST00000466223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
AGRN-204ENST00000466223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
AGRN-204ENST00000466223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
AGRN-204ENST00000466223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
AGRN-204ENST00000466223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.932e-13■■■■□ 20.1
AGRN-204ENST00000466223 WDR97A6NE52 1622 aa27.11■■□□□ 1.93
AGRN-204ENST00000466223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.11■■□□□ 1.93
AGRN-204ENST00000466223 TRIM41Q8WV44 630 aa27.04■■□□□ 1.92
AGRN-204ENST00000466223 GAPVD1Q14C86 1478 aa27■■□□□ 1.91
AGRN-204ENST00000466223 GRIN2BQ13224 1484 aa26.97■■□□□ 1.91
AGRN-204ENST00000466223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.94■■□□□ 1.9
AGRN-204ENST00000466223 PBRM1Q86U86 1689 aa26.92■■□□□ 1.9
AGRN-204ENST00000466223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.87■■□□□ 1.89
AGRN-204ENST00000466223 FBLN2P98095 1184 aa26.87■■□□□ 1.89
AGRN-204ENST00000466223 KIF27Q86VH2 1401 aa26.87■■□□□ 1.89
AGRN-204ENST00000466223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
AGRN-204ENST00000466223 OSCARQ8IYS5 282 aa26.83■■□□□ 1.89
AGRN-204ENST00000466223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
AGRN-204ENST00000466223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.8■■□□□ 1.88
AGRN-204ENST00000466223 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.78■■□□□ 1.88
AGRN-204ENST00000466223 CHD1O14646 1710 aa26.76■■□□□ 1.88
AGRN-204ENST00000466223 SYNJ2O15056 1496 aa26.76■■□□□ 1.87
AGRN-204ENST00000466223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.7■■□□□ 1.86
AGRN-204ENST00000466223 IGF1RP08069 1367 aa26.69■■□□□ 1.86
AGRN-204ENST00000466223 ADAMTS12P58397 1594 aa26.68■■□□□ 1.86
AGRN-204ENST00000466223 CUL7Q14999 1698 aa26.62■■□□□ 1.85
AGRN-204ENST00000466223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.61■■□□□ 1.85
AGRN-204ENST00000466223 GRIN2AQ12879 1464 aa26.6■■□□□ 1.85
AGRN-204ENST00000466223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.57■■□□□ 1.84
AGRN-204ENST00000466223 EEA1Q15075 1411 aa26.51■■□□□ 1.83
AGRN-204ENST00000466223 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.47■■□□□ 1.83
AGRN-204ENST00000466223 NUP160Q12769 1436 aa26.45■■□□□ 1.82
AGRN-204ENST00000466223 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
AGRN-204ENST00000466223 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.44■■□□□ 1.82
AGRN-204ENST00000466223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.42■■□□□ 1.82
AGRN-204ENST00000466223 CEP170Q5SW79 1584 aa26.42■■□□□ 1.82
AGRN-204ENST00000466223 PRXQ9BXM0 1461 aa26.34■■□□□ 1.81
AGRN-204ENST00000466223 ARHGEF11O15085 1522 aa26.3■■□□□ 1.8
AGRN-204ENST00000466223 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.29■■□□□ 1.8
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