RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465708.5

GLIS3-207, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,481 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-207ENST00000465708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.35■■■■■ 5.01
GLIS3-207ENST00000465708 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41■■■■■ 4.15
GLIS3-207ENST00000465708 ABCC9O60706 1549 aa39.56■■■■□ 3.92
GLIS3-207ENST00000465708 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
GLIS3-207ENST00000465708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.45■■■■□ 3.75
GLIS3-207ENST00000465708 NACADO15069 1562 aa38.44■■■■□ 3.74
GLIS3-207ENST00000465708 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.43■■■■□ 3.74
GLIS3-207ENST00000465708 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.43■■■■□ 3.74
GLIS3-207ENST00000465708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.35■■■■□ 3.73
GLIS3-207ENST00000465708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.4■■■■□ 3.58
GLIS3-207ENST00000465708 SCRIBQ14160 1630 aa37.37■■■■□ 3.57
GLIS3-207ENST00000465708 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.12■■■■□ 3.53
GLIS3-207ENST00000465708 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.04■■■■□ 3.52
GLIS3-207ENST00000465708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.9■■■■□ 3.5
GLIS3-207ENST00000465708 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.16■■■■□ 3.38
GLIS3-207ENST00000465708 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
GLIS3-207ENST00000465708 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.99■■■■□ 3.35
GLIS3-207ENST00000465708 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
GLIS3-207ENST00000465708 SMARCA4P51532 1647 aa35.84■■■■□ 3.33
GLIS3-207ENST00000465708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.83■■■■□ 3.33
GLIS3-207ENST00000465708 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.69■■■■□ 3.3
GLIS3-207ENST00000465708 SMARCA2P51531 1590 aa35.55■■■■□ 3.28
GLIS3-207ENST00000465708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.53■■■■□ 3.28
GLIS3-207ENST00000465708 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.53■■■■□ 3.28
GLIS3-207ENST00000465708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
GLIS3-207ENST00000465708 NCAPD3P42695 1498 aa35.47■■■■□ 3.27
GLIS3-207ENST00000465708 HMGXB3Q12766 1538 aa35.34■■■■□ 3.25
GLIS3-207ENST00000465708 WIZO95785 1651 aa35.3■■■■□ 3.24
GLIS3-207ENST00000465708 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
GLIS3-207ENST00000465708 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
GLIS3-207ENST00000465708 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
GLIS3-207ENST00000465708 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.59■■■■□ 3.13
GLIS3-207ENST00000465708 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.45■■■■□ 3.11
GLIS3-207ENST00000465708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.45■■■■□ 3.11
GLIS3-207ENST00000465708 NESP48681 1621 aa34.37■■■■□ 3.09
GLIS3-207ENST00000465708 CFTRP13569 1480 aa34.36■■■■□ 3.09
GLIS3-207ENST00000465708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.22■■■■□ 3.07
GLIS3-207ENST00000465708 ERCC6Q03468 1493 aa34.1■■■■□ 3.05
GLIS3-207ENST00000465708 PRDM2Q13029 1718 aa34.1■■■■□ 3.05
GLIS3-207ENST00000465708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.03■■■■□ 3.04
GLIS3-207ENST00000465708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.98■■■■□ 3.03
GLIS3-207ENST00000465708 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.96■■■■□ 3.03
GLIS3-207ENST00000465708 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.8■■■■□ 3
GLIS3-207ENST00000465708 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
GLIS3-207ENST00000465708 WDR62O43379 1518 aa33.67■■■□□ 2.98
GLIS3-207ENST00000465708 ABCC8Q09428 1581 aa33.64■■■□□ 2.98
GLIS3-207ENST00000465708 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
GLIS3-207ENST00000465708 CUX2O14529 1486 aa33.6■■■□□ 2.97
GLIS3-207ENST00000465708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.55■■■□□ 2.96
GLIS3-207ENST00000465708 TOPBP1Q92547 1522 aa33.54■■■□□ 2.96
GLIS3-207ENST00000465708 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.95
GLIS3-207ENST00000465708 CUX1P39880 1505 aa33.45■■■□□ 2.95
GLIS3-207ENST00000465708 TOP2BQ02880 1626 aa33.33■■■□□ 2.93
GLIS3-207ENST00000465708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.31■■■□□ 2.92
GLIS3-207ENST00000465708 SYNJ1O43426 1573 aa33.3■■■□□ 2.92
GLIS3-207ENST00000465708 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
GLIS3-207ENST00000465708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.27■■■□□ 2.92
GLIS3-207ENST00000465708 IFT140Q96RY7 1462 aa33.24■■■□□ 2.91
GLIS3-207ENST00000465708 SOGA1O94964 1423 aa33.17■■■□□ 2.9
GLIS3-207ENST00000465708 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
GLIS3-207ENST00000465708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.09■■■□□ 2.89
GLIS3-207ENST00000465708 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.01■■■□□ 2.88
GLIS3-207ENST00000465708 TRIM41Q8WV44 630 aa33■■■□□ 2.87
GLIS3-207ENST00000465708 WDR97A6NE52 1622 aa32.98■■■□□ 2.87
GLIS3-207ENST00000465708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
GLIS3-207ENST00000465708 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.91■■■□□ 2.86
GLIS3-207ENST00000465708 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
GLIS3-207ENST00000465708 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
GLIS3-207ENST00000465708 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.86■■■□□ 2.85
GLIS3-207ENST00000465708 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.81■■■□□ 2.84
GLIS3-207ENST00000465708 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.8■■■□□ 2.84
GLIS3-207ENST00000465708 KIF27Q86VH2 1401 aa32.75■■■□□ 2.83
GLIS3-207ENST00000465708 GRIN2BQ13224 1484 aa32.74■■■□□ 2.83
GLIS3-207ENST00000465708 PBRM1Q86U86 1689 aa32.66■■■□□ 2.82
GLIS3-207ENST00000465708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.64■■■□□ 2.82
GLIS3-207ENST00000465708 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
GLIS3-207ENST00000465708 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.59■■■□□ 2.81
GLIS3-207ENST00000465708 IGF1RP08069 1367 aa32.53■■■□□ 2.8
GLIS3-207ENST00000465708 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.5■■■□□ 2.79
GLIS3-207ENST00000465708 EEA1Q15075 1411 aa32.49■■■□□ 2.79
GLIS3-207ENST00000465708 SYNJ2O15056 1496 aa32.47■■■□□ 2.79
GLIS3-207ENST00000465708 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.46■■■□□ 2.79
GLIS3-207ENST00000465708 ADAMTS12P58397 1594 aa32.45■■■□□ 2.79
GLIS3-207ENST00000465708 CUL7Q14999 1698 aa32.43■■■□□ 2.78
GLIS3-207ENST00000465708 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
GLIS3-207ENST00000465708 FBLN2P98095 1184 aa32.36■■■□□ 2.77
GLIS3-207ENST00000465708 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.35■■■□□ 2.77
GLIS3-207ENST00000465708 CHD1O14646 1710 aa32.35■■■□□ 2.77
GLIS3-207ENST00000465708 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.32■■■□□ 2.76
GLIS3-207ENST00000465708 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.31■■■□□ 2.76
GLIS3-207ENST00000465708 GRIN2AQ12879 1464 aa32.31■■■□□ 2.76
GLIS3-207ENST00000465708 OSCARQ8IYS5 282 aa32.29■■■□□ 2.76
GLIS3-207ENST00000465708 PRXQ9BXM0 1461 aa32.23■■■□□ 2.75
GLIS3-207ENST00000465708 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
GLIS3-207ENST00000465708 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.22■■■□□ 2.75
GLIS3-207ENST00000465708 NUP160Q12769 1436 aa32.16■■■□□ 2.74
GLIS3-207ENST00000465708 CEP170Q5SW79 1584 aa32.09■■■□□ 2.73
GLIS3-207ENST00000465708 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.06■■■□□ 2.72
GLIS3-207ENST00000465708 KIF21BO75037 1637 aa32.05■■■□□ 2.72
GLIS3-207ENST00000465708 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.99■■■□□ 2.71
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