RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
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SOGA3-204ENST00000464495 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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SOGA3-204ENST00000464495 MSH5O43196 834 aa23.23■■□□□ 1.31
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SOGA3-204ENST00000464495 POTEDQ86YR6 584 aa23.12■■□□□ 1.29
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SOGA3-204ENST00000464495 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.65■■□□□ 1.22
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SOGA3-204ENST00000464495 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.83■■□□□ 1.09
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SOGA3-204ENST00000464495 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.89■□□□□ 0.94
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SOGA3-204ENST00000464495 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.14■□□□□ 0.65
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SOGA3-204ENST00000464495 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.94■□□□□ 0.62
SOGA3-204ENST00000464495 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.94■□□□□ 0.62
SOGA3-204ENST00000464495 WIZO95785 1651 aa18.91■□□□□ 0.62
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SOGA3-204ENST00000464495 ARHGEF11O15085 1522 aa18.83■□□□□ 0.6
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SOGA3-204ENST00000464495 PRDM2Q13029 1718 aa18.71■□□□□ 0.59
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SOGA3-204ENST00000464495 TOPBP1Q92547 1522 aa18.58■□□□□ 0.56
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SOGA3-204ENST00000464495 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SOGA3-204ENST00000464495 CAPN15O75808 1086 aa18.42■□□□□ 0.54
SOGA3-204ENST00000464495 DSG3P32926 999 aa18.41■□□□□ 0.54
SOGA3-204ENST00000464495 SYNJ1O43426 1573 aa18.36■□□□□ 0.53
SOGA3-204ENST00000464495 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SOGA3-204ENST00000464495 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SOGA3-204ENST00000464495 WDR97A6NE52 1622 aa18.32■□□□□ 0.52
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