RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.42■■■□□ 2.94
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2-202ENST00000460567 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SUCLG2-202ENST00000460567 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.98■■■□□ 2.07
SUCLG2-202ENST00000460567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.77■■■□□ 2.04
SUCLG2-202ENST00000460567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.64■■■□□ 2.02
SUCLG2-202ENST00000460567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.18■■□□□ 1.94
SUCLG2-202ENST00000460567 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.16■■□□□ 1.94
SUCLG2-202ENST00000460567 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SUCLG2-202ENST00000460567 NACADO15069 1562 aa26.68■■□□□ 1.86
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCC9O60706 1549 aa26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2-202ENST00000460567 SCRIBQ14160 1630 aa26.47■■□□□ 1.83
SUCLG2-202ENST00000460567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2-202ENST00000460567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2-202ENST00000460567 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SUCLG2-202ENST00000460567 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.78■■□□□ 1.72
SUCLG2-202ENST00000460567 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.77■■□□□ 1.72
SUCLG2-202ENST00000460567 WIZO95785 1651 aa25.6■■□□□ 1.69
SUCLG2-202ENST00000460567 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.6■■□□□ 1.69
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM41Q8WV44 630 aa25.52■■□□□ 1.68
SUCLG2-202ENST00000460567 SMARCA4P51532 1647 aa25.51■■□□□ 1.68
SUCLG2-202ENST00000460567 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SUCLG2-202ENST00000460567 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2-202ENST00000460567 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SUCLG2-202ENST00000460567 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.3■■□□□ 1.64
SUCLG2-202ENST00000460567 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2-202ENST00000460567 SMARCA2P51531 1590 aa25.2■■□□□ 1.63
SUCLG2-202ENST00000460567 HRCP23327 699 aa25.19■■□□□ 1.62
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.16■■□□□ 1.62
SUCLG2-202ENST00000460567 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.13■■□□□ 1.61
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
SUCLG2-202ENST00000460567 EEA1Q15075 1411 aa24.93■■□□□ 1.58
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SUCLG2-202ENST00000460567 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.88■■□□□ 1.57
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCC8Q09428 1581 aa24.82■■□□□ 1.56
SUCLG2-202ENST00000460567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SUCLG2-202ENST00000460567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
SUCLG2-202ENST00000460567 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SUCLG2-202ENST00000460567 HMGXB3Q12766 1538 aa24.64■■□□□ 1.53
SUCLG2-202ENST00000460567 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SUCLG2-202ENST00000460567 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.61■■□□□ 1.53
SUCLG2-202ENST00000460567 NCAPD3P42695 1498 aa24.58■■□□□ 1.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SOGA1O94964 1423 aa24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2-202ENST00000460567 GOLGA3Q08378 1498 aa24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNJ1O43426 1573 aa24.48■■□□□ 1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF21BO75037 1637 aa24.47■■□□□ 1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 CEP162Q5TB80 1403 aa24.46■■□□□ 1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.44■■□□□ 1.5
SUCLG2-202ENST00000460567 TOP2BQ02880 1626 aa24.41■■□□□ 1.5
SUCLG2-202ENST00000460567 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.41■■□□□ 1.5
SUCLG2-202ENST00000460567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.38■■□□□ 1.49
SUCLG2-202ENST00000460567 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.35■■□□□ 1.49
SUCLG2-202ENST00000460567 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SUCLG2-202ENST00000460567 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SUCLG2-202ENST00000460567 CFTRP13569 1480 aa24.24■■□□□ 1.47
SUCLG2-202ENST00000460567 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SUCLG2-202ENST00000460567 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
SUCLG2-202ENST00000460567 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.18■■□□□ 1.46
SUCLG2-202ENST00000460567 CLIP1P30622 1438 aa24.11■■□□□ 1.45
SUCLG2-202ENST00000460567 CUX1P39880 1505 aa24.06■■□□□ 1.44
SUCLG2-202ENST00000460567 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.05■■□□□ 1.44
SUCLG2-202ENST00000460567 PRXQ9BXM0 1461 aa24.04■■□□□ 1.44
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF27Q86VH2 1401 aa24.04■■□□□ 1.44
SUCLG2-202ENST00000460567 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.04■■□□□ 1.44
SUCLG2-202ENST00000460567 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.98■■□□□ 1.43
SUCLG2-202ENST00000460567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.91■■□□□ 1.42
SUCLG2-202ENST00000460567 APLP2Q06481 763 aa23.9■■□□□ 1.42
SUCLG2-202ENST00000460567 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SUCLG2-202ENST00000460567 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SUCLG2-202ENST00000460567 ARAP1Q96P48 1450 aa23.71■■□□□ 1.39
SUCLG2-202ENST00000460567 CUX2O14529 1486 aa23.7■■□□□ 1.38
SUCLG2-202ENST00000460567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.69■■□□□ 1.38
SUCLG2-202ENST00000460567 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.69■■□□□ 1.38
SUCLG2-202ENST00000460567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.68■■□□□ 1.38
SUCLG2-202ENST00000460567 IGF1RP08069 1367 aa23.66■■□□□ 1.38
SUCLG2-202ENST00000460567 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.63■■□□□ 1.37
SUCLG2-202ENST00000460567 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SUCLG2-202ENST00000460567 MAP3K1Q13233 1512 aa23.59■■□□□ 1.37
SUCLG2-202ENST00000460567 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.59■■□□□ 1.37
SUCLG2-202ENST00000460567 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.57■■□□□ 1.36
SUCLG2-202ENST00000460567 TOPBP1Q92547 1522 aa23.53■■□□□ 1.36
SUCLG2-202ENST00000460567 CUL7Q14999 1698 aa23.52■■□□□ 1.36
SUCLG2-202ENST00000460567 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.5■■□□□ 1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.46■■□□□ 1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.42■■□□□ 1.34
SUCLG2-202ENST00000460567 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
SUCLG2-202ENST00000460567 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR97A6NE52 1622 aa23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2-202ENST00000460567 TIAM1Q13009 1591 aa23.38■■□□□ 1.33
SUCLG2-202ENST00000460567 NESP48681 1621 aa23.34■■□□□ 1.33
SUCLG2-202ENST00000460567 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.32■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms