RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458729.5

SEMA3C-205, Transcript of semaphorin 3C, human

TSL 2

Gene SEMA3C, Length 1,318 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3C-205	ENST00000458729	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		62.06	■■■■■ 7.53
SEMA3C-205	ENST00000458729	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		55.02	■■■■■ 6.4
SEMA3C-205	ENST00000458729	ABCC9	O60706	1549 aa		53.52	■■■■■ 6.16
SEMA3C-205	ENST00000458729	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		51.77	■■■■■ 5.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	51.75	■■■■■ 5.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	NACAD	O15069	1562 aa		51.69	■■■■■ 5.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.66	■■■■■ 5.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		51.51	■■■■■ 5.84
SEMA3C-205	ENST00000458729	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		51.4	■■■■■ 5.82
SEMA3C-205	ENST00000458729	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		50.39	■■■■■ 5.66
SEMA3C-205	ENST00000458729	SCRIB	Q14160	1630 aa		50.19	■■■■■ 5.63
SEMA3C-205	ENST00000458729	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	50.1	■■■■■ 5.61
SEMA3C-205	ENST00000458729	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		50.03	■■■■■ 5.6
SEMA3C-205	ENST00000458729	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		49.62	■■■■■ 5.53
SEMA3C-205	ENST00000458729	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.83	■■■■■ 5.41
SEMA3C-205	ENST00000458729	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.71	■■■■■ 5.39
SEMA3C-205	ENST00000458729	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.42	■■■■■ 5.34
SEMA3C-205	ENST00000458729	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.29	■■■■■ 5.32
SEMA3C-205	ENST00000458729	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	48.09	■■■■■ 5.29
SEMA3C-205	ENST00000458729	SMARCA4	P51532	1647 aa		48.06	■■■■■ 5.28
SEMA3C-205	ENST00000458729	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.81	■■■■■ 5.24
SEMA3C-205	ENST00000458729	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47.75	■■■■■ 5.23
SEMA3C-205	ENST00000458729	SMARCA2	P51531	1590 aa		47.73	■■■■■ 5.23
SEMA3C-205	ENST00000458729	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.7	■■■■■ 5.23
SEMA3C-205	ENST00000458729	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.61	■■■■■ 5.21
SEMA3C-205	ENST00000458729	HMGXB3	Q12766	1538 aa		47.47	■■■■■ 5.19
SEMA3C-205	ENST00000458729	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	47.41	■■■■■ 5.18
SEMA3C-205	ENST00000458729	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	47.38	■■■■■ 5.18
SEMA3C-205	ENST00000458729	WIZ	O95785	1651 aa		47.29	■■■■■ 5.16
SEMA3C-205	ENST00000458729	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	46.85	■■■■■ 5.09
SEMA3C-205	ENST00000458729	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	46.48	■■■■■ 5.03
SEMA3C-205	ENST00000458729	NES	P48681	1621 aa		46.39	■■■■■ 5.02
SEMA3C-205	ENST00000458729	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46.37	■■■■■ 5.01
SEMA3C-205	ENST00000458729	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		46.35	■■■■■ 5.01
SEMA3C-205	ENST00000458729	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		46.31	■■■■■ 5
SEMA3C-205	ENST00000458729	ERCC6	Q03468	1493 aa		46.14	■■■■■ 4.98
SEMA3C-205	ENST00000458729	CFTR	P13569	1480 aa		46.11	■■■■■ 4.97
SEMA3C-205	ENST00000458729	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		46.1	■■■■■ 4.97
SEMA3C-205	ENST00000458729	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.82	■■■■■ 4.93
SEMA3C-205	ENST00000458729	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.77	■■■■■ 4.92
SEMA3C-205	ENST00000458729	PRDM2	Q13029	1718 aa		45.72	■■■■■ 4.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.69	■■■■■ 4.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.61	■■■■■ 4.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.56	■■■■■ 4.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	CUX2	O14529	1486 aa		45.55	■■■■■ 4.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	WDR62	O43379	1518 aa		45.37	■■■■■ 4.85
SEMA3C-205	ENST00000458729	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	45.27	■■■■■ 4.84
SEMA3C-205	ENST00000458729	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.16	■■■■■ 4.82
SEMA3C-205	ENST00000458729	TOPBP1	Q92547	1522 aa		45.07	■■■■■ 4.81
SEMA3C-205	ENST00000458729	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		45.05	■■■■■ 4.8
SEMA3C-205	ENST00000458729	CUX1	P39880	1505 aa		44.83	■■■■■ 4.77
SEMA3C-205	ENST00000458729	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.74	■■■■■ 4.75
SEMA3C-205	ENST00000458729	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	44.71	■■■■■ 4.75
SEMA3C-205	ENST00000458729	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.71	■■■■■ 4.75
SEMA3C-205	ENST00000458729	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		44.64	■■■■■ 4.74
SEMA3C-205	ENST00000458729	SOGA1	O94964	1423 aa		44.57	■■■■■ 4.73
SEMA3C-205	ENST00000458729	TOP2B	Q02880	1626 aa		44.55	■■■■■ 4.72
SEMA3C-205	ENST00000458729	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.53	■■■■■ 4.72
SEMA3C-205	ENST00000458729	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		44.52	■■■■■ 4.72
SEMA3C-205	ENST00000458729	SYNJ1	O43426	1573 aa		44.52	■■■■■ 4.72
SEMA3C-205	ENST00000458729	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		44.5	■■■■■ 4.71
SEMA3C-205	ENST00000458729	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.45	■■■■■ 4.71
SEMA3C-205	ENST00000458729	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.28	■■■■■ 4.68
SEMA3C-205	ENST00000458729	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	44.28	■■■■■ 4.68
SEMA3C-205	ENST00000458729	WDR97	A6NE52	1622 aa		44.26	■■■■■ 4.68
SEMA3C-205	ENST00000458729	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	44.26	■■■■■ 4.68
SEMA3C-205	ENST00000458729	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		44.25	■■■■■ 4.67
SEMA3C-205	ENST00000458729	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		44.05	■■■■■ 4.64
SEMA3C-205	ENST00000458729	GRIN2B	Q13224	1484 aa		44.01	■■■■■ 4.64
SEMA3C-205	ENST00000458729	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		44	■■■■■ 4.63
SEMA3C-205	ENST00000458729	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.93	■■■■■ 4.62
SEMA3C-205	ENST00000458729	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.86	■■■■■ 4.61
SEMA3C-205	ENST00000458729	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.86	■■■■■ 4.61
SEMA3C-205	ENST00000458729	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.85	■■■■■ 4.61
SEMA3C-205	ENST00000458729	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.8	■■■■■ 4.6
SEMA3C-205	ENST00000458729	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.78	■■■■■ 4.6
SEMA3C-205	ENST00000458729	KIF27	Q86VH2	1401 aa		43.77	■■■■■ 4.6
SEMA3C-205	ENST00000458729	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.73	■■■■■ 4.59
SEMA3C-205	ENST00000458729	FBLN2	P98095	1184 aa		43.73	■■■■■ 4.59
SEMA3C-205	ENST00000458729	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.68	■■■■■ 4.58
SEMA3C-205	ENST00000458729	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.68	■■■■■ 4.58
SEMA3C-205	ENST00000458729	CHD1	O14646	1710 aa		43.64	■■■■■ 4.58
SEMA3C-205	ENST00000458729	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.57	■■■■■ 4.57
SEMA3C-205	ENST00000458729	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.57	■■■■■ 4.57
SEMA3C-205	ENST00000458729	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.56	■■■■■ 4.56
SEMA3C-205	ENST00000458729	IGF1R	P08069	1367 aa		43.55	■■■■■ 4.56
SEMA3C-205	ENST00000458729	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.42	■■■■■ 4.54
SEMA3C-205	ENST00000458729	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.4	■■■■■ 4.54
SEMA3C-205	ENST00000458729	CUL7	Q14999	1698 aa		43.38	■■■■■ 4.54
SEMA3C-205	ENST00000458729	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SEMA3C-205	ENST00000458729	NUP160	Q12769	1436 aa		43.22	■■■■■ 4.51
SEMA3C-205	ENST00000458729	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.21	■■■■■ 4.51
SEMA3C-205	ENST00000458729	EEA1	Q15075	1411 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SEMA3C-205	ENST00000458729	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SEMA3C-205	ENST00000458729	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SEMA3C-205	ENST00000458729	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SEMA3C-205	ENST00000458729	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SEMA3C-205	ENST00000458729	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SEMA3C-205	ENST00000458729	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
SEMA3C-205	ENST00000458729	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.92	■■■■■ 4.46

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