RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445998.1

UBQLN3-202, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBQLN3, Length 817 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-202ENST00000445998 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.79■■■□□ 2.84
UBQLN3-202ENST00000445998 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.09■■■□□ 2.25
UBQLN3-202ENST00000445998 ABCC9O60706 1549 aa28.11■■■□□ 2.09
UBQLN3-202ENST00000445998 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
UBQLN3-202ENST00000445998 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.33■■□□□ 1.97
UBQLN3-202ENST00000445998 NACADO15069 1562 aa27.3■■□□□ 1.96
UBQLN3-202ENST00000445998 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.26■■□□□ 1.95
UBQLN3-202ENST00000445998 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.23■■□□□ 1.95
UBQLN3-202ENST00000445998 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.2■■□□□ 1.94
UBQLN3-202ENST00000445998 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.61■■□□□ 1.85
UBQLN3-202ENST00000445998 SCRIBQ14160 1630 aa26.47■■□□□ 1.83
UBQLN3-202ENST00000445998 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.33■■□□□ 1.8
UBQLN3-202ENST00000445998 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
UBQLN3-202ENST00000445998 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.19■■□□□ 1.78
UBQLN3-202ENST00000445998 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
UBQLN3-202ENST00000445998 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.52■■□□□ 1.68
UBQLN3-202ENST00000445998 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.48■■□□□ 1.67
UBQLN3-202ENST00000445998 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.45■■□□□ 1.66
UBQLN3-202ENST00000445998 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
UBQLN3-202ENST00000445998 SMARCA4P51532 1647 aa25.38■■□□□ 1.65
UBQLN3-202ENST00000445998 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.23■■□□□ 1.63
UBQLN3-202ENST00000445998 SMARCA2P51531 1590 aa25.22■■□□□ 1.63
UBQLN3-202ENST00000445998 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
UBQLN3-202ENST00000445998 NCAPD3P42695 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
UBQLN3-202ENST00000445998 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.15■■□□□ 1.62
UBQLN3-202ENST00000445998 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
UBQLN3-202ENST00000445998 HMGXB3Q12766 1538 aa25.05■■□□□ 1.6
UBQLN3-202ENST00000445998 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
UBQLN3-202ENST00000445998 WIZO95785 1651 aa25■■□□□ 1.59
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UBQLN3-202ENST00000445998 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.48■■□□□ 1.51
UBQLN3-202ENST00000445998 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.46■■□□□ 1.51
UBQLN3-202ENST00000445998 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.43■■□□□ 1.5
UBQLN3-202ENST00000445998 NESP48681 1621 aa24.38■■□□□ 1.49
UBQLN3-202ENST00000445998 CFTRP13569 1480 aa24.33■■□□□ 1.49
UBQLN3-202ENST00000445998 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.32■■□□□ 1.48
UBQLN3-202ENST00000445998 ERCC6Q03468 1493 aa24.28■■□□□ 1.48
UBQLN3-202ENST00000445998 PRDM2Q13029 1718 aa24.24■■□□□ 1.47
UBQLN3-202ENST00000445998 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.16■■□□□ 1.46
UBQLN3-202ENST00000445998 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.13■■□□□ 1.45
UBQLN3-202ENST00000445998 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.1■■□□□ 1.45
UBQLN3-202ENST00000445998 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.99■■□□□ 1.43
UBQLN3-202ENST00000445998 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
UBQLN3-202ENST00000445998 CUX2O14529 1486 aa23.94■■□□□ 1.42
UBQLN3-202ENST00000445998 ABCC8Q09428 1581 aa23.9■■□□□ 1.42
UBQLN3-202ENST00000445998 WDR62O43379 1518 aa23.89■■□□□ 1.41
UBQLN3-202ENST00000445998 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
UBQLN3-202ENST00000445998 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.78■■□□□ 1.4
UBQLN3-202ENST00000445998 TOPBP1Q92547 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
UBQLN3-202ENST00000445998 CUX1P39880 1505 aa23.66■■□□□ 1.38
UBQLN3-202ENST00000445998 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
UBQLN3-202ENST00000445998 IFT140Q96RY7 1462 aa23.59■■□□□ 1.37
UBQLN3-202ENST00000445998 TOP2BQ02880 1626 aa23.58■■□□□ 1.36
UBQLN3-202ENST00000445998 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.58■■□□□ 1.36
UBQLN3-202ENST00000445998 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UBQLN3-202ENST00000445998 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.56■■□□□ 1.36
UBQLN3-202ENST00000445998 SOGA1O94964 1423 aa23.53■■□□□ 1.36
UBQLN3-202ENST00000445998 SYNJ1O43426 1573 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBQLN3-202ENST00000445998 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.44■■□□□ 1.34
UBQLN3-202ENST00000445998 WDR97A6NE52 1622 aa23.41■■□□□ 1.34
UBQLN3-202ENST00000445998 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.37■■□□□ 1.33
UBQLN3-202ENST00000445998 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UBQLN3-202ENST00000445998 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UBQLN3-202ENST00000445998 TRIM41Q8WV44 630 aa23.33■■□□□ 1.33
UBQLN3-202ENST00000445998 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UBQLN3-202ENST00000445998 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
UBQLN3-202ENST00000445998 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
UBQLN3-202ENST00000445998 GRIN2BQ13224 1484 aa23.23■■□□□ 1.31
UBQLN3-202ENST00000445998 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.22■■□□□ 1.31
UBQLN3-202ENST00000445998 PBRM1Q86U86 1689 aa23.19■■□□□ 1.3
UBQLN3-202ENST00000445998 KIF27Q86VH2 1401 aa23.17■■□□□ 1.3
UBQLN3-202ENST00000445998 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.16■■□□□ 1.3
UBQLN3-202ENST00000445998 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UBQLN3-202ENST00000445998 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.13■■□□□ 1.29
UBQLN3-202ENST00000445998 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.1■■□□□ 1.29
UBQLN3-202ENST00000445998 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UBQLN3-202ENST00000445998 FBLN2P98095 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
UBQLN3-202ENST00000445998 OSCARQ8IYS5 282 aa23.04■■□□□ 1.28
UBQLN3-202ENST00000445998 SYNJ2O15056 1496 aa23.04■■□□□ 1.28
UBQLN3-202ENST00000445998 CHD1O14646 1710 aa23.02■■□□□ 1.28
UBQLN3-202ENST00000445998 IGF1RP08069 1367 aa23.01■■□□□ 1.27
UBQLN3-202ENST00000445998 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23■■□□□ 1.27
UBQLN3-202ENST00000445998 CUL7Q14999 1698 aa22.98■■□□□ 1.27
UBQLN3-202ENST00000445998 ADAMTS12P58397 1594 aa22.97■■□□□ 1.27
UBQLN3-202ENST00000445998 EEA1Q15075 1411 aa22.95■■□□□ 1.26
UBQLN3-202ENST00000445998 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.93■■□□□ 1.26
UBQLN3-202ENST00000445998 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.9■■□□□ 1.26
UBQLN3-202ENST00000445998 GRIN2AQ12879 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
UBQLN3-202ENST00000445998 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.88■■□□□ 1.25
UBQLN3-202ENST00000445998 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.86■■□□□ 1.25
UBQLN3-202ENST00000445998 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN3-202ENST00000445998 NUP160Q12769 1436 aa22.77■■□□□ 1.24
UBQLN3-202ENST00000445998 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
UBQLN3-202ENST00000445998 PRXQ9BXM0 1461 aa22.74■■□□□ 1.23
UBQLN3-202ENST00000445998 CEP170Q5SW79 1584 aa22.74■■□□□ 1.23
UBQLN3-202ENST00000445998 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.73■■□□□ 1.23
UBQLN3-202ENST00000445998 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.67■■□□□ 1.22
UBQLN3-202ENST00000445998 KIF21BO75037 1637 aa22.63■■□□□ 1.21
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