RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.52■■■□□ 2.48
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TTLL1-203ENST00000439248 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.04■■□□□ 1.6
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TTLL1-203ENST00000439248 SCRIBQ14160 1630 aa24.65■■□□□ 1.54
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TTLL1-203ENST00000439248 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.77■■□□□ 1.4
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TTLL1-203ENST00000439248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.47■■□□□ 1.35
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TTLL1-203ENST00000439248 HRCP23327 699 aa23.38■■□□□ 1.33
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TTLL1-203ENST00000439248 SMARCA2P51531 1590 aa23.22■■□□□ 1.31
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TTLL1-203ENST00000439248 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.89■■□□□ 1.25
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TTLL1-203ENST00000439248 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.86■■□□□ 1.25
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TTLL1-203ENST00000439248 PRDM2Q13029 1718 aa22.49■■□□□ 1.19
TTLL1-203ENST00000439248 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.49■■□□□ 1.19
TTLL1-203ENST00000439248 CFTRP13569 1480 aa22.47■■□□□ 1.19
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TTLL1-203ENST00000439248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.33■■□□□ 1.16
TTLL1-203ENST00000439248 CUX2O14529 1486 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL1-203ENST00000439248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.25■■□□□ 1.15
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TTLL1-203ENST00000439248 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.04■■□□□ 1.12
TTLL1-203ENST00000439248 WDR62O43379 1518 aa22.03■■□□□ 1.12
TTLL1-203ENST00000439248 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.01■■□□□ 1.11
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TTLL1-203ENST00000439248 TOPBP1Q92547 1522 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL1-203ENST00000439248 CEP162Q5TB80 1403 aa21.92■■□□□ 1.1
TTLL1-203ENST00000439248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
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TTLL1-203ENST00000439248 GOLGA3Q08378 1498 aa21.86■■□□□ 1.09
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TTLL1-203ENST00000439248 SOGA1O94964 1423 aa21.84■■□□□ 1.09
TTLL1-203ENST00000439248 KIF21BO75037 1637 aa21.81■■□□□ 1.08
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TTLL1-203ENST00000439248 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.75■■□□□ 1.07
TTLL1-203ENST00000439248 WDR97A6NE52 1622 aa21.72■■□□□ 1.07
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TTLL1-203ENST00000439248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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TTLL1-203ENST00000439248 CLIP1P30622 1438 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL1-203ENST00000439248 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TTLL1-203ENST00000439248 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
TTLL1-203ENST00000439248 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.5■■□□□ 1.03
TTLL1-203ENST00000439248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.47■■□□□ 1.03
TTLL1-203ENST00000439248 IGF1RP08069 1367 aa21.45■■□□□ 1.02
TTLL1-203ENST00000439248 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TTLL1-203ENST00000439248 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TTLL1-203ENST00000439248 CUL7Q14999 1698 aa21.39■■□□□ 1.02
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