RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-208ENST00000420964 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.79■■■□□ 2.2
FAAP20-208ENST00000420964 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-208ENST00000420964 ABCC9O60706 1549 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-208ENST00000420964 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
FAAP20-208ENST00000420964 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-208ENST00000420964 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-208ENST00000420964 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-208ENST00000420964 NACADO15069 1562 aa23.64■■□□□ 1.37
FAAP20-208ENST00000420964 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-208ENST00000420964 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-208ENST00000420964 SCRIBQ14160 1630 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-208ENST00000420964 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.16■■□□□ 1.3
FAAP20-208ENST00000420964 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-208ENST00000420964 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.05■■□□□ 1.28
FAAP20-208ENST00000420964 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-208ENST00000420964 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.35■■□□□ 1.17
FAAP20-208ENST00000420964 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.31■■□□□ 1.16
FAAP20-208ENST00000420964 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
FAAP20-208ENST00000420964 SMARCA4P51532 1647 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-208ENST00000420964 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-208ENST00000420964 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-208ENST00000420964 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-208ENST00000420964 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-208ENST00000420964 WIZO95785 1651 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-208ENST00000420964 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-208ENST00000420964 SMARCA2P51531 1590 aa21.93■■□□□ 1.1
FAAP20-208ENST00000420964 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.9■■□□□ 1.1
FAAP20-208ENST00000420964 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FAAP20-208ENST00000420964 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-208ENST00000420964 HMGXB3Q12766 1538 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-208ENST00000420964 NCAPD3P42695 1498 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-208ENST00000420964 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-208ENST00000420964 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-208ENST00000420964 NESP48681 1621 aa21.28■■□□□ 1
FAAP20-208ENST00000420964 ERCC6Q03468 1493 aa21.23■□□□□ 0.99
FAAP20-208ENST00000420964 CFTRP13569 1480 aa21.2■□□□□ 0.98
FAAP20-208ENST00000420964 PRDM2Q13029 1718 aa21.19■□□□□ 0.98
FAAP20-208ENST00000420964 CUX2O14529 1486 aa21.19■□□□□ 0.98
FAAP20-208ENST00000420964 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.17■□□□□ 0.98
FAAP20-208ENST00000420964 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.14■□□□□ 0.97
FAAP20-208ENST00000420964 ABCC8Q09428 1581 aa20.98■□□□□ 0.95
FAAP20-208ENST00000420964 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
FAAP20-208ENST00000420964 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.97■□□□□ 0.95
FAAP20-208ENST00000420964 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.96■□□□□ 0.95
FAAP20-208ENST00000420964 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.94■□□□□ 0.94
FAAP20-208ENST00000420964 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.94■□□□□ 0.94
FAAP20-208ENST00000420964 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.89■□□□□ 0.94
FAAP20-208ENST00000420964 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
FAAP20-208ENST00000420964 SYNJ1O43426 1573 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-208ENST00000420964 CUX1P39880 1505 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-208ENST00000420964 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-208ENST00000420964 TOP2BQ02880 1626 aa20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-208ENST00000420964 TRIM41Q8WV44 630 aa20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-208ENST00000420964 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.76■□□□□ 0.91
FAAP20-208ENST00000420964 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.73■□□□□ 0.91
FAAP20-208ENST00000420964 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
FAAP20-208ENST00000420964 TOPBP1Q92547 1522 aa20.72■□□□□ 0.91
FAAP20-208ENST00000420964 WDR62O43379 1518 aa20.65■□□□□ 0.9
FAAP20-208ENST00000420964 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.63■□□□□ 0.89
FAAP20-208ENST00000420964 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-208ENST00000420964 SOGA1O94964 1423 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-208ENST00000420964 WDR97A6NE52 1622 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-208ENST00000420964 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-208ENST00000420964 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-208ENST00000420964 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-208ENST00000420964 EEA1Q15075 1411 aa20.44■□□□□ 0.86
FAAP20-208ENST00000420964 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.42■□□□□ 0.86
FAAP20-208ENST00000420964 IFT140Q96RY7 1462 aa20.41■□□□□ 0.86
FAAP20-208ENST00000420964 KIF27Q86VH2 1401 aa20.39■□□□□ 0.85
FAAP20-208ENST00000420964 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FAAP20-208ENST00000420964 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-208ENST00000420964 OSCARQ8IYS5 282 aa20.29■□□□□ 0.84
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-208ENST00000420964 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-208ENST00000420964 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-208ENST00000420964 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 PBRM1Q86U86 1689 aa20.26■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 KIF21BO75037 1637 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.22■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 IGF1RP08069 1367 aa20.21■□□□□ 0.83
FAAP20-208ENST00000420964 CUL7Q14999 1698 aa20.19■□□□□ 0.82
FAAP20-208ENST00000420964 GRIN2BQ13224 1484 aa20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-208ENST00000420964 PRXQ9BXM0 1461 aa20.18■□□□□ 0.82
FAAP20-208ENST00000420964 GOLGA3Q08378 1498 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 ADAMTS12P58397 1594 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-208ENST00000420964 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-208ENST00000420964 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-208ENST00000420964 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-208ENST00000420964 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-208ENST00000420964 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-208ENST00000420964 SYNJ2O15056 1496 aa19.98■□□□□ 0.79
FAAP20-208ENST00000420964 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
FAAP20-208ENST00000420964 ARHGEF11O15085 1522 aa19.97■□□□□ 0.79
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