RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420190.6

SAMD11-203, Transcript of sterile alpha motif domain containing 11, humanhuman

TSL 3

Gene SAMD11, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11-203ENST00000420190 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63■■■■■ 7.68
SAMD11-203ENST00000420190 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.63■■■■■ 6.5
SAMD11-203ENST00000420190 ABCC9O60706 1549 aa54.15■■■■■ 6.26
SAMD11-203ENST00000420190 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
SAMD11-203ENST00000420190 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.56■■■■■ 6
SAMD11-203ENST00000420190 NACADO15069 1562 aa52.2■■■■■ 5.95
SAMD11-203ENST00000420190 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.14■■■■■ 5.94
SAMD11-203ENST00000420190 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.03■■■■■ 5.92
SAMD11-203ENST00000420190 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.01■■■■■ 5.92
SAMD11-203ENST00000420190 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.09■■■■■ 5.77
SAMD11-203ENST00000420190 SCRIBQ14160 1630 aa50.99■■■■■ 5.75
SAMD11-203ENST00000420190 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.77■■■■■ 5.72
SAMD11-203ENST00000420190 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.68■■■■■ 5.7
SAMD11-203ENST00000420190 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.28■■■■■ 5.64
SAMD11-203ENST00000420190 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.34■■■■■ 5.49
SAMD11-203ENST00000420190 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.48
SAMD11-203ENST00000420190 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.14■■■■■ 5.46
SAMD11-203ENST00000420190 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.94■■■■■ 5.42
SAMD11-203ENST00000420190 SMARCA4P51532 1647 aa48.76■■■■■ 5.4
SAMD11-203ENST00000420190 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.72■■■■■ 5.39
SAMD11-203ENST00000420190 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.64■■■■■ 5.38
SAMD11-203ENST00000420190 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.38■■■■■ 5.34
SAMD11-203ENST00000420190 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
SAMD11-203ENST00000420190 SMARCA2P51531 1590 aa48.25■■■■■ 5.31
SAMD11-203ENST00000420190 NCAPD3P42695 1498 aa48.22■■■■■ 5.31
SAMD11-203ENST00000420190 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.21■■■■■ 5.31
SAMD11-203ENST00000420190 WIZO95785 1651 aa48.14■■■■■ 5.3
SAMD11-203ENST00000420190 HMGXB3Q12766 1538 aa47.99■■■■■ 5.27
SAMD11-203ENST00000420190 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
SAMD11-203ENST00000420190 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
SAMD11-203ENST00000420190 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
SAMD11-203ENST00000420190 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.09■■■■■ 5.13
SAMD11-203ENST00000420190 NESP48681 1621 aa47.06■■■■■ 5.12
SAMD11-203ENST00000420190 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.88■■■■■ 5.09
SAMD11-203ENST00000420190 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.82■■■■■ 5.09
SAMD11-203ENST00000420190 CFTRP13569 1480 aa46.7■■■■■ 5.07
SAMD11-203ENST00000420190 ERCC6Q03468 1493 aa46.53■■■■■ 5.04
SAMD11-203ENST00000420190 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.49■■■■■ 5.03
SAMD11-203ENST00000420190 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.43■■■■■ 5.02
SAMD11-203ENST00000420190 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.35■■■■■ 5.01
SAMD11-203ENST00000420190 PRDM2Q13029 1718 aa46.31■■■■■ 5
SAMD11-203ENST00000420190 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.2■■■■■ 4.99
SAMD11-203ENST00000420190 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
SAMD11-203ENST00000420190 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.02■■■■■ 4.96
SAMD11-203ENST00000420190 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
SAMD11-203ENST00000420190 WDR62O43379 1518 aa45.85■■■■■ 4.93
SAMD11-203ENST00000420190 CUX2O14529 1486 aa45.76■■■■■ 4.92
SAMD11-203ENST00000420190 TOPBP1Q92547 1522 aa45.67■■■■■ 4.9
SAMD11-203ENST00000420190 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.62■■■■■ 4.89
SAMD11-203ENST00000420190 ABCC8Q09428 1581 aa45.59■■■■■ 4.89
SAMD11-203ENST00000420190 CUX1P39880 1505 aa45.58■■■■■ 4.89
SAMD11-203ENST00000420190 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.43■■■■■ 4.86
SAMD11-203ENST00000420190 SYNJ1O43426 1573 aa45.36■■■■■ 4.85
SAMD11-203ENST00000420190 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
SAMD11-203ENST00000420190 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.31■■■■■ 4.84
SAMD11-203ENST00000420190 TOP2BQ02880 1626 aa45.26■■■■■ 4.84
SAMD11-203ENST00000420190 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.23■■■■■ 4.83
SAMD11-203ENST00000420190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.21■■■■■ 4.83
SAMD11-203ENST00000420190 IFT140Q96RY7 1462 aa45.18■■■■■ 4.82
SAMD11-203ENST00000420190 SOGA1O94964 1423 aa45.15■■■■■ 4.82
SAMD11-203ENST00000420190 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
SAMD11-203ENST00000420190 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
SAMD11-203ENST00000420190 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
SAMD11-203ENST00000420190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.9■■■■■ 4.78
SAMD11-203ENST00000420190 WDR97A6NE52 1622 aa44.86■■■■■ 4.77
SAMD11-203ENST00000420190 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.85■■■■■ 4.77
SAMD11-203ENST00000420190 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
SAMD11-203ENST00000420190 TRIM41Q8WV44 630 aa44.78■■■■■ 4.76
SAMD11-203ENST00000420190 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.77■■■■■ 4.76
SAMD11-203ENST00000420190 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.63■■■■■ 4.73
SAMD11-203ENST00000420190 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.62■■■■■ 4.73
SAMD11-203ENST00000420190 GRIN2BQ13224 1484 aa44.51■■■■■ 4.72
SAMD11-203ENST00000420190 PBRM1Q86U86 1689 aa44.48■■■■■ 4.71
SAMD11-203ENST00000420190 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.44■■■■■ 4.7
SAMD11-203ENST00000420190 KIF27Q86VH2 1401 aa44.4■■■■■ 4.7
SAMD11-203ENST00000420190 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.37■■■■■ 4.69
SAMD11-203ENST00000420190 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
SAMD11-203ENST00000420190 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.28■■■■■ 4.68
SAMD11-203ENST00000420190 FBLN2P98095 1184 aa44.26■■■■■ 4.68
SAMD11-203ENST00000420190 IGF1RP08069 1367 aa44.25■■■■■ 4.67
SAMD11-203ENST00000420190 CHD1O14646 1710 aa44.19■■■■■ 4.66
SAMD11-203ENST00000420190 ADAMTS12P58397 1594 aa44.16■■■■■ 4.66
SAMD11-203ENST00000420190 SYNJ2O15056 1496 aa44.16■■■■■ 4.66
SAMD11-203ENST00000420190 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
SAMD11-203ENST00000420190 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.1■■■■■ 4.65
SAMD11-203ENST00000420190 OSCARQ8IYS5 282 aa44.05■■■■■ 4.64
SAMD11-203ENST00000420190 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
SAMD11-203ENST00000420190 GRIN2AQ12879 1464 aa43.97■■■■■ 4.63
SAMD11-203ENST00000420190 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.97■■■■■ 4.63
SAMD11-203ENST00000420190 CUL7Q14999 1698 aa43.96■■■■■ 4.63
SAMD11-203ENST00000420190 EEA1Q15075 1411 aa43.9■■■■■ 4.62
SAMD11-203ENST00000420190 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.85■■■■■ 4.61
SAMD11-203ENST00000420190 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.85■■■■■ 4.61
SAMD11-203ENST00000420190 CEP170Q5SW79 1584 aa43.78■■■■■ 4.6
SAMD11-203ENST00000420190 NUP160Q12769 1436 aa43.74■■■■■ 4.59
SAMD11-203ENST00000420190 PRXQ9BXM0 1461 aa43.73■■■■■ 4.59
SAMD11-203ENST00000420190 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.72■■■■■ 4.59
SAMD11-203ENST00000420190 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.7■■■■■ 4.59
SAMD11-203ENST00000420190 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.46■■■■■ 4.55
SAMD11-203ENST00000420190 KIF21BO75037 1637 aa43.45■■■■■ 4.55
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