RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.11■□□□□ 0.97
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.49■□□□□ 0.87
CD27-AS1-202ENST00000417058 ABCC9O60706 1549 aa19.64■□□□□ 0.73
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CD27-AS1-202ENST00000417058 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CD27-AS1-202ENST00000417058 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.3■□□□□ 0.68
CD27-AS1-202ENST00000417058 POTEDQ86YR6 584 aa19.23■□□□□ 0.67
CD27-AS1-202ENST00000417058 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.22■□□□□ 0.67
CD27-AS1-202ENST00000417058 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.22■□□□□ 0.67
CD27-AS1-202ENST00000417058 NACADO15069 1562 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-202ENST00000417058 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.08■□□□□ 0.64
CD27-AS1-202ENST00000417058 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CD27-AS1-202ENST00000417058 SCRIBQ14160 1630 aa18.73■□□□□ 0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.65■□□□□ 0.58
CD27-AS1-202ENST00000417058 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.62■□□□□ 0.57
CD27-AS1-202ENST00000417058 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.51■□□□□ 0.55
CD27-AS1-202ENST00000417058 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
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CD27-AS1-202ENST00000417058 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.09■□□□□ 0.49
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CD27-AS1-202ENST00000417058 SMARCA4P51532 1647 aa17.96■□□□□ 0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.95■□□□□ 0.46
CD27-AS1-202ENST00000417058 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CD27-AS1-202ENST00000417058 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.81■□□□□ 0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.79■□□□□ 0.44
CD27-AS1-202ENST00000417058 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.77■□□□□ 0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 WIZO95785 1651 aa17.77■□□□□ 0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 SMARCA2P51531 1590 aa17.75■□□□□ 0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CD27-AS1-202ENST00000417058 NCAPD3P42695 1498 aa17.7■□□□□ 0.42
CD27-AS1-202ENST00000417058 MSH5O43196 834 aa17.67■□□□□ 0.42
CD27-AS1-202ENST00000417058 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.67■□□□□ 0.42
CD27-AS1-202ENST00000417058 HMGXB3Q12766 1538 aa17.64■□□□□ 0.41
CD27-AS1-202ENST00000417058 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CD27-AS1-202ENST00000417058 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.41■□□□□ 0.38
CD27-AS1-202ENST00000417058 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.2■□□□□ 0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 CFTRP13569 1480 aa17.19■□□□□ 0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.14■□□□□ 0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 NESP48681 1621 aa17.13■□□□□ 0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRDM2Q13029 1718 aa17.07■□□□□ 0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.02■□□□□ 0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.99■□□□□ 0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.92■□□□□ 0.3
CD27-AS1-202ENST00000417058 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.92■□□□□ 0.3
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CD27-AS1-202ENST00000417058 ERCC6Q03468 1493 aa16.87■□□□□ 0.29
CD27-AS1-202ENST00000417058 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
CD27-AS1-202ENST00000417058 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.81■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 CUX1P39880 1505 aa16.81■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 SYNJ1O43426 1573 aa16.79■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.78■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 TOP2BQ02880 1626 aa16.78■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 TOPBP1Q92547 1522 aa16.77■□□□□ 0.28
CD27-AS1-202ENST00000417058 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.77■□□□□ 0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 WDR62O43379 1518 aa16.75■□□□□ 0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRIM41Q8WV44 630 aa16.73■□□□□ 0.27
CD27-AS1-202ENST00000417058 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.68■□□□□ 0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CD27-AS1-202ENST00000417058 CUX2O14529 1486 aa16.61■□□□□ 0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 SOGA1O94964 1423 aa16.59■□□□□ 0.25
CD27-AS1-202ENST00000417058 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.58■□□□□ 0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 IFT140Q96RY7 1462 aa16.56■□□□□ 0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.56■□□□□ 0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CD27-AS1-202ENST00000417058 WDR97A6NE52 1622 aa16.51■□□□□ 0.23
CD27-AS1-202ENST00000417058 KIF27Q86VH2 1401 aa16.47■□□□□ 0.23
CD27-AS1-202ENST00000417058 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.46■□□□□ 0.23
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 EEA1Q15075 1411 aa16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.41■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 IGF1RP08069 1367 aa16.37■□□□□ 0.21
CD27-AS1-202ENST00000417058 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-202ENST00000417058 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.35■□□□□ 0.21
CD27-AS1-202ENST00000417058 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.35■□□□□ 0.21
CD27-AS1-202ENST00000417058 GRIN2BQ13224 1484 aa16.35■□□□□ 0.21
CD27-AS1-202ENST00000417058 PBRM1Q86U86 1689 aa16.33■□□□□ 0.2
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRXQ9BXM0 1461 aa16.29■□□□□ 0.2
CD27-AS1-202ENST00000417058 CUL7Q14999 1698 aa16.27■□□□□ 0.2
CD27-AS1-202ENST00000417058 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.27■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 ADAMTS12P58397 1594 aa16.25■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.24■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 KIF21BO75037 1637 aa16.24■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.21■□□□□ 0.19
CD27-AS1-202ENST00000417058 SYNJ2O15056 1496 aa16.19■□□□□ 0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 GOLGA3Q08378 1498 aa16.17■□□□□ 0.18
CD27-AS1-202ENST00000417058 GRIN2AQ12879 1464 aa16.14■□□□□ 0.17
CD27-AS1-202ENST00000417058 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.14■□□□□ 0.17
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