RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.95■■■■■ 4.31
UPP1-202ENST00000395560 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.02■■■■□ 3.52
UPP1-202ENST00000395560 ABCC9O60706 1549 aa36.7■■■■□ 3.47
UPP1-202ENST00000395560 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
UPP1-202ENST00000395560 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.81■■■■□ 3.16
UPP1-202ENST00000395560 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.78■■■■□ 3.16
UPP1-202ENST00000395560 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.72■■■■□ 3.15
UPP1-202ENST00000395560 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.71■■■■□ 3.15
UPP1-202ENST00000395560 NACADO15069 1562 aa34.64■■■■□ 3.14
UPP1-202ENST00000395560 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.56■■■■□ 3.12
UPP1-202ENST00000395560 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.19■■■■□ 3.06
UPP1-202ENST00000395560 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.15■■■■□ 3.06
UPP1-202ENST00000395560 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.97■■■■□ 3.03
UPP1-202ENST00000395560 SCRIBQ14160 1630 aa33.75■■■□□ 2.99
UPP1-202ENST00000395560 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.49■■■□□ 2.95
UPP1-202ENST00000395560 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.13■■■□□ 2.89
UPP1-202ENST00000395560 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
UPP1-202ENST00000395560 CECR2Q9BXF3 1484 aa33■■■□□ 2.87
UPP1-202ENST00000395560 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
UPP1-202ENST00000395560 SMARCA4P51532 1647 aa32.39■■■□□ 2.78
UPP1-202ENST00000395560 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.3■■■□□ 2.76
UPP1-202ENST00000395560 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
UPP1-202ENST00000395560 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.1■■■□□ 2.73
UPP1-202ENST00000395560 SMARCA2P51531 1590 aa32.07■■■□□ 2.72
UPP1-202ENST00000395560 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.03■■■□□ 2.72
UPP1-202ENST00000395560 WIZO95785 1651 aa31.99■■■□□ 2.71
UPP1-202ENST00000395560 NCAPD3P42695 1498 aa31.94■■■□□ 2.7
UPP1-202ENST00000395560 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
UPP1-202ENST00000395560 HMGXB3Q12766 1538 aa31.85■■■□□ 2.69
UPP1-202ENST00000395560 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
UPP1-202ENST00000395560 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
UPP1-202ENST00000395560 NESP48681 1621 aa31.58■■■□□ 2.65
UPP1-202ENST00000395560 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.58■■■□□ 2.65
UPP1-202ENST00000395560 ERCC6Q03468 1493 aa31.56■■■□□ 2.64
UPP1-202ENST00000395560 CUX2O14529 1486 aa31.52■■■□□ 2.64
UPP1-202ENST00000395560 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.34■■■□□ 2.61
UPP1-202ENST00000395560 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
UPP1-202ENST00000395560 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.17■■■□□ 2.58
UPP1-202ENST00000395560 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.15■■■□□ 2.58
UPP1-202ENST00000395560 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-202ENST00000395560 CFTRP13569 1480 aa31■■■□□ 2.55
UPP1-202ENST00000395560 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.92■■■□□ 2.54
UPP1-202ENST00000395560 PRDM2Q13029 1718 aa30.84■■■□□ 2.53
UPP1-202ENST00000395560 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.76■■■□□ 2.52
UPP1-202ENST00000395560 WDR62O43379 1518 aa30.73■■■□□ 2.51
UPP1-202ENST00000395560 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.66■■■□□ 2.5
UPP1-202ENST00000395560 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.61■■■□□ 2.49
UPP1-202ENST00000395560 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
UPP1-202ENST00000395560 ABCC8Q09428 1581 aa30.38■■■□□ 2.45
UPP1-202ENST00000395560 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
UPP1-202ENST00000395560 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.29■■■□□ 2.44
UPP1-202ENST00000395560 CUX1P39880 1505 aa30.27■■■□□ 2.44
UPP1-202ENST00000395560 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.25■■■□□ 2.43
UPP1-202ENST00000395560 TOP2BQ02880 1626 aa30.25■■■□□ 2.43
UPP1-202ENST00000395560 TOPBP1Q92547 1522 aa30.24■■■□□ 2.43
UPP1-202ENST00000395560 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.24■■■□□ 2.43
UPP1-202ENST00000395560 TRIM41Q8WV44 630 aa30.22■■■□□ 2.43
UPP1-202ENST00000395560 SYNJ1O43426 1573 aa30.22■■■□□ 2.43
UPP1-202ENST00000395560 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
UPP1-202ENST00000395560 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.06■■■□□ 2.4
UPP1-202ENST00000395560 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
UPP1-202ENST00000395560 OSCARQ8IYS5 282 aa30■■■□□ 2.39
UPP1-202ENST00000395560 IFT140Q96RY7 1462 aa29.98■■■□□ 2.39
UPP1-202ENST00000395560 SOGA1O94964 1423 aa29.95■■■□□ 2.38
UPP1-202ENST00000395560 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
UPP1-202ENST00000395560 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
UPP1-202ENST00000395560 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.86■■■□□ 2.37
UPP1-202ENST00000395560 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.84■■■□□ 2.37
UPP1-202ENST00000395560 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.81■■■□□ 2.36
UPP1-202ENST00000395560 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.81■■■□□ 2.36
UPP1-202ENST00000395560 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.81■■■□□ 2.36
UPP1-202ENST00000395560 WDR97A6NE52 1622 aa29.78■■■□□ 2.36
UPP1-202ENST00000395560 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
UPP1-202ENST00000395560 KIF27Q86VH2 1401 aa29.72■■■□□ 2.35
UPP1-202ENST00000395560 CHD1O14646 1710 aa29.7■■■□□ 2.34
UPP1-202ENST00000395560 ARHGEF11O15085 1522 aa29.69■■■□□ 2.34
UPP1-202ENST00000395560 EEA1Q15075 1411 aa29.69■■■□□ 2.34
UPP1-202ENST00000395560 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
UPP1-202ENST00000395560 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.63■■■□□ 2.33
UPP1-202ENST00000395560 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.61■■■□□ 2.33
UPP1-202ENST00000395560 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.57■■■□□ 2.32
UPP1-202ENST00000395560 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-202ENST00000395560 GRIN2BQ13224 1484 aa29.52■■■□□ 2.32
UPP1-202ENST00000395560 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.49■■■□□ 2.31
UPP1-202ENST00000395560 PBRM1Q86U86 1689 aa29.49■■■□□ 2.31
UPP1-202ENST00000395560 IGF1RP08069 1367 aa29.48■■■□□ 2.31
UPP1-202ENST00000395560 FBLN2P98095 1184 aa29.46■■■□□ 2.31
UPP1-202ENST00000395560 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
UPP1-202ENST00000395560 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.45■■■□□ 2.31
UPP1-202ENST00000395560 ARAP1Q96P48 1450 aa29.44■■■□□ 2.3
UPP1-202ENST00000395560 CUL7Q14999 1698 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-202ENST00000395560 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-202ENST00000395560 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
UPP1-202ENST00000395560 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-202ENST00000395560 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.33■■■□□ 2.29
UPP1-202ENST00000395560 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-202ENST00000395560 PRXQ9BXM0 1461 aa29.3■■■□□ 2.28
UPP1-202ENST00000395560 ADAMTS12P58397 1594 aa29.29■■■□□ 2.28
UPP1-202ENST00000395560 KIF21BO75037 1637 aa29.27■■■□□ 2.28
UPP1-202ENST00000395560 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms