RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394177.3

ZNF394-202, Transcript of zinc finger protein 394, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF394, Length 542 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394-202ENST00000394177 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.2■■■■■ 5.15
ZNF394-202ENST00000394177 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.77■■■■■ 4.28
ZNF394-202ENST00000394177 ABCC9O60706 1549 aa40.32■■■■■ 4.04
ZNF394-202ENST00000394177 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
ZNF394-202ENST00000394177 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
ZNF394-202ENST00000394177 NACADO15069 1562 aa39.22■■■■□ 3.87
ZNF394-202ENST00000394177 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.19■■■■□ 3.86
ZNF394-202ENST00000394177 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.17■■■■□ 3.86
ZNF394-202ENST00000394177 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.1■■■■□ 3.85
ZNF394-202ENST00000394177 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.07■■■■□ 3.68
ZNF394-202ENST00000394177 SCRIBQ14160 1630 aa37.98■■■■□ 3.67
ZNF394-202ENST00000394177 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.84■■■■□ 3.65
ZNF394-202ENST00000394177 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.77■■■■□ 3.64
ZNF394-202ENST00000394177 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.76■■■■□ 3.64
ZNF394-202ENST00000394177 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.69■■■■□ 3.62
ZNF394-202ENST00000394177 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
ZNF394-202ENST00000394177 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.64■■■■□ 3.46
ZNF394-202ENST00000394177 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
ZNF394-202ENST00000394177 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.52■■■■□ 3.44
ZNF394-202ENST00000394177 SMARCA4P51532 1647 aa36.48■■■■□ 3.43
ZNF394-202ENST00000394177 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.32■■■■□ 3.4
ZNF394-202ENST00000394177 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.23■■■■□ 3.39
ZNF394-202ENST00000394177 SMARCA2P51531 1590 aa36.23■■■■□ 3.39
ZNF394-202ENST00000394177 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.23■■■■□ 3.39
ZNF394-202ENST00000394177 NCAPD3P42695 1498 aa36.22■■■■□ 3.39
ZNF394-202ENST00000394177 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
ZNF394-202ENST00000394177 HMGXB3Q12766 1538 aa36.03■■■■□ 3.36
ZNF394-202ENST00000394177 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ZNF394-202ENST00000394177 WIZO95785 1651 aa35.89■■■■□ 3.34
ZNF394-202ENST00000394177 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
ZNF394-202ENST00000394177 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ZNF394-202ENST00000394177 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.34■■■■□ 3.25
ZNF394-202ENST00000394177 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.22■■■■□ 3.23
ZNF394-202ENST00000394177 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.16■■■■□ 3.22
ZNF394-202ENST00000394177 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.13■■■■□ 3.21
ZNF394-202ENST00000394177 CFTRP13569 1480 aa35.03■■■■□ 3.2
ZNF394-202ENST00000394177 NESP48681 1621 aa35.01■■■■□ 3.19
ZNF394-202ENST00000394177 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.93■■■■□ 3.18
ZNF394-202ENST00000394177 ERCC6Q03468 1493 aa34.77■■■■□ 3.16
ZNF394-202ENST00000394177 PRDM2Q13029 1718 aa34.69■■■■□ 3.14
ZNF394-202ENST00000394177 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.68■■■■□ 3.14
ZNF394-202ENST00000394177 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.59■■■■□ 3.13
ZNF394-202ENST00000394177 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.58■■■■□ 3.13
ZNF394-202ENST00000394177 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.46■■■■□ 3.11
ZNF394-202ENST00000394177 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
ZNF394-202ENST00000394177 CUX2O14529 1486 aa34.35■■■■□ 3.09
ZNF394-202ENST00000394177 ABCC8Q09428 1581 aa34.34■■■■□ 3.09
ZNF394-202ENST00000394177 WDR62O43379 1518 aa34.33■■■■□ 3.09
ZNF394-202ENST00000394177 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
ZNF394-202ENST00000394177 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.17■■■■□ 3.06
ZNF394-202ENST00000394177 TOPBP1Q92547 1522 aa34.17■■■■□ 3.06
ZNF394-202ENST00000394177 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.05■■■■□ 3.04
ZNF394-202ENST00000394177 CUX1P39880 1505 aa34.04■■■■□ 3.04
ZNF394-202ENST00000394177 TOP2BQ02880 1626 aa33.92■■■■□ 3.02
ZNF394-202ENST00000394177 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
ZNF394-202ENST00000394177 IFT140Q96RY7 1462 aa33.9■■■■□ 3.02
ZNF394-202ENST00000394177 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.88■■■■□ 3.01
ZNF394-202ENST00000394177 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.87■■■■□ 3.01
ZNF394-202ENST00000394177 SYNJ1O43426 1573 aa33.84■■■■□ 3.01
ZNF394-202ENST00000394177 SOGA1O94964 1423 aa33.83■■■■□ 3.01
ZNF394-202ENST00000394177 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ZNF394-202ENST00000394177 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.69■■■□□ 2.98
ZNF394-202ENST00000394177 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.64■■■□□ 2.98
ZNF394-202ENST00000394177 WDR97A6NE52 1622 aa33.64■■■□□ 2.98
ZNF394-202ENST00000394177 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
ZNF394-202ENST00000394177 TRIM41Q8WV44 630 aa33.58■■■□□ 2.97
ZNF394-202ENST00000394177 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
ZNF394-202ENST00000394177 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.5■■■□□ 2.951e-7■■■■■ 43.7
ZNF394-202ENST00000394177 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
ZNF394-202ENST00000394177 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.45■■■□□ 2.95
ZNF394-202ENST00000394177 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.42■■■□□ 2.94
ZNF394-202ENST00000394177 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.39■■■□□ 2.93
ZNF394-202ENST00000394177 GRIN2BQ13224 1484 aa33.38■■■□□ 2.93
ZNF394-202ENST00000394177 KIF27Q86VH2 1401 aa33.35■■■□□ 2.93
ZNF394-202ENST00000394177 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.92
ZNF394-202ENST00000394177 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.26■■■□□ 2.91
ZNF394-202ENST00000394177 PBRM1Q86U86 1689 aa33.2■■■□□ 2.91
ZNF394-202ENST00000394177 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.18■■■□□ 2.9
ZNF394-202ENST00000394177 IGF1RP08069 1367 aa33.17■■■□□ 2.9
ZNF394-202ENST00000394177 SYNJ2O15056 1496 aa33.11■■■□□ 2.89
ZNF394-202ENST00000394177 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.09■■■□□ 2.89
ZNF394-202ENST00000394177 EEA1Q15075 1411 aa33.09■■■□□ 2.89
ZNF394-202ENST00000394177 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
ZNF394-202ENST00000394177 OSCARQ8IYS5 282 aa33.04■■■□□ 2.88
ZNF394-202ENST00000394177 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.02■■■□□ 2.88
ZNF394-202ENST00000394177 ADAMTS12P58397 1594 aa33.01■■■□□ 2.88
ZNF394-202ENST00000394177 CUL7Q14999 1698 aa32.99■■■□□ 2.87
ZNF394-202ENST00000394177 FBLN2P98095 1184 aa32.99■■■□□ 2.87
ZNF394-202ENST00000394177 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.97■■■□□ 2.87
ZNF394-202ENST00000394177 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.93■■■□□ 2.86
ZNF394-202ENST00000394177 CHD1O14646 1710 aa32.92■■■□□ 2.86
ZNF394-202ENST00000394177 GRIN2AQ12879 1464 aa32.92■■■□□ 2.86
ZNF394-202ENST00000394177 PRXQ9BXM0 1461 aa32.81■■■□□ 2.84
ZNF394-202ENST00000394177 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.8■■■□□ 2.84
ZNF394-202ENST00000394177 NUP160Q12769 1436 aa32.79■■■□□ 2.84
ZNF394-202ENST00000394177 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
ZNF394-202ENST00000394177 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.67■■■□□ 2.82
ZNF394-202ENST00000394177 CEP170Q5SW79 1584 aa32.66■■■□□ 2.82
ZNF394-202ENST00000394177 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.62■■■□□ 2.81
ZNF394-202ENST00000394177 KIF21BO75037 1637 aa32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms