RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316824.3

ALX1-201, Transcript of ALX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALX1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1-201ENST00000316824 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.34■■■□□ 2.45
ALX1-201ENST00000316824 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
ALX1-201ENST00000316824 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.28■■■□□ 2.12
ALX1-201ENST00000316824 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.71■■□□□ 1.87
ALX1-201ENST00000316824 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ALX1-201ENST00000316824 ABCC9O60706 1549 aa25.23■■□□□ 1.63
ALX1-201ENST00000316824 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.2■■□□□ 1.62
ALX1-201ENST00000316824 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.02■■□□□ 1.6
ALX1-201ENST00000316824 NACADO15069 1562 aa24.89■■□□□ 1.57
ALX1-201ENST00000316824 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.88■■□□□ 1.57
ALX1-201ENST00000316824 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ALX1-201ENST00000316824 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ALX1-201ENST00000316824 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.72■■□□□ 1.55
ALX1-201ENST00000316824 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.37■■□□□ 1.49
ALX1-201ENST00000316824 SCRIBQ14160 1630 aa24.37■■□□□ 1.49
ALX1-201ENST00000316824 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.15■■□□□ 1.46
ALX1-201ENST00000316824 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.89■■□□□ 1.41
ALX1-201ENST00000316824 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
ALX1-201ENST00000316824 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ALX1-201ENST00000316824 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.48■■□□□ 1.35
ALX1-201ENST00000316824 SMARCA4P51532 1647 aa23.41■■□□□ 1.34
ALX1-201ENST00000316824 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
ALX1-201ENST00000316824 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.37■■□□□ 1.33
ALX1-201ENST00000316824 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ALX1-201ENST00000316824 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ALX1-201ENST00000316824 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.19■■□□□ 1.3
ALX1-201ENST00000316824 WIZO95785 1651 aa23.17■■□□□ 1.3
ALX1-201ENST00000316824 SMARCA2P51531 1590 aa23.11■■□□□ 1.29
ALX1-201ENST00000316824 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ALX1-201ENST00000316824 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.03■■□□□ 1.28
ALX1-201ENST00000316824 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.98■■□□□ 1.27
ALX1-201ENST00000316824 HMGXB3Q12766 1538 aa22.94■■□□□ 1.26
ALX1-201ENST00000316824 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ALX1-201ENST00000316824 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.91■■□□□ 1.26
ALX1-201ENST00000316824 NCAPD3P42695 1498 aa22.9■■□□□ 1.26
ALX1-201ENST00000316824 FOXD1Q16676 465 aa22.89■■□□□ 1.25
ALX1-201ENST00000316824 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.68■■□□□ 1.22
ALX1-201ENST00000316824 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.34■■□□□ 1.17
ALX1-201ENST00000316824 CFTRP13569 1480 aa22.33■■□□□ 1.16
ALX1-201ENST00000316824 PRDM2Q13029 1718 aa22.32■■□□□ 1.16
ALX1-201ENST00000316824 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.26■■□□□ 1.15
ALX1-201ENST00000316824 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.23■■□□□ 1.15
ALX1-201ENST00000316824 ABCC8Q09428 1581 aa22.1■■□□□ 1.13
ALX1-201ENST00000316824 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
ALX1-201ENST00000316824 NESP48681 1621 aa22.06■■□□□ 1.12
ALX1-201ENST00000316824 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.03■■□□□ 1.12
ALX1-201ENST00000316824 TRIM41Q8WV44 630 aa22.03■■□□□ 1.12
ALX1-201ENST00000316824 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.02■■□□□ 1.11
ALX1-201ENST00000316824 SYNJ1O43426 1573 aa21.97■■□□□ 1.11
ALX1-201ENST00000316824 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.97■■□□□ 1.11
ALX1-201ENST00000316824 TOP2BQ02880 1626 aa21.96■■□□□ 1.11
ALX1-201ENST00000316824 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.96■■□□□ 1.11
ALX1-201ENST00000316824 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.9■■□□□ 1.1
ALX1-201ENST00000316824 CUX1P39880 1505 aa21.9■■□□□ 1.1
ALX1-201ENST00000316824 ADRA2BP18089 450 aa21.89■■□□□ 1.09
ALX1-201ENST00000316824 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.89■■□□□ 1.09
ALX1-201ENST00000316824 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.85■■□□□ 1.09
ALX1-201ENST00000316824 TOPBP1Q92547 1522 aa21.77■■□□□ 1.08
ALX1-201ENST00000316824 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.76■■□□□ 1.07
ALX1-201ENST00000316824 ERCC6Q03468 1493 aa21.75■■□□□ 1.07
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ALX1-201ENST00000316824 EEA1Q15075 1411 aa21.71■■□□□ 1.07
ALX1-201ENST00000316824 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.7■■□□□ 1.06
ALX1-201ENST00000316824 WDR62O43379 1518 aa21.67■■□□□ 1.06
ALX1-201ENST00000316824 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ALX1-201ENST00000316824 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ALX1-201ENST00000316824 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ALX1-201ENST00000316824 SOGA1O94964 1423 aa21.61■■□□□ 1.05
ALX1-201ENST00000316824 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.55■■□□□ 1.04
ALX1-201ENST00000316824 KIF27Q86VH2 1401 aa21.55■■□□□ 1.04
ALX1-201ENST00000316824 WDR97A6NE52 1622 aa21.55■■□□□ 1.04
ALX1-201ENST00000316824 CUX2O14529 1486 aa21.5■■□□□ 1.03
ALX1-201ENST00000316824 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.5■■□□□ 1.03
ALX1-201ENST00000316824 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ALX1-201ENST00000316824 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.49■■□□□ 1.03
ALX1-201ENST00000316824 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ALX1-201ENST00000316824 IFT140Q96RY7 1462 aa21.45■■□□□ 1.03
ALX1-201ENST00000316824 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.44■■□□□ 1.02
ALX1-201ENST00000316824 KIF21BO75037 1637 aa21.43■■□□□ 1.02
ALX1-201ENST00000316824 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.43■■□□□ 1.02
ALX1-201ENST00000316824 GOLGA3Q08378 1498 aa21.35■■□□□ 1.01
ALX1-201ENST00000316824 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
ALX1-201ENST00000316824 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.33■■□□□ 1.01
ALX1-201ENST00000316824 PRXQ9BXM0 1461 aa21.33■■□□□ 1.01
ALX1-201ENST00000316824 CUL7Q14999 1698 aa21.32■■□□□ 1
ALX1-201ENST00000316824 PBRM1Q86U86 1689 aa21.29■■□□□ 1
ALX1-201ENST00000316824 IGF1RP08069 1367 aa21.29■■□□□ 1
ALX1-201ENST00000316824 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
ALX1-201ENST00000316824 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.27■■□□□ 1
ALX1-201ENST00000316824 MSH5O43196 834 aa21.27■■□□□ 1
ALX1-201ENST00000316824 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
ALX1-201ENST00000316824 GRIN2BQ13224 1484 aa21.23■□□□□ 0.99
ALX1-201ENST00000316824 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.23■□□□□ 0.99
ALX1-201ENST00000316824 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
ALX1-201ENST00000316824 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.21■□□□□ 0.99
ALX1-201ENST00000316824 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
ALX1-201ENST00000316824 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.18■□□□□ 0.98
ALX1-201ENST00000316824 ADAMTS12P58397 1594 aa21.16■□□□□ 0.98
ALX1-201ENST00000316824 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ALX1-201ENST00000316824 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.12■□□□□ 0.97
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