RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308268.10

PSMA8-201, Transcript of proteasome subunit alpha 8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA8, Length 1,804 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA8-201ENST00000308268 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.92■■□□□ 1.74
PSMA8-201ENST00000308268 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PSMA8-201ENST00000308268 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.4■■□□□ 1.34
PSMA8-201ENST00000308268 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.76■■□□□ 1.23
PSMA8-201ENST00000308268 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PSMA8-201ENST00000308268 ABCC9O60706 1549 aa21.62■■□□□ 1.05
PSMA8-201ENST00000308268 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.47■■□□□ 1.03
PSMA8-201ENST00000308268 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PSMA8-201ENST00000308268 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA8-201ENST00000308268 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.32■■□□□ 1
PSMA8-201ENST00000308268 NACADO15069 1562 aa21.23■□□□□ 0.99
PSMA8-201ENST00000308268 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.09■□□□□ 0.97
PSMA8-201ENST00000308268 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PSMA8-201ENST00000308268 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.85■□□□□ 0.93
PSMA8-201ENST00000308268 SCRIBQ14160 1630 aa20.81■□□□□ 0.92
PSMA8-201ENST00000308268 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.72■□□□□ 0.91
PSMA8-201ENST00000308268 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.47■□□□□ 0.87
PSMA8-201ENST00000308268 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PSMA8-201ENST00000308268 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.12■□□□□ 0.81
PSMA8-201ENST00000308268 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PSMA8-201ENST00000308268 FOXD1Q16676 465 aa20.01■□□□□ 0.79
PSMA8-201ENST00000308268 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.99■□□□□ 0.79
PSMA8-201ENST00000308268 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PSMA8-201ENST00000308268 SMARCA4P51532 1647 aa19.98■□□□□ 0.79
PSMA8-201ENST00000308268 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PSMA8-201ENST00000308268 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PSMA8-201ENST00000308268 WIZO95785 1651 aa19.83■□□□□ 0.77
PSMA8-201ENST00000308268 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.78■□□□□ 0.76
PSMA8-201ENST00000308268 SMARCA2P51531 1590 aa19.69■□□□□ 0.74
PSMA8-201ENST00000308268 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.69■□□□□ 0.74
PSMA8-201ENST00000308268 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PSMA8-201ENST00000308268 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.62■□□□□ 0.73
PSMA8-201ENST00000308268 NCAPD3P42695 1498 aa19.58■□□□□ 0.73
PSMA8-201ENST00000308268 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
PSMA8-201ENST00000308268 HMGXB3Q12766 1538 aa19.54■□□□□ 0.72
PSMA8-201ENST00000308268 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.39■□□□□ 0.69
PSMA8-201ENST00000308268 POTEDQ86YR6 584 aa19.34■□□□□ 0.69
PSMA8-201ENST00000308268 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.28■□□□□ 0.68
PSMA8-201ENST00000308268 CFTRP13569 1480 aa19.08■□□□□ 0.64
PSMA8-201ENST00000308268 PRDM2Q13029 1718 aa19.04■□□□□ 0.64
PSMA8-201ENST00000308268 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.04■□□□□ 0.64
PSMA8-201ENST00000308268 MSH5O43196 834 aa18.98■□□□□ 0.63
PSMA8-201ENST00000308268 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.96■□□□□ 0.63
PSMA8-201ENST00000308268 NESP48681 1621 aa18.93■□□□□ 0.62
PSMA8-201ENST00000308268 ABCC8Q09428 1581 aa18.9■□□□□ 0.62
PSMA8-201ENST00000308268 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.82■□□□□ 0.6
PSMA8-201ENST00000308268 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
PSMA8-201ENST00000308268 TRIM41Q8WV44 630 aa18.81■□□□□ 0.6
PSMA8-201ENST00000308268 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.79■□□□□ 0.6
PSMA8-201ENST00000308268 SYNJ1O43426 1573 aa18.77■□□□□ 0.59
PSMA8-201ENST00000308268 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.75■□□□□ 0.59
PSMA8-201ENST00000308268 TOP2BQ02880 1626 aa18.73■□□□□ 0.59
PSMA8-201ENST00000308268 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.73■□□□□ 0.59
PSMA8-201ENST00000308268 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.73■□□□□ 0.59
PSMA8-201ENST00000308268 CUX1P39880 1505 aa18.71■□□□□ 0.59
PSMA8-201ENST00000308268 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.63■□□□□ 0.57
PSMA8-201ENST00000308268 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PSMA8-201ENST00000308268 TOPBP1Q92547 1522 aa18.6■□□□□ 0.57
PSMA8-201ENST00000308268 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PSMA8-201ENST00000308268 ERCC6Q03468 1493 aa18.56■□□□□ 0.56
PSMA8-201ENST00000308268 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.56■□□□□ 0.56
PSMA8-201ENST00000308268 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.53■□□□□ 0.56
PSMA8-201ENST00000308268 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PSMA8-201ENST00000308268 WDR62O43379 1518 aa18.5■□□□□ 0.55
PSMA8-201ENST00000308268 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PSMA8-201ENST00000308268 SOGA1O94964 1423 aa18.48■□□□□ 0.55
PSMA8-201ENST00000308268 EEA1Q15075 1411 aa18.44■□□□□ 0.54
PSMA8-201ENST00000308268 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.43■□□□□ 0.54
PSMA8-201ENST00000308268 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PSMA8-201ENST00000308268 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.39■□□□□ 0.54
PSMA8-201ENST00000308268 WDR97A6NE52 1622 aa18.39■□□□□ 0.53
PSMA8-201ENST00000308268 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.39■□□□□ 0.53
PSMA8-201ENST00000308268 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.38■□□□□ 0.53
PSMA8-201ENST00000308268 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PSMA8-201ENST00000308268 CUX2O14529 1486 aa18.37■□□□□ 0.53
PSMA8-201ENST00000308268 KIF27Q86VH2 1401 aa18.37■□□□□ 0.53
PSMA8-201ENST00000308268 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.33■□□□□ 0.52
PSMA8-201ENST00000308268 IFT140Q96RY7 1462 aa18.3■□□□□ 0.52
PSMA8-201ENST00000308268 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.3■□□□□ 0.52
PSMA8-201ENST00000308268 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.28■□□□□ 0.52
PSMA8-201ENST00000308268 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.26■□□□□ 0.51
PSMA8-201ENST00000308268 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PSMA8-201ENST00000308268 KIF21BO75037 1637 aa18.23■□□□□ 0.51
PSMA8-201ENST00000308268 IGF1RP08069 1367 aa18.23■□□□□ 0.51
PSMA8-201ENST00000308268 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.22■□□□□ 0.51
PSMA8-201ENST00000308268 ADRA2BP18089 450 aa18.21■□□□□ 0.51
PSMA8-201ENST00000308268 PRXQ9BXM0 1461 aa18.2■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.18■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 PBRM1Q86U86 1689 aa18.17■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 CUL7Q14999 1698 aa18.15■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 GOLGA3Q08378 1498 aa18.15■□□□□ 0.5
PSMA8-201ENST00000308268 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.13■□□□□ 0.49
PSMA8-201ENST00000308268 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.12■□□□□ 0.49
PSMA8-201ENST00000308268 GRIN2BQ13224 1484 aa18.11■□□□□ 0.49
PSMA8-201ENST00000308268 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.11■□□□□ 0.49
PSMA8-201ENST00000308268 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.05■□□□□ 0.48
PSMA8-201ENST00000308268 ADAMTS12P58397 1594 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms