RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304552.4

CXCR6-201, Transcript of C-X-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCR6, Length 1,962 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CXCR6-201ENST00000304552 SMARCA2P51531 1590 aa14□□□□□ -0.17
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CXCR6-201ENST00000304552 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
CXCR6-201ENST00000304552 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CXCR6-201ENST00000304552 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.67□□□□□ -0.22
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CXCR6-201ENST00000304552 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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CXCR6-201ENST00000304552 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.53□□□□□ -0.24
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CXCR6-201ENST00000304552 TOP2BQ02880 1626 aa13.49□□□□□ -0.25
CXCR6-201ENST00000304552 CFTRP13569 1480 aa13.49□□□□□ -0.25
CXCR6-201ENST00000304552 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.45□□□□□ -0.26
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CXCR6-201ENST00000304552 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.45□□□□□ -0.26
CXCR6-201ENST00000304552 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.44□□□□□ -0.26
CXCR6-201ENST00000304552 CUX1P39880 1505 aa13.42□□□□□ -0.26
CXCR6-201ENST00000304552 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.4□□□□□ -0.26
CXCR6-201ENST00000304552 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.34□□□□□ -0.27
CXCR6-201ENST00000304552 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CXCR6-201ENST00000304552 PRXQ9BXM0 1461 aa13.34□□□□□ -0.27
CXCR6-201ENST00000304552 CLIP1P30622 1438 aa13.33□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 NESP48681 1621 aa13.3□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.29□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.28□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 KIF27Q86VH2 1401 aa13.28□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 PRDM2Q13029 1718 aa13.27□□□□□ -0.28
CXCR6-201ENST00000304552 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.27□□□□□ -0.29
CXCR6-201ENST00000304552 CUX2O14529 1486 aa13.23□□□□□ -0.29
CXCR6-201ENST00000304552 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.22□□□□□ -0.29
CXCR6-201ENST00000304552 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
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CXCR6-201ENST00000304552 ARAP1Q96P48 1450 aa13.19□□□□□ -0.3
CXCR6-201ENST00000304552 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.15□□□□□ -0.3
CXCR6-201ENST00000304552 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.15□□□□□ -0.3
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CXCR6-201ENST00000304552 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.13□□□□□ -0.31
CXCR6-201ENST00000304552 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CXCR6-201ENST00000304552 APLP2Q06481 763 aa13.12□□□□□ -0.31
CXCR6-201ENST00000304552 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.12□□□□□ -0.31
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CXCR6-201ENST00000304552 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.06□□□□□ -0.32
CXCR6-201ENST00000304552 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CXCR6-201ENST00000304552 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CXCR6-201ENST00000304552 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CXCR6-201ENST00000304552 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13□□□□□ -0.33
CXCR6-201ENST00000304552 P3H3Q8IVL6 736 aa12.99□□□□□ -0.33
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CXCR6-201ENST00000304552 WDR97A6NE52 1622 aa12.95□□□□□ -0.34
CXCR6-201ENST00000304552 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.95□□□□□ -0.34
CXCR6-201ENST00000304552 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CXCR6-201ENST00000304552 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.93□□□□□ -0.34
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