RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258774.9

HUS1-201, Transcript of HUS1 checkpoint clamp component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HUS1, Length 2,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HUS1-201ENST00000258774 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.67■□□□□ 0.26
HUS1-201ENST00000258774 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.9□□□□□ -0.02
HUS1-201ENST00000258774 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.03□□□□□ -0.16
HUS1-201ENST00000258774 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
HUS1-201ENST00000258774 MYO15BQ96JP2 1530 aa13.98□□□□□ -0.17
HUS1-201ENST00000258774 NACADO15069 1562 aa13.79□□□□□ -0.2
HUS1-201ENST00000258774 ABCC9O60706 1549 aa13.69□□□□□ -0.22
HUS1-201ENST00000258774 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa13.65□□□□□ -0.22
HUS1-201ENST00000258774 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.43□□□□□ -0.26
HUS1-201ENST00000258774 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.35□□□□□ -0.27
HUS1-201ENST00000258774 SCRIBQ14160 1630 aa13.28□□□□□ -0.28
HUS1-201ENST00000258774 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.22□□□□□ -0.29
HUS1-201ENST00000258774 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HUS1-201ENST00000258774 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.13□□□□□ -0.31
HUS1-201ENST00000258774 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HUS1-201ENST00000258774 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.91□□□□□ -0.34
HUS1-201ENST00000258774 SMARCA4P51532 1647 aa12.89□□□□□ -0.35
HUS1-201ENST00000258774 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.83□□□□□ -0.36
HUS1-201ENST00000258774 HRCP23327 699 aa12.78□□□□□ -0.36
HUS1-201ENST00000258774 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HUS1-201ENST00000258774 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.77□□□□□ -0.36
HUS1-201ENST00000258774 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.77□□□□□ -0.37
HUS1-201ENST00000258774 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.76□□□□□ -0.37
HUS1-201ENST00000258774 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.76□□□□□ -0.37
HUS1-201ENST00000258774 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HUS1-201ENST00000258774 SMARCA2P51531 1590 aa12.74□□□□□ -0.37
HUS1-201ENST00000258774 HMGXB3Q12766 1538 aa12.71□□□□□ -0.37
HUS1-201ENST00000258774 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.68□□□□□ -0.38
HUS1-201ENST00000258774 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.68□□□□□ -0.38
HUS1-201ENST00000258774 WIZO95785 1651 aa12.67□□□□□ -0.38
HUS1-201ENST00000258774 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HUS1-201ENST00000258774 NCAPD3P42695 1498 aa12.63□□□□□ -0.39
HUS1-201ENST00000258774 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.63□□□□□ -0.39
HUS1-201ENST00000258774 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.61□□□□□ -0.39
HUS1-201ENST00000258774 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
HUS1-201ENST00000258774 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
HUS1-201ENST00000258774 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.5□□□□□ -0.41
HUS1-201ENST00000258774 PRDM2Q13029 1718 aa12.49□□□□□ -0.41
HUS1-201ENST00000258774 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.38□□□□□ -0.43
HUS1-201ENST00000258774 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
HUS1-201ENST00000258774 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.3□□□□□ -0.44
HUS1-201ENST00000258774 CFTRP13569 1480 aa12.27□□□□□ -0.44
HUS1-201ENST00000258774 TRIM41Q8WV44 630 aa12.18□□□□□ -0.46
HUS1-201ENST00000258774 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.17□□□□□ -0.46
HUS1-201ENST00000258774 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.17□□□□□ -0.46
HUS1-201ENST00000258774 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HUS1-201ENST00000258774 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HUS1-201ENST00000258774 TOP2BQ02880 1626 aa12.09□□□□□ -0.47
HUS1-201ENST00000258774 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.08□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.07□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 ABCC8Q09428 1581 aa12.06□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 SLC24A1O60721 1099 aa12.06□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.05□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.04□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.03□□□□□ -0.48
HUS1-201ENST00000258774 WDR97A6NE52 1622 aa12.01□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 SYNJ1O43426 1573 aa12□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 CEP164Q9UPV0 1460 aa12□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 WDR62O43379 1518 aa12□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 NESP48681 1621 aa11.99□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 CUX1P39880 1505 aa11.99□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
HUS1-201ENST00000258774 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.96□□□□□ -0.5
HUS1-201ENST00000258774 CUX2O14529 1486 aa11.95□□□□□ -0.5
HUS1-201ENST00000258774 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HUS1-201ENST00000258774 TOPBP1Q92547 1522 aa11.93□□□□□ -0.5
HUS1-201ENST00000258774 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HUS1-201ENST00000258774 EEA1Q15075 1411 aa11.89□□□□□ -0.51
HUS1-201ENST00000258774 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HUS1-201ENST00000258774 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HUS1-201ENST00000258774 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HUS1-201ENST00000258774 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.85□□□□□ -0.51
HUS1-201ENST00000258774 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.84□□□□□ -0.51
HUS1-201ENST00000258774 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.83□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 IFT140Q96RY7 1462 aa11.8□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 ERCC6Q03468 1493 aa11.79□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 KIF21BO75037 1637 aa11.79□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 CUL7Q14999 1698 aa11.78□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 PBRM1Q86U86 1689 aa11.78□□□□□ -0.52
HUS1-201ENST00000258774 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.76□□□□□ -0.53
HUS1-201ENST00000258774 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HUS1-201ENST00000258774 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HUS1-201ENST00000258774 NEUROD1Q13562 356 aa11.72□□□□□ -0.53
HUS1-201ENST00000258774 KIF27Q86VH2 1401 aa11.71□□□□□ -0.53
HUS1-201ENST00000258774 SOGA1O94964 1423 aa11.71□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 CEP162Q5TB80 1403 aa11.67□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 PRXQ9BXM0 1461 aa11.67□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 ADAMTS12P58397 1594 aa11.66□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.65□□□□□ -0.54
HUS1-201ENST00000258774 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.63□□□□□ -0.55
HUS1-201ENST00000258774 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HUS1-201ENST00000258774 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.63□□□□□ -0.55
HUS1-201ENST00000258774 GRIN2BQ13224 1484 aa11.62□□□□□ -0.55
HUS1-201ENST00000258774 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HUS1-201ENST00000258774 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms