RNA–Protein interactions for RNA: YNL235C

YNL235C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL235C, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL235C	YNL235C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	ALT1	P52893	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	SPR28	Q04921	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	MCM2	P29469	868 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	PIC2	P40035	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	VPS53	P47061	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	YGR130C	P53278	816 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	SVF1	Q05515	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	EST2	Q06163	884 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL235C	YNL235C	CYC7	P00045	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	PET112	P33893	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	MAC1	P35192	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	OMA1	P36163	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	TOS1	P38288	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	SIW14	P53965	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	RCM1	P53972	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	MRL1	Q06815	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	RAD27	P26793	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	MNR2	P35724	969 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	YNR063W	P53749	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	HDA2	Q06629	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	TRP3	P00937	484 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	CLN2	P20438	545 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	YKR073C	P36153	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	TPP1	Q03796	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	LIP5	P32875	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	INP52	P50942	1183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
YNL235C	YNL235C	YVC1	Q12324	675 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	PTC5	Q12511	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	GCR1	P07261	785 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	GNP1	P48813	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	ROD1	Q02805	837 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	TRE1	Q08919	783 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL235C	YNL235C	MKK2	P32491	506 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	ALG3	P38179	458 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	YHL012W	P38709	493 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	COQ4	O13525	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	CDC34	P14682	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	ADP1	P25371	1049 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	AFG2	P32794	780 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	MDL2	P33311	773 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	RGD1	P38339	666 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	MET10	P39692	1035 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	HXT13	P39924	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	YJL045W	P47052	634 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	HXT17	P53631	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	HXT15	P54854	567 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	EAR1	Q03212	550 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	CCZ1	P38273	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	MAD1	P40957	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	CNN1	P43618	361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	HNT2	P49775	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	KIP1	P28742	1111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	PRO1	P32264	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	YSC84	P32793	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SDH1	Q00711	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SPO21	Q12411	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	PEX7	P39108	375 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	TNA1	P53322	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SPO20	Q04359	397 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	SAM35	P14693	329 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
YNL235C	YNL235C	LYP1	P32487	611 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	RER2	P35196	286 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	PTC7	P38797	343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	CTH1	P47976	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.3 ms