RNA–Protein interactions for RNA: YLR018C

POM34, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene POM34, Length 900 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POM34	YLR018C	YJL007C	P47080	104 aa		11.23	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	YML037C	Q03703	340 aa		11.23	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	AIM44	Q99299	758 aa		11.23	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	SEC20	P28791	383 aa		11.22	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	NDT80	P38830	627 aa		11.22	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	RAD18	P10862	487 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	CLC1	P17891	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.21	□□□□□ -0.61	not detected
POM34	YLR018C	FAR11	P53917	953 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	TRS120	Q04183	1289 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	TIP41	Q12199	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	PTC5	Q12511	572 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POM34	YLR018C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	RPN12	P32496	274 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	SAS3	P34218	831 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	FMS1	P50264	508 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	YOR296W	Q08748	1289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	PER1	P25625	357 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	VAB2	P40003	282 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	RET3	P53600	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	DSE4	P53753	1117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	CSM3	Q04659	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	OXR1	Q08952	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	TRS33	Q99394	268 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	UBX5	Q06682	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	GPA1	P08539	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	MCD4	P36051	919 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	PAN5	P38787	379 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	ORC6	P38826	435 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	CIT3	P43635	486 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	RTC4	P53850	401 aa		11.17	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	ALG1	P16661	449 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	SUL1	P38359	859 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	YER130C	P39959	443 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	YPT11	P48559	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	RSC1	P53236	928 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	YGR273C	P53329	174 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	MMR1	Q06324	491 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	HVG1	P0CE11	249 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	NPR3	P38742	1146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	NET1	P47035	1189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	JIP4	Q03361	876 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	AIM33	Q04516	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	RKM4	Q12504	494 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POM34	YLR018C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.14	□□□□□ -0.63	not detected
POM34	YLR018C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	TGL1	P34163	548 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	BSD2	P38356	321 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SGD1	Q06132	899 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	MYO1	P08964	1928 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	IXR1	P33417	597 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	ATG32	P40458	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	LIF1	P53150	421 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	GSY1	P23337	708 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	UTR4	P32626	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	UGA4	P32837	571 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	GAA1	P39012	614 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	RBA50	Q04418	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SPH1	Q06160	661 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	PSR2	Q07949	397 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	ARP6	Q12509	438 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	CDC15	P27636	974 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SHP1	P34223	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	RKM3	P38222	552 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	DAK2	P43550	591 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	YGR153W	P48238	217 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	UBA2	P52488	636 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POM34	YLR018C	ASH1	P34233	588 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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