RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYS1	YJL004C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYS1	YJL004C	PEX13	P80667	386 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYS1	YJL004C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
SYS1	YJL004C	OXR1	Q08952	273 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SYS1	YJL004C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	YCR015C	P25616	317 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	MDL2	P33311	773 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	YKL222C	P35995	705 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.51	□□□□□ -1.53	not detected
SYS1	YJL004C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	ULP1	Q02724	621 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	RKM2	Q03942	479 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	DAL4	Q04895	635 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	ESC8	Q08119	714 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	SAM35	P14693	329 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	VPS53	P47061	822 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	MRPL22	P53881	309 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	PEX28	P38848	579 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	UGA4	P32837	571 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	THI80	P35202	319 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	ADD66	P36040	267 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	DAK2	P43550	591 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	RIM8	P53179	542 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	ENV11	P53246	860 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	YNR063W	P53749	607 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	SNO2	P53823	222 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	ADI1	Q03677	179 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SYS1	YJL004C	MET4	P32389	672 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	RDH54	P38086	958 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	YJL045W	P47052	634 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	SEC20	P28791	383 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	AIM26	P32858	118 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	GIP4	P39732	760 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	THI12	P42883	340 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	THI5	P43534	340 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	THI11	P47183	340 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
SYS1	YJL004C	YPL109C	Q02981	657 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	THI13	Q07748	340 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	COQ4	O13525	335 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	SOD2	P00447	233 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	TAF13	P11747	167 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	YSC84	P32793	468 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	CCZ1	P38273	704 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	TAF1	P46677	1066 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	EST2	Q06163	884 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	FLR1	P38124	548 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	RSC58	Q07979	502 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	SPS1	P08458	490 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	YOR352W	Q08816	343 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	WHI5	Q12416	295 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	FAA3	P39002	694 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	TOS4	Q06266	489 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	PTC5	Q12511	572 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYS1	YJL004C	TOD6	P34219	525 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	TNA1	P53322	534 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	HDA2	Q06629	674 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	MCD1	Q12158	566 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	KIP1	P28742	1111 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	AFG2	P32794	780 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	BAP2	P38084	609 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	ALG3	P38179	458 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	MRPS18	P42847	217 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	ENT3	P47160	408 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	HNT2	P49775	206 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	RSB1	Q08417	382 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	YLR358C	O13565	187 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	SLD2	P34252	453 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	PIK1	P39104	1066 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	PIC2	P40035	300 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	YGR122W	P53272	402 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.34	□□□□□ -1.55	not detected
SYS1	YJL004C	IPL1	P38991	367 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	GPB2	P39717	880 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	SGD1	Q06132	899 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYS1	YJL004C	SPO21	Q12411	609 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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