RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W CDC34P14682 295 aa5.39□□□□□ -1.55
THP2YHR167W GPT2P36148 743 aa5.39□□□□□ -1.55
THP2YHR167W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
THP2YHR167W EST2Q06163 884 aa5.39□□□□□ -1.55
THP2YHR167W RTT10Q08924 1013 aa5.39□□□□□ -1.55
THP2YHR167W PIN2Q12057 282 aa5.39□□□□□ -1.55
THP2YHR167W TRP3P00937 484 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W NAP1P25293 417 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W AFG2P32794 780 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W ADD66P36040 267 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W AKR1P39010 764 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W YAR028WP39548 234 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W ENT3P47160 408 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W RKM2Q03942 479 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W AVO1Q08236 1176 aa5.38□□□□□ -1.55
THP2YHR167W DED1P06634 604 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
THP2YHR167W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
THP2YHR167W COQ2P32378 372 aa5.37□□□□□ -1.55
THP2YHR167W MET10P39692 1035 aa5.37□□□□□ -1.55
THP2YHR167W YLR122CQ12312 125 aa5.37□□□□□ -1.55
THP2YHR167W CLN2P20438 545 aa5.36□□□□□ -1.55
THP2YHR167W MKK2P32491 506 aa5.36□□□□□ -1.55
THP2YHR167W MAD1P40957 749 aa5.36□□□□□ -1.55
THP2YHR167W FAA4P47912 694 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
THP2YHR167W EEB1Q02891 456 aa5.36□□□□□ -1.55
THP2YHR167W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.36□□□□□ -1.55not detected
THP2YHR167W SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
THP2YHR167W SAF1P38352 637 aa5.35□□□□□ -1.55
THP2YHR167W ALT1P52893 592 aa5.35□□□□□ -1.55
THP2YHR167W YNR063WP53749 607 aa5.35□□□□□ -1.55
THP2YHR167W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
THP2YHR167W GIC2Q06648 383 aa5.35□□□□□ -1.55
THP2YHR167W RER2P35196 286 aa5.34□□□□□ -1.55
THP2YHR167W NNK1P36003 928 aa5.34□□□□□ -1.55
THP2YHR167W TOS1P38288 455 aa5.34□□□□□ -1.55
THP2YHR167W ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
THP2YHR167W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
THP2YHR167W NFS1P25374 497 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W RAD27P26793 382 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W KAE1P36132 386 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W ALG3P38179 458 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W YGR053CP53234 283 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W EAR1Q03212 550 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W LAP2Q10740 671 aa5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
THP2YHR167W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W LIP5P32875 414 aa5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W ATG14P38270 344 aa5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W HSE1P38753 452 aa5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W GDE1Q02979 1223 aa5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.32□□□□□ -1.56not detected
THP2YHR167W MED7Q08278 222 aa5.32□□□□□ -1.56
THP2YHR167W DBP5P20449 482 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W VAC8P39968 578 aa5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W CNN1P43618 361 aa5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W VPS53P47061 822 aa5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W AVT1P47082 602 aa5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W YGR130CP53278 816 aa5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W PTC5Q12511 572 aa5.31□□□□□ -1.56
THP2YHR167W LYP1P32487 611 aa5.3□□□□□ -1.56
THP2YHR167W IRC24P40580 263 aa5.3□□□□□ -1.56
THP2YHR167W MMM1P41800 426 aa5.3□□□□□ -1.56
THP2YHR167W CTH1P47976 325 aa5.3□□□□□ -1.56
THP2YHR167W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
THP2YHR167W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
THP2YHR167W MPH1P40562 993 aa5.29□□□□□ -1.56
THP2YHR167W YJL045WP47052 634 aa5.29□□□□□ -1.56
THP2YHR167W CWC24P53769 259 aa5.29□□□□□ -1.56
THP2YHR167W TPP1Q03796 238 aa5.29□□□□□ -1.56
THP2YHR167W AOS1Q06624 347 aa5.29□□□□□ -1.56
THP2YHR167W CHS2P14180 963 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W KIP1P28742 1111 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W RGD1P38339 666 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W CIT3P43635 486 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W TYW3P53177 273 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W ESC2Q06340 456 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W YVC1Q12324 675 aa5.28□□□□□ -1.56
THP2YHR167W YKL069WP36088 180 aa5.27□□□□□ -1.57
THP2YHR167W GPB2P39717 880 aa5.27□□□□□ -1.57
THP2YHR167W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
THP2YHR167W INO1P11986 533 aa5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W PRI2P20457 528 aa5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W MLS1P30952 554 aa5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W MOT2P34909 587 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W HNT2P49775 206 aa5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W OPI10Q08202 246 aa5.26□□□□□ -1.57
THP2YHR167W YPL260WQ08977 551 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms