RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	YKR073C	P36153	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	OMA1	P36163	345 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	TOS1	P38288	455 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	LAP2	Q10740	671 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	NNK1	P36003	928 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	ADD66	P36040	267 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RDH54	P38086	958 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	CIT3	P43635	486 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RCM1	P53972	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	EAR1	Q03212	550 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	EST2	Q06163	884 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MRL1	Q06815	381 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	GCR1	P07261	785 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	LIP5	P32875	414 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	HSE1	P38753	452 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	ALT1	P52893	592 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	TPP1	Q03796	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	HDA2	Q06629	674 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	NSI1	Q12457	570 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	SDH1	Q00711	640 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	ROD1	Q02805	837 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	PET112	P33893	541 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	INP52	P50942	1183 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RKM2	Q03942	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	YVC1	Q12324	675 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	TAF13	P11747	167 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
YGL239C	YGL239C	AFG2	P32794	780 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	ALG3	P38179	458 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	VPS53	P47061	822 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SIW14	P53965	281 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	RMD1	Q03441	430 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	BRE4	Q07660	1125 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	PTC5	Q12511	572 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	RAD27	P26793	382 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	PRO1	P32264	428 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	MKK2	P32491	506 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	YJL045W	P47052	634 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	CTH1	P47976	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SSY1	Q03770	852 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	TRE1	Q08919	783 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	KIP1	P28742	1111 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SEA4	P38164	1038 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	YHL012W	P38709	493 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	PTC7	P38797	343 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	GPB2	P39717	880 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	HXT13	P39924	564 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	GTS1	P40956	396 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	GNP1	P48813	663 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	HXT17	P53631	564 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	HXT15	P54854	567 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	RTT10	Q08924	1013 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	ADP1	P25371	1049 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	RER2	P35196	286 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	PEX7	P39108	375 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	CDC34	P14682	295 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	MLS1	P30952	554 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	YSC84	P32793	468 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	MNR2	P35724	969 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	MCM7	P38132	845 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	MAD1	P40957	749 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	ENT3	P47160	408 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	CWC24	P53769	259 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SPO21	Q12411	609 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	SAM35	P14693	329 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	AIM26	P32858	118 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	DUT1	P33317	147 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	HSP78	P33416	811 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	CNN1	P43618	361 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.28	□□□□□ -1.88	not detected
YGL239C	YGL239C	AOS1	Q06624	347 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YGL239C	YGL239C	COQ4	O13525	335 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	CLN2	P20438	545 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.27	□□□□□ -1.89	not detected
YGL239C	YGL239C	MDL2	P33311	773 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89

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