RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ppp1r15aP17564 657 aa30■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rsph6aQ8CDR2 708 aa29,99■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PappaQ8R4K8 1624 aa29,99■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP29,98■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP29,98■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tns2Q8CGB6 1400 aa29,97■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MpripP97434 1024 aa29,97■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP29,96■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 IncenpQ9WU62 880 aa29,95■■■□□ 2,39
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Emilin1Q99K41 1017 aa29,94■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Igsf1Q7TQA1 1317 aa29,94■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa29,93■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm7361D3Z6R1 267 aa29,93■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa29,93■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm1979E9QAN3 267 aa29,93■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm5862K7N5V5 267 aa29,93■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm10220K7N660 267 aa29,93■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fchsd2Q3USJ8 740 aa29,91■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 ErfeQ6PGN1 340 aa29,89■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc5a1Q8C3K6 665 aa29,89■■■□□ 2,38
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crb1Q8VHS2 1405 aa29,88■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MeiocA2AG06 965 aa29,88■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc12a5Q91V14 1138 aa29,88■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Phkg2Q9DB30 406 aa29,88■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Asic4Q7TNS7 539 aa29,86■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa29,86■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29,85■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Bicdl1A0JNT9 577 aa29,85■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa29,83■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ints5Q8CHT3 1018 aa29,83■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ssfa2Q922B9 1252 aa29,83■■■□□ 2,37
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP29,82■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Jdp2P97875 163 aa29,82■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pdzd9Q9D9M4 266 aa29,82■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rad23bP54728 416 aa29,81■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plin1Q8CGN5 517 aa29,81■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP29,8■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hirip3Q8BLH7 601 aa29,8■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 P2rx7Q9Z1M0 595 aa29,8■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zfp777B9EKF4 885 aa29,79■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa29,79■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 HypkQ9CR41 129 aa29,78■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NppbP40753 121 aa29,77■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Amotl1Q9D4H4 968 aa29,77■■■□□ 2,36
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Chrna2Q91X60 512 aa29,76■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atg3Q9CPX6 314 aa29,76■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Msl1Q6PDM1 616 aa29,74■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col23a1Q8K4G2 532 aa29,74■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Chmp7Q8R1T1 451 aa29,74■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Aox2Q5SGK3 1345 aa29,73■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP29,72■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Prom2Q3UUY6 835 aa29,72■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP29,71■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm13023A2A8N2 498 aa29,71■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mcm10Q0VBD2 885 aa29,71■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 TnikP83510 1323 aa29,71■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Jmjd4Q8BFT6 427 aa29,7■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Egfem1Q8C088 590 aa29,7■■■□□ 2,35
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sumf1Q8R0F3 372 aa29,69■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP29,68■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ppef1O35655 650 aa29,68■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PalmQ9Z0P4 383 aa29,68■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dcaf5Q80T85 946 aa29,67■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ppm1fQ8CGA0 452 aa29,67■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sned1Q70E20 1403 aa29,66■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smarcc1P97496 1104 aa29,66■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Spata31d1bE9QA57 1361 aa29,65■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Magea6O89010 325 aa29,65■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zcwpw1Q6IR42 630 aa29,65■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Magea3Q6T340 320 aa29,65■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cap2Q9CYT6 476 aa29,65■■■□□ 2,34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sgip1Q8VD37 806 aa29,63■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nkx2-3P97334 362 aa29,62■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Miga2Q8BK03 593 aa29,62■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Usp21Q9QZL6 566 aa29,62■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrp5Q91VN0 1614 aa29,62■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa29,61■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rnf180Q3U827 592 aa29,6■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29,6■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa29,6■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sos1Q62245 1319 aa29,6■■■□□ 2,33
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc155Q80VJ8 648 aa29,57■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP29,57■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ric1Q69ZJ7 1422 aa29,56■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ubr3Q5U430 1889 aa29,56■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP29,54■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Stk31Q99MW1 1018 aa29,54■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Spef2Q8C9J3 1734 aa29,54■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29,53■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tsen2Q6P7W5 460 aa29,53■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa29,53■■■□□ 2,32
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29,51■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plch1Q4KWH5 1682 aa29,5■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Snap23O09044 210 aa29,5■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP29,5■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 C4bP01029 1738 aa29,49■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CpzQ8R4V4 654 aa29,49■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nlrp6Q91WS2 869 aa29,49■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col11a2Q64739 1736 aa29,48■■■□□ 2,31
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AceP09470 1312 aa29,47■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17,6 ms