Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
Prom2Q3UUY6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Prom2Q3UUY6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Prom2Q3UUY6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
Prom2Q3UUY6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Prom2Q3UUY6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Prom2Q3UUY6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Prom2Q3UUY6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Prom2Q3UUY6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Prom2Q3UUY6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Prom2Q3UUY6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Prom2Q3UUY6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Prom2Q3UUY6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Prom2Q3UUY6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Prom2Q3UUY6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Prom2Q3UUY6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Prom2Q3UUY6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Prom2Q3UUY6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Prom2Q3UUY6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Prom2Q3UUY6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Prom2Q3UUY6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
Prom2Q3UUY6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Prom2Q3UUY6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Prom2Q3UUY6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Prom2Q3UUY6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Prom2Q3UUY6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Prom2Q3UUY6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Prom2Q3UUY6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Prom2Q3UUY6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Prom2Q3UUY6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Prom2Q3UUY6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Prom2Q3UUY6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Prom2Q3UUY6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Prom2Q3UUY6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Prom2Q3UUY6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Prom2Q3UUY6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Prom2Q3UUY6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Prom2Q3UUY6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Prom2Q3UUY6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Prom2Q3UUY6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Prom2Q3UUY6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Prom2Q3UUY6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Prom2Q3UUY6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Prom2Q3UUY6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Prom2Q3UUY6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Prom2Q3UUY6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Prom2Q3UUY6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Prom2Q3UUY6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Prom2Q3UUY6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Prom2Q3UUY6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Prom2Q3UUY6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Prom2Q3UUY6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Prom2Q3UUY6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Prom2Q3UUY6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Prom2Q3UUY6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Prom2Q3UUY6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Prom2Q3UUY6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Prom2Q3UUY6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Prom2Q3UUY6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Prom2Q3UUY6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Prom2Q3UUY6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Prom2Q3UUY6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Prom2Q3UUY6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Prom2Q3UUY6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Prom2Q3UUY6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Prom2Q3UUY6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Prom2Q3UUY6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Prom2Q3UUY6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Prom2Q3UUY6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prom2Q3UUY6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prom2Q3UUY6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Prom2Q3UUY6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Prom2Q3UUY6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Prom2Q3UUY6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Prom2Q3UUY6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Prom2Q3UUY6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Prom2Q3UUY6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Prom2Q3UUY6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Prom2Q3UUY6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Prom2Q3UUY6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Prom2Q3UUY6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Prom2Q3UUY6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Prom2Q3UUY6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Prom2Q3UUY6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Prom2Q3UUY6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
Prom2Q3UUY6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Prom2Q3UUY6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prom2Q3UUY6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Prom2Q3UUY6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Prom2Q3UUY6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Prom2Q3UUY6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Prom2Q3UUY6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Prom2Q3UUY6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Prom2Q3UUY6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Prom2Q3UUY6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Prom2Q3UUY6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Prom2Q3UUY6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms