Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,39■■■■■ 5,66
Prom2Q3UUY6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46,95■■■■■ 5,11
Prom2Q3UUY6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,15■■■■■ 4,98
Prom2Q3UUY6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,06■■■■■ 4,64
Prom2Q3UUY6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,25■■■■■ 4,51
Prom2Q3UUY6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Prom2Q3UUY6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Prom2Q3UUY6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,26■■■■■ 4,36
Prom2Q3UUY6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,24■■■■■ 4,35
Prom2Q3UUY6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Prom2Q3UUY6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,91■■■■■ 4,3
Prom2Q3UUY6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,37■■■■■ 4,21
Prom2Q3UUY6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Prom2Q3UUY6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Prom2Q3UUY6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Prom2Q3UUY6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Prom2Q3UUY6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Prom2Q3UUY6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Prom2Q3UUY6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,13■■■■■ 4,02
Prom2Q3UUY6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,09■■■■■ 4,01
Prom2Q3UUY6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,01■■■■■ 4
Prom2Q3UUY6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Prom2Q3UUY6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Prom2Q3UUY6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Prom2Q3UUY6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Prom2Q3UUY6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Prom2Q3UUY6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Prom2Q3UUY6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,93■■■■□ 3,82
Prom2Q3UUY6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Prom2Q3UUY6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,65■■■■□ 3,78
Prom2Q3UUY6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Prom2Q3UUY6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Prom2Q3UUY6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,5■■■■□ 3,75
Prom2Q3UUY6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,41■■■■□ 3,74
Prom2Q3UUY6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Prom2Q3UUY6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Prom2Q3UUY6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Prom2Q3UUY6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,13■■■■□ 3,69
Prom2Q3UUY6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,13■■■■□ 3,69
Prom2Q3UUY6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Prom2Q3UUY6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Prom2Q3UUY6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,01■■■■□ 3,68
Prom2Q3UUY6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,99■■■■□ 3,67
Prom2Q3UUY6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,98■■■■□ 3,67
Prom2Q3UUY6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Prom2Q3UUY6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Prom2Q3UUY6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Prom2Q3UUY6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Prom2Q3UUY6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,73■■■■□ 3,63
Prom2Q3UUY6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Prom2Q3UUY6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,57■■■■□ 3,6
Prom2Q3UUY6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Prom2Q3UUY6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Prom2Q3UUY6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Prom2Q3UUY6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Prom2Q3UUY6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Prom2Q3UUY6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,22■■■■□ 3,55
Prom2Q3UUY6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Prom2Q3UUY6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Prom2Q3UUY6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Prom2Q3UUY6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Prom2Q3UUY6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,91■■■■□ 3,5
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Prom2Q3UUY6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Prom2Q3UUY6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Prom2Q3UUY6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Prom2Q3UUY6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Prom2Q3UUY6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Prom2Q3UUY6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Prom2Q3UUY6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Prom2Q3UUY6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Prom2Q3UUY6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Prom2Q3UUY6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,48■■■■□ 3,43
Prom2Q3UUY6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Prom2Q3UUY6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,46■■■■□ 3,43
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Prom2Q3UUY6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Prom2Q3UUY6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Prom2Q3UUY6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Prom2Q3UUY6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Prom2Q3UUY6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Prom2Q3UUY6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Prom2Q3UUY6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3,35
Prom2Q3UUY6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,99■■■■□ 3,35
Prom2Q3UUY6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Prom2Q3UUY6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Prom2Q3UUY6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,95■■■■□ 3,34
Prom2Q3UUY6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Prom2Q3UUY6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Prom2Q3UUY6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Prom2Q3UUY6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Prom2Q3UUY6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Prom2Q3UUY6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Prom2Q3UUY6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Prom2Q3UUY6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Prom2Q3UUY6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Prom2Q3UUY6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,72■■■■□ 3,31
Prom2Q3UUY6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Prom2Q3UUY6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms