Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN1

Erfe, Erythroferrone, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfeQ6PGN1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,64■■■■■ 5,7
ErfeQ6PGN1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,18■■■■■ 5,14
ErfeQ6PGN1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,43■■■■■ 5,02
ErfeQ6PGN1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,26■■■■■ 4,68
ErfeQ6PGN1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,48■■■■■ 4,55
ErfeQ6PGN1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
ErfeQ6PGN1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
ErfeQ6PGN1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
ErfeQ6PGN1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
ErfeQ6PGN1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,37
ErfeQ6PGN1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,18■■■■■ 4,34
ErfeQ6PGN1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,55■■■■■ 4,24
ErfeQ6PGN1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
ErfeQ6PGN1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,17■■■■■ 4,18
ErfeQ6PGN1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,07■■■■■ 4,17
ErfeQ6PGN1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
ErfeQ6PGN1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
ErfeQ6PGN1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
ErfeQ6PGN1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,36■■■■■ 4,05
ErfeQ6PGN1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,29■■■■■ 4,04
ErfeQ6PGN1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
ErfeQ6PGN1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
ErfeQ6PGN1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,44■■■■□ 3,9
ErfeQ6PGN1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
ErfeQ6PGN1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
ErfeQ6PGN1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
ErfeQ6PGN1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
ErfeQ6PGN1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
ErfeQ6PGN1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,91■■■■□ 3,82
ErfeQ6PGN1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38,9■■■■□ 3,82
ErfeQ6PGN1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
ErfeQ6PGN1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,72■■■■□ 3,79
ErfeQ6PGN1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
ErfeQ6PGN1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,47■■■■□ 3,75
ErfeQ6PGN1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,42■■■■□ 3,74
ErfeQ6PGN1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
ErfeQ6PGN1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,34■■■■□ 3,73
ErfeQ6PGN1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,26■■■■□ 3,72
ErfeQ6PGN1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,26■■■■□ 3,72
ErfeQ6PGN1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,25■■■■□ 3,71
ErfeQ6PGN1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
ErfeQ6PGN1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,18■■■■□ 3,7
ErfeQ6PGN1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
ErfeQ6PGN1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
ErfeQ6PGN1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,01■■■■□ 3,68
ErfeQ6PGN1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,99■■■■□ 3,67
ErfeQ6PGN1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
ErfeQ6PGN1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,95■■■■□ 3,67
ErfeQ6PGN1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,93■■■■□ 3,66
ErfeQ6PGN1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
ErfeQ6PGN1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,82■■■■□ 3,64
ErfeQ6PGN1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,8■■■■□ 3,64
ErfeQ6PGN1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
ErfeQ6PGN1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
ErfeQ6PGN1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
ErfeQ6PGN1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
ErfeQ6PGN1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,35■■■■□ 3,57
ErfeQ6PGN1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,33■■■■□ 3,57
ErfeQ6PGN1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
ErfeQ6PGN1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,21■■■■□ 3,55
ErfeQ6PGN1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
ErfeQ6PGN1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
ErfeQ6PGN1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
ErfeQ6PGN1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
ErfeQ6PGN1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
ErfeQ6PGN1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
ErfeQ6PGN1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,87■■■■□ 3,49
ErfeQ6PGN1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,85■■■■□ 3,49
ErfeQ6PGN1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
ErfeQ6PGN1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,47
ErfeQ6PGN1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
ErfeQ6PGN1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,69■■■■□ 3,46
ErfeQ6PGN1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,68■■■■□ 3,46
ErfeQ6PGN1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
ErfeQ6PGN1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
ErfeQ6PGN1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
ErfeQ6PGN1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
ErfeQ6PGN1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
ErfeQ6PGN1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,25■■■■□ 3,39
ErfeQ6PGN1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
ErfeQ6PGN1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,21■■■■□ 3,39
ErfeQ6PGN1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,2■■■■□ 3,39
ErfeQ6PGN1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
ErfeQ6PGN1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
ErfeQ6PGN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
ErfeQ6PGN1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,08■■■■□ 3,37
ErfeQ6PGN1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,36
ErfeQ6PGN1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,05■■■■□ 3,36
ErfeQ6PGN1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
ErfeQ6PGN1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
ErfeQ6PGN1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
ErfeQ6PGN1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
ErfeQ6PGN1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
ErfeQ6PGN1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms