Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,41■■■■■ 5,66
Nkx2-3P97334 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46,71■■■■■ 5,07
Nkx2-3P97334 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,87■■■■■ 4,93
Nkx2-3P97334 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43,87■■■■■ 4,61
Nkx2-3P97334 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,81■■■■■ 4,6
Nkx2-3P97334 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,97■■■■■ 4,47
Nkx2-3P97334 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Nkx2-3P97334 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Nkx2-3P97334 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Nkx2-3P97334 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
Nkx2-3P97334 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Nkx2-3P97334 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Nkx2-3P97334 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,93■■■■■ 4,3
Nkx2-3P97334 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,26■■■■■ 4,2
Nkx2-3P97334 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Nkx2-3P97334 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,92■■■■■ 4,14
Nkx2-3P97334 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Nkx2-3P97334 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,46■■■■■ 4,07
Nkx2-3P97334 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Nkx2-3P97334 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Nkx2-3P97334 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,35■■■■■ 4,05
Nkx2-3P97334 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Nkx2-3P97334 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Nkx2-3P97334 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Nkx2-3P97334 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Nkx2-3P97334 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Nkx2-3P97334 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39,94■■■■□ 3,98
Nkx2-3P97334 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Nkx2-3P97334 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Nkx2-3P97334 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,96
Nkx2-3P97334 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Nkx2-3P97334 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,64■■■■□ 3,94
Nkx2-3P97334 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,55■■■■□ 3,92
Nkx2-3P97334 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Nkx2-3P97334 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Nkx2-3P97334 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,27■■■■□ 3,88
Nkx2-3P97334 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Nkx2-3P97334 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Nkx2-3P97334 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,68■■■■□ 3,78
Nkx2-3P97334 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,67■■■■□ 3,78
Nkx2-3P97334 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Nkx2-3P97334 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Nkx2-3P97334 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,48■■■■□ 3,75
Nkx2-3P97334 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Nkx2-3P97334 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38,42■■■■□ 3,74
Nkx2-3P97334 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,41■■■■□ 3,74
Nkx2-3P97334 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Nkx2-3P97334 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,16■■■■□ 3,7
Nkx2-3P97334 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Nkx2-3P97334 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,08■■■■□ 3,69
Nkx2-3P97334 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Nkx2-3P97334 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Nkx2-3P97334 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Nkx2-3P97334 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Nkx2-3P97334 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Nkx2-3P97334 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,73■■■■□ 3,63
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Nkx2-3P97334 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Nkx2-3P97334 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,63■■■■□ 3,62
Nkx2-3P97334 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Nkx2-3P97334 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Nkx2-3P97334 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Nkx2-3P97334 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Nkx2-3P97334 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Nkx2-3P97334 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Nkx2-3P97334 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Nkx2-3P97334 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Nkx2-3P97334 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Nkx2-3P97334 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Nkx2-3P97334 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Nkx2-3P97334 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Nkx2-3P97334 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Nkx2-3P97334 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,19■■■■□ 3,54
Nkx2-3P97334 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Nkx2-3P97334 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Nkx2-3P97334 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Nkx2-3P97334 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Nkx2-3P97334 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Nkx2-3P97334 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Nkx2-3P97334 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Nkx2-3P97334 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Nkx2-3P97334 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Nkx2-3P97334 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Nkx2-3P97334 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Nkx2-3P97334 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Nkx2-3P97334 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Nkx2-3P97334 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Nkx2-3P97334 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Nkx2-3P97334 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Nkx2-3P97334 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Nkx2-3P97334 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Nkx2-3P97334 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,68■■■■□ 3,46
Nkx2-3P97334 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,64■■■■□ 3,46
Nkx2-3P97334 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Nkx2-3P97334 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,57■■■■□ 3,45
Nkx2-3P97334 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Nkx2-3P97334 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Nkx2-3P97334 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,9 ms