Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.41■■■■■ 5.66
Nkx2-3P97334 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Nkx2-3P97334 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Nkx2-3P97334 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Nkx2-3P97334 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Nkx2-3P97334 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Nkx2-3P97334 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Nkx2-3P97334 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Nkx2-3P97334 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Nkx2-3P97334 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Nkx2-3P97334 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Nkx2-3P97334 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Nkx2-3P97334 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Nkx2-3P97334 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Nkx2-3P97334 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Nkx2-3P97334 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Nkx2-3P97334 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Nkx2-3P97334 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Nkx2-3P97334 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Nkx2-3P97334 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Nkx2-3P97334 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
Nkx2-3P97334 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Nkx2-3P97334 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Nkx2-3P97334 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Nkx2-3P97334 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Nkx2-3P97334 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Nkx2-3P97334 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Nkx2-3P97334 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Nkx2-3P97334 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Nkx2-3P97334 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Nkx2-3P97334 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Nkx2-3P97334 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Nkx2-3P97334 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Nkx2-3P97334 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Nkx2-3P97334 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Nkx2-3P97334 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Nkx2-3P97334 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Nkx2-3P97334 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nkx2-3P97334 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Nkx2-3P97334 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Nkx2-3P97334 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Nkx2-3P97334 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Nkx2-3P97334 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Nkx2-3P97334 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Nkx2-3P97334 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Nkx2-3P97334 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Nkx2-3P97334 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Nkx2-3P97334 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Nkx2-3P97334 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nkx2-3P97334 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Nkx2-3P97334 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Nkx2-3P97334 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Nkx2-3P97334 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Nkx2-3P97334 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Nkx2-3P97334 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Nkx2-3P97334 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Nkx2-3P97334 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nkx2-3P97334 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Nkx2-3P97334 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Nkx2-3P97334 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Nkx2-3P97334 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Nkx2-3P97334 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Nkx2-3P97334 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Nkx2-3P97334 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nkx2-3P97334 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Nkx2-3P97334 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Nkx2-3P97334 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Nkx2-3P97334 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Nkx2-3P97334 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Nkx2-3P97334 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Nkx2-3P97334 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Nkx2-3P97334 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Nkx2-3P97334 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Nkx2-3P97334 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Nkx2-3P97334 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Nkx2-3P97334 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Nkx2-3P97334 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Nkx2-3P97334 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Nkx2-3P97334 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Nkx2-3P97334 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Nkx2-3P97334 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Nkx2-3P97334 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Nkx2-3P97334 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nkx2-3P97334 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Nkx2-3P97334 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Nkx2-3P97334 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Nkx2-3P97334 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Nkx2-3P97334 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nkx2-3P97334 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nkx2-3P97334 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Nkx2-3P97334 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Nkx2-3P97334 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Nkx2-3P97334 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Nkx2-3P97334 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Nkx2-3P97334 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Nkx2-3P97334 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nkx2-3P97334 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms