Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K8

Pappa, Pappalysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PappaQ8R4K8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,99■■■■■ 5,75
PappaQ8R4K8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,43■■■■■ 5,18
PappaQ8R4K8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,34■■■■■ 5,01
PappaQ8R4K8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,54■■■■■ 4,72
PappaQ8R4K8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,37■■■■■ 4,69
PappaQ8R4K8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,59■■■■■ 4,57
PappaQ8R4K8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,12■■■■■ 4,49
PappaQ8R4K8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
PappaQ8R4K8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
PappaQ8R4K8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
PappaQ8R4K8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,48■■■■■ 4,39
PappaQ8R4K8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
PappaQ8R4K8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,42■■■■■ 4,22
PappaQ8R4K8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
PappaQ8R4K8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
PappaQ8R4K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,11■■■■■ 4,17
PappaQ8R4K8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
PappaQ8R4K8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
PappaQ8R4K8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,7■■■■■ 4,11
PappaQ8R4K8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,66■■■■■ 4,1
PappaQ8R4K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
PappaQ8R4K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
PappaQ8R4K8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
PappaQ8R4K8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
PappaQ8R4K8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,31■■■■■ 4,04
PappaQ8R4K8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,27■■■■■ 4,04
PappaQ8R4K8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,26■■■■■ 4,04
PappaQ8R4K8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
PappaQ8R4K8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
PappaQ8R4K8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
PappaQ8R4K8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
PappaQ8R4K8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
PappaQ8R4K8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,68■■■■□ 3,94
PappaQ8R4K8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,64■■■■□ 3,94
PappaQ8R4K8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
PappaQ8R4K8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
PappaQ8R4K8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,17■■■■□ 3,86
PappaQ8R4K8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,1■■■■□ 3,85
PappaQ8R4K8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,01■■■■□ 3,84
PappaQ8R4K8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
PappaQ8R4K8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
PappaQ8R4K8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
PappaQ8R4K8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,78■■■■□ 3,8
PappaQ8R4K8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,68■■■■□ 3,78
PappaQ8R4K8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,58■■■■□ 3,77
PappaQ8R4K8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,56■■■■□ 3,76
PappaQ8R4K8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
PappaQ8R4K8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,48■■■■□ 3,75
PappaQ8R4K8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
PappaQ8R4K8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,24■■■■□ 3,71
PappaQ8R4K8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
PappaQ8R4K8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,09■■■■□ 3,69
PappaQ8R4K8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,07■■■■□ 3,68
PappaQ8R4K8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
PappaQ8R4K8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
PappaQ8R4K8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,01■■■■□ 3,68
PappaQ8R4K8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,97■■■■□ 3,67
PappaQ8R4K8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
PappaQ8R4K8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
PappaQ8R4K8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,9■■■■□ 3,66
PappaQ8R4K8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
PappaQ8R4K8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,75■■■■□ 3,63
PappaQ8R4K8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,7■■■■□ 3,63
PappaQ8R4K8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
PappaQ8R4K8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
PappaQ8R4K8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,63■■■■□ 3,61
PappaQ8R4K8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
PappaQ8R4K8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
PappaQ8R4K8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
PappaQ8R4K8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,54■■■■□ 3,6
PappaQ8R4K8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
PappaQ8R4K8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
PappaQ8R4K8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,47■■■■□ 3,59
PappaQ8R4K8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
PappaQ8R4K8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
PappaQ8R4K8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,39■■■■□ 3,58
PappaQ8R4K8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
PappaQ8R4K8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
PappaQ8R4K8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
PappaQ8R4K8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
PappaQ8R4K8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
PappaQ8R4K8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
PappaQ8R4K8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
PappaQ8R4K8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
PappaQ8R4K8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
PappaQ8R4K8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,09■■■■□ 3,53
PappaQ8R4K8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,08■■■■□ 3,53
PappaQ8R4K8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,99■■■■□ 3,51
PappaQ8R4K8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,88■■■■□ 3,49
PappaQ8R4K8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
PappaQ8R4K8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,82■■■■□ 3,49
PappaQ8R4K8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
PappaQ8R4K8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
PappaQ8R4K8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
PappaQ8R4K8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,69■■■■□ 3,46
PappaQ8R4K8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,67■■■■□ 3,46
PappaQ8R4K8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
PappaQ8R4K8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
PappaQ8R4K8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
PappaQ8R4K8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms