Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
Pdzd9Q9D9M4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Pdzd9Q9D9M4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Pdzd9Q9D9M4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.13■■■■■ 4.66
Pdzd9Q9D9M4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Pdzd9Q9D9M4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Pdzd9Q9D9M4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Pdzd9Q9D9M4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Pdzd9Q9D9M4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Pdzd9Q9D9M4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Pdzd9Q9D9M4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Pdzd9Q9D9M4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Pdzd9Q9D9M4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Pdzd9Q9D9M4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pdzd9Q9D9M4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Pdzd9Q9D9M4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Pdzd9Q9D9M4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Pdzd9Q9D9M4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Pdzd9Q9D9M4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Pdzd9Q9D9M4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Pdzd9Q9D9M4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Pdzd9Q9D9M4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Pdzd9Q9D9M4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Pdzd9Q9D9M4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Pdzd9Q9D9M4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Pdzd9Q9D9M4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Pdzd9Q9D9M4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Pdzd9Q9D9M4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Pdzd9Q9D9M4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pdzd9Q9D9M4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Pdzd9Q9D9M4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Pdzd9Q9D9M4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Pdzd9Q9D9M4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pdzd9Q9D9M4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Pdzd9Q9D9M4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Pdzd9Q9D9M4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Pdzd9Q9D9M4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Pdzd9Q9D9M4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Pdzd9Q9D9M4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Pdzd9Q9D9M4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Pdzd9Q9D9M4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Pdzd9Q9D9M4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Pdzd9Q9D9M4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Pdzd9Q9D9M4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Pdzd9Q9D9M4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pdzd9Q9D9M4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pdzd9Q9D9M4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pdzd9Q9D9M4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pdzd9Q9D9M4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pdzd9Q9D9M4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Pdzd9Q9D9M4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pdzd9Q9D9M4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Pdzd9Q9D9M4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pdzd9Q9D9M4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Pdzd9Q9D9M4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pdzd9Q9D9M4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Pdzd9Q9D9M4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Pdzd9Q9D9M4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Pdzd9Q9D9M4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Pdzd9Q9D9M4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pdzd9Q9D9M4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Pdzd9Q9D9M4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Pdzd9Q9D9M4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pdzd9Q9D9M4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Pdzd9Q9D9M4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Pdzd9Q9D9M4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Pdzd9Q9D9M4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Pdzd9Q9D9M4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pdzd9Q9D9M4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pdzd9Q9D9M4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdzd9Q9D9M4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdzd9Q9D9M4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pdzd9Q9D9M4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pdzd9Q9D9M4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pdzd9Q9D9M4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pdzd9Q9D9M4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pdzd9Q9D9M4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pdzd9Q9D9M4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pdzd9Q9D9M4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pdzd9Q9D9M4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pdzd9Q9D9M4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pdzd9Q9D9M4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pdzd9Q9D9M4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Pdzd9Q9D9M4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
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