Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,15■■■■■ 5,62
C4bP01029 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46,74■■■■■ 5,07
C4bP01029 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,62■■■■■ 4,89
C4bP01029 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43,86■■■■■ 4,61
C4bP01029 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,48■■■■■ 4,55
C4bP01029 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,73■■■■■ 4,43
C4bP01029 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
C4bP01029 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
C4bP01029 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
C4bP01029 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
C4bP01029 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,74■■■■■ 4,27
C4bP01029 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,9■■■■■ 4,14
C4bP01029 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
C4bP01029 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,5■■■■■ 4,07
C4bP01029 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
C4bP01029 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,35■■■■■ 4,05
C4bP01029 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
C4bP01029 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
C4bP01029 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
C4bP01029 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
C4bP01029 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,94■■■■□ 3,98
C4bP01029 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
C4bP01029 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39,71■■■■□ 3,95
C4bP01029 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,65■■■■□ 3,94
C4bP01029 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
C4bP01029 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,47■■■■□ 3,91
C4bP01029 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39,28■■■■□ 3,88
C4bP01029 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
C4bP01029 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
C4bP01029 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
C4bP01029 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
C4bP01029 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,95■■■■□ 3,83
C4bP01029 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
C4bP01029 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
C4bP01029 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38,71■■■■□ 3,79
C4bP01029 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,49■■■■□ 3,75
C4bP01029 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,46■■■■□ 3,75
C4bP01029 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38,34■■■■□ 3,73
C4bP01029 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
C4bP01029 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
C4bP01029 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,01■■■■□ 3,68
C4bP01029 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,01■■■■□ 3,67
C4bP01029 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
C4bP01029 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,93■■■■□ 3,66
C4bP01029 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
C4bP01029 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
C4bP01029 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
C4bP01029 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,71■■■■□ 3,63
C4bP01029 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,62■■■■□ 3,61
C4bP01029 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,57■■■■□ 3,6
C4bP01029 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
C4bP01029 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,49■■■■□ 3,59
C4bP01029 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
C4bP01029 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
C4bP01029 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,33■■■■□ 3,57
C4bP01029 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,3■■■■□ 3,56
C4bP01029 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,24■■■■□ 3,55
C4bP01029 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,24■■■■□ 3,55
C4bP01029 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
C4bP01029 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
C4bP01029 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,17■■■■□ 3,54
C4bP01029 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,12■■■■□ 3,53
C4bP01029 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
C4bP01029 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
C4bP01029 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
C4bP01029 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
C4bP01029 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,9■■■■□ 3,5
C4bP01029 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
C4bP01029 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
C4bP01029 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,79■■■■□ 3,48
C4bP01029 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
C4bP01029 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
C4bP01029 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
C4bP01029 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
C4bP01029 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,55■■■■□ 3,44
C4bP01029 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
C4bP01029 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
C4bP01029 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
C4bP01029 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
C4bP01029 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
C4bP01029 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
C4bP01029 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
C4bP01029 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
C4bP01029 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
C4bP01029 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
C4bP01029 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
C4bP01029 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
C4bP01029 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
C4bP01029 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
C4bP01029 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
C4bP01029 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
C4bP01029 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,35
C4bP01029 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,99■■■■□ 3,35
C4bP01029 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
C4bP01029 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
C4bP01029 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,34
C4bP01029 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
C4bP01029 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,34
C4bP01029 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
C4bP01029 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms