Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGN5

Plin1, Perilipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plin1Q8CGN5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,81■■■■■ 5,72
Plin1Q8CGN5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,04■■■■■ 5,12
Plin1Q8CGN5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,28■■■■■ 5
Plin1Q8CGN5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,31■■■■■ 4,68
Plin1Q8CGN5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,05■■■■■ 4,64
Plin1Q8CGN5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Plin1Q8CGN5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,35■■■■■ 4,53
Plin1Q8CGN5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Plin1Q8CGN5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Plin1Q8CGN5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Plin1Q8CGN5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Plin1Q8CGN5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,35■■■■■ 4,37
Plin1Q8CGN5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,19■■■■■ 4,34
Plin1Q8CGN5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Plin1Q8CGN5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Plin1Q8CGN5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Plin1Q8CGN5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Plin1Q8CGN5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,03■■■■■ 4,16
Plin1Q8CGN5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Plin1Q8CGN5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Plin1Q8CGN5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,88■■■■■ 4,14
Plin1Q8CGN5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Plin1Q8CGN5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Plin1Q8CGN5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Plin1Q8CGN5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Plin1Q8CGN5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Plin1Q8CGN5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Plin1Q8CGN5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Plin1Q8CGN5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Plin1Q8CGN5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Plin1Q8CGN5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,2■■■■■ 4,03
Plin1Q8CGN5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Plin1Q8CGN5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Plin1Q8CGN5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,07■■■■■ 4
Plin1Q8CGN5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Plin1Q8CGN5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3,99
Plin1Q8CGN5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Plin1Q8CGN5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Plin1Q8CGN5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,17■■■■□ 3,86
Plin1Q8CGN5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Plin1Q8CGN5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Plin1Q8CGN5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,06■■■■□ 3,84
Plin1Q8CGN5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Plin1Q8CGN5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Plin1Q8CGN5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Plin1Q8CGN5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Plin1Q8CGN5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,81■■■■□ 3,8
Plin1Q8CGN5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38,68■■■■□ 3,78
Plin1Q8CGN5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,67■■■■□ 3,78
Plin1Q8CGN5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,63■■■■□ 3,78
Plin1Q8CGN5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Plin1Q8CGN5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Plin1Q8CGN5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,53■■■■□ 3,76
Plin1Q8CGN5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,52■■■■□ 3,76
Plin1Q8CGN5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,4■■■■□ 3,74
Plin1Q8CGN5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Plin1Q8CGN5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,31■■■■□ 3,72
Plin1Q8CGN5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Plin1Q8CGN5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Plin1Q8CGN5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,1■■■■□ 3,69
Plin1Q8CGN5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Plin1Q8CGN5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Plin1Q8CGN5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3,67
Plin1Q8CGN5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Plin1Q8CGN5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Plin1Q8CGN5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Plin1Q8CGN5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Plin1Q8CGN5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,75■■■■□ 3,63
Plin1Q8CGN5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,75■■■■□ 3,63
Plin1Q8CGN5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,74■■■■□ 3,63
Plin1Q8CGN5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Plin1Q8CGN5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,7■■■■□ 3,62
Plin1Q8CGN5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Plin1Q8CGN5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Plin1Q8CGN5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Plin1Q8CGN5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Plin1Q8CGN5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Plin1Q8CGN5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,63■■■■□ 3,61
Plin1Q8CGN5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Plin1Q8CGN5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Plin1Q8CGN5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
Plin1Q8CGN5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Plin1Q8CGN5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Plin1Q8CGN5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Plin1Q8CGN5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Plin1Q8CGN5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Plin1Q8CGN5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Plin1Q8CGN5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Plin1Q8CGN5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Plin1Q8CGN5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Plin1Q8CGN5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,35■■■■□ 3,57
Plin1Q8CGN5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Plin1Q8CGN5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,29■■■■□ 3,56
Plin1Q8CGN5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Plin1Q8CGN5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Plin1Q8CGN5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Plin1Q8CGN5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Plin1Q8CGN5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Plin1Q8CGN5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Plin1Q8CGN5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms