Protein–RNA interactions for Protein: O89010

Magea6, MCG114343, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea6O89010 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.26■■■■■ 5.64
Magea6O89010 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Magea6O89010 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Magea6O89010 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
Magea6O89010 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Magea6O89010 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Magea6O89010 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Magea6O89010 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Magea6O89010 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Magea6O89010 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Magea6O89010 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Magea6O89010 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
Magea6O89010 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Magea6O89010 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Magea6O89010 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Magea6O89010 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Magea6O89010 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Magea6O89010 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Magea6O89010 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Magea6O89010 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Magea6O89010 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Magea6O89010 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Magea6O89010 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Magea6O89010 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Magea6O89010 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Magea6O89010 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Magea6O89010 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Magea6O89010 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Magea6O89010 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Magea6O89010 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Magea6O89010 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Magea6O89010 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Magea6O89010 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Magea6O89010 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Magea6O89010 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Magea6O89010 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Magea6O89010 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Magea6O89010 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Magea6O89010 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Magea6O89010 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Magea6O89010 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Magea6O89010 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Magea6O89010 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Magea6O89010 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Magea6O89010 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Magea6O89010 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Magea6O89010 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Magea6O89010 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Magea6O89010 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Magea6O89010 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Magea6O89010 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Magea6O89010 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Magea6O89010 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Magea6O89010 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Magea6O89010 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Magea6O89010 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Magea6O89010 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Magea6O89010 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Magea6O89010 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Magea6O89010 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Magea6O89010 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Magea6O89010 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Magea6O89010 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Magea6O89010 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Magea6O89010 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Magea6O89010 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Magea6O89010 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Magea6O89010 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Magea6O89010 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Magea6O89010 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Magea6O89010 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Magea6O89010 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Magea6O89010 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Magea6O89010 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Magea6O89010 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Magea6O89010 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Magea6O89010 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Magea6O89010 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Magea6O89010 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Magea6O89010 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Magea6O89010 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Magea6O89010 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Magea6O89010 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Magea6O89010 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Magea6O89010 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Magea6O89010 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Magea6O89010 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Magea6O89010 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Magea6O89010 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Magea6O89010 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Magea6O89010 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Magea6O89010 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Magea6O89010 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Magea6O89010 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms