RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ankrd13dQ6PD24 605 aa28.59■■■□□ 2.17
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 IncenpQ9WU62 880 aa28.54■■■□□ 2.16
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Speer4bQ9D9F7 267 aa28.44■■■□□ 2.14
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sos2Q02384 1333 aa28.42■■■□□ 2.14
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 HypkQ9CR41 129 aa28.39■■■□□ 2.14
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TnikP83510 1323 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 ErfeQ6PGN1 340 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Q7TT23 1179 aa28.33■■■□□ 2.13
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Stk31Q99MW1 1018 aa28.3■■■□□ 2.12
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa28.29■■■□□ 2.12
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm1979E9QAN3 267 aa28.24■■■□□ 2.11
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm5862K7N5V5 267 aa28.24■■■□□ 2.11
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm10220K7N660 267 aa28.24■■■□□ 2.11
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Chmp7Q8R1T1 451 aa28.21■■■□□ 2.11
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col23a1Q8K4G2 532 aa28.15■■■□□ 2.1
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cabp2Q9JLK4 216 aa28.15■■■□□ 2.1
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.15■■■□□ 2.1
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Adgre1Q61549 931 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sall2Q9QX96 1004 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zscan21Q07231 555 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Prom2Q3UUY6 835 aa28.12■■■□□ 2.09
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Q4VA45 678 aa28.11■■■□□ 2.09
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