RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48.25■■■■■ 5.31
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 ScribQ80U72 1612 aa45.06■■■■■ 4.8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NacadQ5SWP3 1504 aa43.41■■■■■ 4.54
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kdm5dQ62240 1548 aa43.27■■■■■ 4.52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa43.07■■■■■ 4.49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42.63■■■■■ 4.42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 BicraF8VPZ9 1578 aa42.31■■■■■ 4.36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42.2■■■■■ 4.35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41.33■■■■■ 4.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rhox8Q6VSS7 320 aa41.09■■■■■ 4.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40.88■■■■■ 4.13
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.78■■■■■ 4.12
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Baz1aO88379 1555 aa40.77■■■■■ 4.12
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40.59■■■■■ 4.09
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.42■■■■■ 4.06
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fam135aQ6NS59 1506 aa40.21■■■■■ 4.03
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40.1■■■■■ 4.01
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dnajc5P60904 198 aa40.09■■■■■ 4.01
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39.66■■■■□ 3.94
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trim41Q5NCC3 630 aa39.59■■■■□ 3.93
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.56■■■■□ 3.92
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39.49■■■■□ 3.91
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mrc2Q64449 1479 aa39.31■■■■□ 3.88
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39.14■■■■□ 3.86
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.6■■■■□ 3.77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38.51■■■■□ 3.76
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CftrP26361 1476 aa38.49■■■■□ 3.75
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Synj1Q8CHC4 1574 aa38.44■■■■□ 3.74
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa38.4■■■■□ 3.74
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Shroom2A2ALU4 1481 aa38.18■■■■□ 3.7
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38.12■■■■□ 3.69
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cux2P70298 1426 aa38.12■■■■□ 3.69
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col17a1Q07563 1470 aa37.96■■■■□ 3.67
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif15Q6P9L6 1387 aa37.89■■■■□ 3.66
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Top2bQ64511 1612 aa37.59■■■■□ 3.61
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37.43■■■■□ 3.58
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cep164Q5DU05 1446 aa37.38■■■■□ 3.57
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.35■■■■□ 3.57
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Golga3P55937 1487 aa37.19■■■■□ 3.54
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Il27Q8K3I6 234 aa37.08■■■■□ 3.53
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TnnQ80Z71 1560 aa37.03■■■■□ 3.52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rusc2Q80U22 1514 aa37.02■■■■□ 3.52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.02■■■■□ 3.52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cngb1E1AZ71 1325 aa36.99■■■■□ 3.51
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc18Q640L5 1455 aa36.91■■■■□ 3.5
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ift140E9PY46 1464 aa36.88■■■■□ 3.49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa36.8■■■■□ 3.48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fmn1Q05860 1466 aa36.75■■■■□ 3.47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Camsap1A2AHC3 1581 aa36.7■■■■□ 3.47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36.7■■■■□ 3.47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Adgrl3Q80TS3 1537 aa36.66■■■■□ 3.46
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Disp1Q3TDN0 1521 aa36.48■■■■□ 3.43
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Duox2A2AQ99 1517 aa36.43■■■■□ 3.42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36.42■■■■□ 3.42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm156Q58A37 223 aa36.41■■■■□ 3.42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cep170Q6A065 1588 aa36.4■■■■□ 3.42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PtprtQ99M80 1454 aa36.38■■■■□ 3.41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36.32■■■■□ 3.41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36.31■■■■□ 3.4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Grin2bQ01097 1482 aa36.2■■■■□ 3.39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36.2■■■■□ 3.39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36.15■■■■□ 3.38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Samd9lQ69Z37 1561 aa36.15■■■■□ 3.38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36.03■■■■□ 3.36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rad54l2Q99NG0 1466 aa35.96■■■■□ 3.35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Efcab5A0JP43 1406 aa35.95■■■■□ 3.35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AknaQ80VW7 1404 aa35.95■■■■□ 3.35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abcc1O35379 1528 aa35.92■■■■□ 3.34
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Chic1Q8CBW7 227 aa35.9■■■■□ 3.34
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