RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48,25■■■■■ 5,31
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NischQ80TM9 1593 aa47,37■■■■■ 5,17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abcc9P70170 1546 aa46,39■■■■■ 5,02
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abcc8B2RUS7 1588 aa45,92■■■■■ 4,94
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 ScribQ80U72 1612 aa45,06■■■■■ 4,8
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NacadQ5SWP3 1504 aa43,41■■■■■ 4,54
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kdm5dQ62240 1548 aa43,27■■■■■ 4,52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa43,07■■■■■ 4,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42,63■■■■■ 4,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 BicraF8VPZ9 1578 aa42,31■■■■■ 4,36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42,2■■■■■ 4,35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41,44■■■■■ 4,22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41,33■■■■■ 4,21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41,29■■■■■ 4,2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rhox8Q6VSS7 320 aa41,09■■■■■ 4,17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40,88■■■■■ 4,13
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,78■■■■■ 4,12
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Baz1aO88379 1555 aa40,77■■■■■ 4,12
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40,66■■■■■ 4,1
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40,59■■■■■ 4,09
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40,42■■■■■ 4,06
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fam135aQ6NS59 1506 aa40,21■■■■■ 4,03
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40,1■■■■■ 4,01
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dnajc5P60904 198 aa40,09■■■■■ 4,01
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40,06■■■■■ 4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP39,87■■■■□ 3,97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa39,86■■■■□ 3,97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39,7■■■■□ 3,95
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,68■■■■□ 3,94
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,66■■■■□ 3,94
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trim41Q5NCC3 630 aa39,59■■■■□ 3,93
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Baz1bQ9Z277 1479 aa39,56■■■■□ 3,92
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39,5■■■■□ 3,91
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39,49■■■■□ 3,91
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mrc2Q64449 1479 aa39,31■■■■□ 3,88
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rtl1Q7M732 1744 aa39,24■■■■□ 3,87
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39,14■■■■□ 3,86
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38,6■■■■□ 3,77
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38,51■■■■□ 3,76
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CftrP26361 1476 aa38,49■■■■□ 3,75
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP38,46■■■■□ 3,75
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Synj1Q8CHC4 1574 aa38,44■■■■□ 3,74
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa38,4■■■■□ 3,74
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38,39■■■■□ 3,74
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Shroom2A2ALU4 1481 aa38,18■■■■□ 3,7
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38,12■■■■□ 3,69
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cux2P70298 1426 aa38,12■■■■□ 3,69
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37,97■■■■□ 3,67
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col17a1Q07563 1470 aa37,96■■■■□ 3,67
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif15Q6P9L6 1387 aa37,89■■■■□ 3,66
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37,84■■■■□ 3,65
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP37,67■■■■□ 3,62
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37,66■■■■□ 3,62
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Top2bQ64511 1612 aa37,59■■■■□ 3,61
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37,46■■■■□ 3,59
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37,43■■■■□ 3,58
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP37,39■■■■□ 3,58
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cep164Q5DU05 1446 aa37,38■■■■□ 3,57
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Plb1Q3TTY0 1478 aa37,35■■■■□ 3,57
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37,22■■■■□ 3,55
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Golga3P55937 1487 aa37,19■■■■□ 3,54
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP37,18■■■■□ 3,54
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37,08■■■■□ 3,53
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Il27Q8K3I6 234 aa37,08■■■■□ 3,53
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TnnQ80Z71 1560 aa37,03■■■■□ 3,52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rusc2Q80U22 1514 aa37,02■■■■□ 3,52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Crocc2F6XLV1 1638 aa37,02■■■■□ 3,52
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cngb1E1AZ71 1325 aa36,99■■■■□ 3,51
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP36,92■■■■□ 3,5
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc18Q640L5 1455 aa36,91■■■■□ 3,5
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ift140E9PY46 1464 aa36,88■■■■□ 3,49
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa36,8■■■■□ 3,48
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fmn1Q05860 1466 aa36,75■■■■□ 3,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Camsap1A2AHC3 1581 aa36,7■■■■□ 3,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36,7■■■■□ 3,47
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Adgrl3Q80TS3 1537 aa36,66■■■■□ 3,46
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP36,59■■■■□ 3,45
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Disp1Q3TDN0 1521 aa36,48■■■■□ 3,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PtprkP35822 1457 aa36,46■■■■□ 3,43
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Duox2A2AQ99 1517 aa36,43■■■■□ 3,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36,42■■■■□ 3,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm156Q58A37 223 aa36,41■■■■□ 3,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cep170Q6A065 1588 aa36,4■■■■□ 3,42
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PtprtQ99M80 1454 aa36,38■■■■□ 3,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36,32■■■■□ 3,41
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36,31■■■■□ 3,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36,3■■■■□ 3,4
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36,22■■■■□ 3,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Grin2bQ01097 1482 aa36,2■■■■□ 3,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36,2■■■■□ 3,39
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36,15■■■■□ 3,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Samd9lQ69Z37 1561 aa36,15■■■■□ 3,38
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36,09■■■■□ 3,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36,03■■■■□ 3,36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36■■■■□ 3,35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rad54l2Q99NG0 1466 aa35,96■■■■□ 3,35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Efcab5A0JP43 1406 aa35,95■■■■□ 3,35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AknaQ80VW7 1404 aa35,95■■■■□ 3,35
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Abcc1O35379 1528 aa35,92■■■■□ 3,34
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Chic1Q8CBW7 227 aa35,9■■■■□ 3,34
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