Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.29■■■■■ 5.8
4930572O03RikQ8C5Y0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
4930572O03RikQ8C5Y0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
4930572O03RikQ8C5Y0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
4930572O03RikQ8C5Y0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
4930572O03RikQ8C5Y0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
4930572O03RikQ8C5Y0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
4930572O03RikQ8C5Y0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
4930572O03RikQ8C5Y0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
4930572O03RikQ8C5Y0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
4930572O03RikQ8C5Y0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
4930572O03RikQ8C5Y0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
4930572O03RikQ8C5Y0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
4930572O03RikQ8C5Y0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
4930572O03RikQ8C5Y0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
4930572O03RikQ8C5Y0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
4930572O03RikQ8C5Y0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
4930572O03RikQ8C5Y0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
4930572O03RikQ8C5Y0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
4930572O03RikQ8C5Y0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
4930572O03RikQ8C5Y0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
4930572O03RikQ8C5Y0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
4930572O03RikQ8C5Y0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
4930572O03RikQ8C5Y0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
4930572O03RikQ8C5Y0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
4930572O03RikQ8C5Y0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
4930572O03RikQ8C5Y0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
4930572O03RikQ8C5Y0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
4930572O03RikQ8C5Y0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
4930572O03RikQ8C5Y0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
4930572O03RikQ8C5Y0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
4930572O03RikQ8C5Y0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
4930572O03RikQ8C5Y0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
4930572O03RikQ8C5Y0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
4930572O03RikQ8C5Y0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
4930572O03RikQ8C5Y0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
4930572O03RikQ8C5Y0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
4930572O03RikQ8C5Y0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
4930572O03RikQ8C5Y0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
4930572O03RikQ8C5Y0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
4930572O03RikQ8C5Y0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
4930572O03RikQ8C5Y0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
4930572O03RikQ8C5Y0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
4930572O03RikQ8C5Y0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
4930572O03RikQ8C5Y0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
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