Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,22■■■■■ 5,79
Rps6ka4Q9Z2B9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,59■■■■■ 5,21
Rps6ka4Q9Z2B9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,89■■■■■ 5,1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,61■■■■■ 4,73
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,27■■■■■ 4,68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,31■■■■■ 4,52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,24■■■■■ 4,51
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,38■■■■■ 4,21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,37■■■■■ 4,21
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Rps6ka4Q9Z2B9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Rps6ka4Q9Z2B9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,03■■■■■ 4,16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Rps6ka4Q9Z2B9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Rps6ka4Q9Z2B9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Rps6ka4Q9Z2B9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,91■■■■□ 3,98
Rps6ka4Q9Z2B9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Rps6ka4Q9Z2B9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39,78■■■■□ 3,96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Rps6ka4Q9Z2B9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
Rps6ka4Q9Z2B9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,5■■■■□ 3,91
Rps6ka4Q9Z2B9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Rps6ka4Q9Z2B9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Rps6ka4Q9Z2B9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,17■■■■□ 3,86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,13■■■■□ 3,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Rps6ka4Q9Z2B9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,87■■■■□ 3,81
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,75■■■■□ 3,79
Rps6ka4Q9Z2B9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Rps6ka4Q9Z2B9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,63■■■■□ 3,77
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Rps6ka4Q9Z2B9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,37■■■■□ 3,73
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,37■■■■□ 3,73
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,35■■■■□ 3,73
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,31■■■■□ 3,72
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,19■■■■□ 3,7
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,06■■■■□ 3,68
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Rps6ka4Q9Z2B9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,83■■■■□ 3,65
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,81■■■■□ 3,64
Rps6ka4Q9Z2B9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,61■■■■□ 3,61
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Rps6ka4Q9Z2B9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,58■■■■□ 3,61
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,44■■■■□ 3,58
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Rps6ka4Q9Z2B9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,55
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Rps6ka4Q9Z2B9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Rps6ka4Q9Z2B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,1■■■■□ 3,53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Rps6ka4Q9Z2B9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,84■■■■□ 3,49
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Rps6ka4Q9Z2B9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Rps6ka4Q9Z2B9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,71■■■■□ 3,47
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Rps6ka4Q9Z2B9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Rps6ka4Q9Z2B9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Rps6ka4Q9Z2B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,2 ms