Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD24

Ankrd13d, Ankyrin repeat domain-containing protein 13D, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13dQ6PD24 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
Ankrd13dQ6PD24 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Ankrd13dQ6PD24 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Ankrd13dQ6PD24 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Ankrd13dQ6PD24 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Ankrd13dQ6PD24 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Ankrd13dQ6PD24 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Ankrd13dQ6PD24 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Ankrd13dQ6PD24 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Ankrd13dQ6PD24 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Ankrd13dQ6PD24 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ankrd13dQ6PD24 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Ankrd13dQ6PD24 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ankrd13dQ6PD24 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ankrd13dQ6PD24 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ankrd13dQ6PD24 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ankrd13dQ6PD24 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ankrd13dQ6PD24 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ankrd13dQ6PD24 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ankrd13dQ6PD24 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Ankrd13dQ6PD24 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ankrd13dQ6PD24 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
Ankrd13dQ6PD24 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ankrd13dQ6PD24 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ankrd13dQ6PD24 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Ankrd13dQ6PD24 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ankrd13dQ6PD24 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Ankrd13dQ6PD24 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ankrd13dQ6PD24 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Ankrd13dQ6PD24 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ankrd13dQ6PD24 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Ankrd13dQ6PD24 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ankrd13dQ6PD24 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Ankrd13dQ6PD24 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ankrd13dQ6PD24 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ankrd13dQ6PD24 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ankrd13dQ6PD24 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ankrd13dQ6PD24 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ankrd13dQ6PD24 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ankrd13dQ6PD24 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ankrd13dQ6PD24 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Ankrd13dQ6PD24 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ankrd13dQ6PD24 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Ankrd13dQ6PD24 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ankrd13dQ6PD24 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Ankrd13dQ6PD24 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Ankrd13dQ6PD24 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ankrd13dQ6PD24 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ankrd13dQ6PD24 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ankrd13dQ6PD24 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Ankrd13dQ6PD24 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Ankrd13dQ6PD24 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ankrd13dQ6PD24 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ankrd13dQ6PD24 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ankrd13dQ6PD24 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ankrd13dQ6PD24 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ankrd13dQ6PD24 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ankrd13dQ6PD24 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ankrd13dQ6PD24 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ankrd13dQ6PD24 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ankrd13dQ6PD24 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ankrd13dQ6PD24 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ankrd13dQ6PD24 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ankrd13dQ6PD24 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ankrd13dQ6PD24 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ankrd13dQ6PD24 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ankrd13dQ6PD24 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ankrd13dQ6PD24 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ankrd13dQ6PD24 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ankrd13dQ6PD24 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ankrd13dQ6PD24 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ankrd13dQ6PD24 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ankrd13dQ6PD24 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ankrd13dQ6PD24 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ankrd13dQ6PD24 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ankrd13dQ6PD24 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ankrd13dQ6PD24 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ankrd13dQ6PD24 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ankrd13dQ6PD24 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Ankrd13dQ6PD24 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ankrd13dQ6PD24 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ankrd13dQ6PD24 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ankrd13dQ6PD24 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ankrd13dQ6PD24 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ankrd13dQ6PD24 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Ankrd13dQ6PD24 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ankrd13dQ6PD24 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ankrd13dQ6PD24 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ankrd13dQ6PD24 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ankrd13dQ6PD24 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ankrd13dQ6PD24 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ankrd13dQ6PD24 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ankrd13dQ6PD24 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ankrd13dQ6PD24 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ankrd13dQ6PD24 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ankrd13dQ6PD24 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ankrd13dQ6PD24 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ankrd13dQ6PD24 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ankrd13dQ6PD24 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ankrd13dQ6PD24 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms