Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,87■■■■■ 5,25
Hoxd11P23813 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,08■■■■■ 4,81
Hoxd11P23813 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,23■■■■■ 4,67
Hoxd11P23813 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,45■■■■■ 4,39
Hoxd11P23813 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Hoxd11P23813 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Hoxd11P23813 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Hoxd11P23813 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Hoxd11P23813 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,16■■■■■ 4,02
Hoxd11P23813 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
Hoxd11P23813 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Hoxd11P23813 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,89■■■■□ 3,98
Hoxd11P23813 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,76■■■■□ 3,96
Hoxd11P23813 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Hoxd11P23813 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Hoxd11P23813 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,97■■■■□ 3,83
Hoxd11P23813 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Hoxd11P23813 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
Hoxd11P23813 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,34■■■■□ 3,73
Hoxd11P23813 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Hoxd11P23813 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Hoxd11P23813 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Hoxd11P23813 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Hoxd11P23813 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Hoxd11P23813 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
Hoxd11P23813 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Hoxd11P23813 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Hoxd11P23813 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,39■■■■□ 3,58
Hoxd11P23813 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Hoxd11P23813 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Hoxd11P23813 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Hoxd11P23813 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,92■■■■□ 3,5
Hoxd11P23813 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Hoxd11P23813 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Hoxd11P23813 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Hoxd11P23813 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Hoxd11P23813 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Hoxd11P23813 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Hoxd11P23813 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Hoxd11P23813 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Hoxd11P23813 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Hoxd11P23813 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Hoxd11P23813 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,53■■■■□ 3,28
Hoxd11P23813 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Hoxd11P23813 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,39■■■■□ 3,26
Hoxd11P23813 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Hoxd11P23813 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Hoxd11P23813 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Hoxd11P23813 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Hoxd11P23813 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Hoxd11P23813 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,2■■■■□ 3,23
Hoxd11P23813 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Hoxd11P23813 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Hoxd11P23813 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Hoxd11P23813 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Hoxd11P23813 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Hoxd11P23813 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Hoxd11P23813 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Hoxd11P23813 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Hoxd11P23813 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Hoxd11P23813 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Hoxd11P23813 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Hoxd11P23813 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Hoxd11P23813 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Hoxd11P23813 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Hoxd11P23813 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Hoxd11P23813 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Hoxd11P23813 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Hoxd11P23813 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Hoxd11P23813 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Hoxd11P23813 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Hoxd11P23813 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Hoxd11P23813 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Hoxd11P23813 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Hoxd11P23813 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Hoxd11P23813 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Hoxd11P23813 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Hoxd11P23813 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Hoxd11P23813 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Hoxd11P23813 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Hoxd11P23813 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Hoxd11P23813 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Hoxd11P23813 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Hoxd11P23813 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Hoxd11P23813 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Hoxd11P23813 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Hoxd11P23813 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Hoxd11P23813 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Hoxd11P23813 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Hoxd11P23813 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Hoxd11P23813 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Hoxd11P23813 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Hoxd11P23813 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Hoxd11P23813 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Hoxd11P23813 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Hoxd11P23813 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Hoxd11P23813 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Hoxd11P23813 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Hoxd11P23813 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Hoxd11P23813 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms