Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
Hoxd11P23813 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Hoxd11P23813 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Hoxd11P23813 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Hoxd11P23813 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Hoxd11P23813 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Hoxd11P23813 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Hoxd11P23813 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Hoxd11P23813 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Hoxd11P23813 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Hoxd11P23813 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Hoxd11P23813 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Hoxd11P23813 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Hoxd11P23813 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Hoxd11P23813 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Hoxd11P23813 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Hoxd11P23813 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Hoxd11P23813 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Hoxd11P23813 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Hoxd11P23813 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Hoxd11P23813 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Hoxd11P23813 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Hoxd11P23813 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Hoxd11P23813 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Hoxd11P23813 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Hoxd11P23813 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Hoxd11P23813 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Hoxd11P23813 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Hoxd11P23813 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Hoxd11P23813 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Hoxd11P23813 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hoxd11P23813 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Hoxd11P23813 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Hoxd11P23813 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Hoxd11P23813 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Hoxd11P23813 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hoxd11P23813 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Hoxd11P23813 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hoxd11P23813 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Hoxd11P23813 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hoxd11P23813 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Hoxd11P23813 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Hoxd11P23813 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hoxd11P23813 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Hoxd11P23813 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Hoxd11P23813 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Hoxd11P23813 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hoxd11P23813 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hoxd11P23813 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hoxd11P23813 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hoxd11P23813 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Hoxd11P23813 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hoxd11P23813 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hoxd11P23813 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hoxd11P23813 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Hoxd11P23813 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Hoxd11P23813 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Hoxd11P23813 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hoxd11P23813 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Hoxd11P23813 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Hoxd11P23813 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Hoxd11P23813 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hoxd11P23813 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxd11P23813 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxd11P23813 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Hoxd11P23813 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Hoxd11P23813 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxd11P23813 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Hoxd11P23813 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hoxd11P23813 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Hoxd11P23813 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hoxd11P23813 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hoxd11P23813 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Hoxd11P23813 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hoxd11P23813 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxd11P23813 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxd11P23813 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Hoxd11P23813 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Hoxd11P23813 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Hoxd11P23813 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Hoxd11P23813 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Hoxd11P23813 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxd11P23813 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxd11P23813 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxd11P23813 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Hoxd11P23813 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Hoxd11P23813 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Hoxd11P23813 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Hoxd11P23813 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hoxd11P23813 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxd11P23813 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxd11P23813 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hoxd11P23813 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hoxd11P23813 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxd11P23813 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxd11P23813 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxd11P23813 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxd11P23813 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hoxd11P23813 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hoxd11P23813 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms