Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,09■■■■■ 5,77
ApobrQ8VBT6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,43■■■■■ 5,18
ApobrQ8VBT6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,71■■■■■ 5,07
ApobrQ8VBT6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,45■■■■■ 4,71
ApobrQ8VBT6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,28■■■■■ 4,68
ApobrQ8VBT6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,23■■■■■ 4,51
ApobrQ8VBT6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
ApobrQ8VBT6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
ApobrQ8VBT6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
ApobrQ8VBT6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,61■■■■■ 4,41
ApobrQ8VBT6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
ApobrQ8VBT6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
ApobrQ8VBT6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,62■■■■■ 4,25
ApobrQ8VBT6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
ApobrQ8VBT6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
ApobrQ8VBT6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,24■■■■■ 4,19
ApobrQ8VBT6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,2■■■■■ 4,19
ApobrQ8VBT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
ApobrQ8VBT6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,96■■■■■ 4,15
ApobrQ8VBT6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
ApobrQ8VBT6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
ApobrQ8VBT6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
ApobrQ8VBT6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,47■■■■■ 4,07
ApobrQ8VBT6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,46■■■■■ 4,07
ApobrQ8VBT6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,45■■■■■ 4,07
ApobrQ8VBT6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
ApobrQ8VBT6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
ApobrQ8VBT6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,08■■■■■ 4,01
ApobrQ8VBT6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
ApobrQ8VBT6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
ApobrQ8VBT6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
ApobrQ8VBT6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
ApobrQ8VBT6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,61■■■■□ 3,93
ApobrQ8VBT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
ApobrQ8VBT6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,35■■■■□ 3,89
ApobrQ8VBT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,21■■■■□ 3,87
ApobrQ8VBT6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,2■■■■□ 3,87
ApobrQ8VBT6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,08■■■■□ 3,85
ApobrQ8VBT6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
ApobrQ8VBT6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
ApobrQ8VBT6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,93■■■■□ 3,82
ApobrQ8VBT6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
ApobrQ8VBT6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
ApobrQ8VBT6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,72■■■■□ 3,79
ApobrQ8VBT6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,46■■■■□ 3,75
ApobrQ8VBT6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
ApobrQ8VBT6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
ApobrQ8VBT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,32■■■■□ 3,72
ApobrQ8VBT6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,27■■■■□ 3,72
ApobrQ8VBT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,25■■■■□ 3,71
ApobrQ8VBT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,21■■■■□ 3,71
ApobrQ8VBT6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,17■■■■□ 3,7
ApobrQ8VBT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
ApobrQ8VBT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,12■■■■□ 3,69
ApobrQ8VBT6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
ApobrQ8VBT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,92■■■■□ 3,66
ApobrQ8VBT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,92■■■■□ 3,66
ApobrQ8VBT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,88■■■■□ 3,65
ApobrQ8VBT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
ApobrQ8VBT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
ApobrQ8VBT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
ApobrQ8VBT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,78■■■■□ 3,64
ApobrQ8VBT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,78■■■■□ 3,64
ApobrQ8VBT6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,55■■■■□ 3,6
ApobrQ8VBT6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
ApobrQ8VBT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
ApobrQ8VBT6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
ApobrQ8VBT6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
ApobrQ8VBT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
ApobrQ8VBT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,45■■■■□ 3,59
ApobrQ8VBT6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
ApobrQ8VBT6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
ApobrQ8VBT6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
ApobrQ8VBT6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,32■■■■□ 3,56
ApobrQ8VBT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
ApobrQ8VBT6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
ApobrQ8VBT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
ApobrQ8VBT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,97■■■■□ 3,51
ApobrQ8VBT6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,97■■■■□ 3,51
ApobrQ8VBT6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,95■■■■□ 3,51
ApobrQ8VBT6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
ApobrQ8VBT6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
ApobrQ8VBT6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
ApobrQ8VBT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,88■■■■□ 3,49
ApobrQ8VBT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,84■■■■□ 3,49
ApobrQ8VBT6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
ApobrQ8VBT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
ApobrQ8VBT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,79■■■■□ 3,48
ApobrQ8VBT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,78■■■■□ 3,48
ApobrQ8VBT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,69■■■■□ 3,46
ApobrQ8VBT6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
ApobrQ8VBT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,65■■■■□ 3,46
ApobrQ8VBT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
ApobrQ8VBT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
ApobrQ8VBT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms