Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN9

Mapk8ip3, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49,65■■■■■ 5,54
Mapk8ip3Q9ESN9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,75■■■■■ 4,91
Mapk8ip3Q9ESN9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,14■■■■■ 4,82
Mapk8ip3Q9ESN9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,41■■■■■ 4,7
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,75■■■■■ 4,59
Mapk8ip3Q9ESN9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
Mapk8ip3Q9ESN9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,86■■■■■ 4,45
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,83■■■■■ 4,45
Mapk8ip3Q9ESN9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,3■■■■■ 4,36
Mapk8ip3Q9ESN9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
Mapk8ip3Q9ESN9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,73■■■■■ 4,27
Mapk8ip3Q9ESN9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,25
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,52■■■■■ 4,24
Mapk8ip3Q9ESN9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Mapk8ip3Q9ESN9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,19■■■■■ 4,18
Mapk8ip3Q9ESN9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,01■■■■■ 4,15
Mapk8ip3Q9ESN9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Mapk8ip3Q9ESN9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Mapk8ip3Q9ESN9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Mapk8ip3Q9ESN9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Mapk8ip3Q9ESN9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Mapk8ip3Q9ESN9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Mapk8ip3Q9ESN9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Mapk8ip3Q9ESN9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Mapk8ip3Q9ESN9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,27■■■■■ 4,04
Mapk8ip3Q9ESN9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,21■■■■■ 4,03
Mapk8ip3Q9ESN9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Mapk8ip3Q9ESN9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
Mapk8ip3Q9ESN9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Mapk8ip3Q9ESN9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Mapk8ip3Q9ESN9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,66■■■■□ 3,94
Mapk8ip3Q9ESN9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,63■■■■□ 3,93
Mapk8ip3Q9ESN9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,9
Mapk8ip3Q9ESN9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Mapk8ip3Q9ESN9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Mapk8ip3Q9ESN9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Mapk8ip3Q9ESN9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Mapk8ip3Q9ESN9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Mapk8ip3Q9ESN9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39,05■■■■□ 3,84
Mapk8ip3Q9ESN9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Mapk8ip3Q9ESN9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,93■■■■□ 3,82
Mapk8ip3Q9ESN9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Mapk8ip3Q9ESN9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Mapk8ip3Q9ESN9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Mapk8ip3Q9ESN9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Mapk8ip3Q9ESN9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Mapk8ip3Q9ESN9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Mapk8ip3Q9ESN9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Mapk8ip3Q9ESN9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,38■■■■□ 3,73
Mapk8ip3Q9ESN9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Mapk8ip3Q9ESN9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Mapk8ip3Q9ESN9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Mapk8ip3Q9ESN9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Mapk8ip3Q9ESN9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,13■■■■□ 3,7
Mapk8ip3Q9ESN9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,08■■■■□ 3,69
Mapk8ip3Q9ESN9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Mapk8ip3Q9ESN9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Mapk8ip3Q9ESN9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Mapk8ip3Q9ESN9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Mapk8ip3Q9ESN9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Mapk8ip3Q9ESN9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Mapk8ip3Q9ESN9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Mapk8ip3Q9ESN9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Mapk8ip3Q9ESN9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,86■■■■□ 3,65
Mapk8ip3Q9ESN9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Mapk8ip3Q9ESN9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Mapk8ip3Q9ESN9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Mapk8ip3Q9ESN9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Mapk8ip3Q9ESN9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Mapk8ip3Q9ESN9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Mapk8ip3Q9ESN9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Mapk8ip3Q9ESN9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Mapk8ip3Q9ESN9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Mapk8ip3Q9ESN9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Mapk8ip3Q9ESN9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Mapk8ip3Q9ESN9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Mapk8ip3Q9ESN9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Mapk8ip3Q9ESN9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Mapk8ip3Q9ESN9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,25■■■■□ 3,55
Mapk8ip3Q9ESN9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Mapk8ip3Q9ESN9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Mapk8ip3Q9ESN9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,01■■■■□ 3,52
Mapk8ip3Q9ESN9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Mapk8ip3Q9ESN9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Mapk8ip3Q9ESN9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Mapk8ip3Q9ESN9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Mapk8ip3Q9ESN9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Mapk8ip3Q9ESN9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Mapk8ip3Q9ESN9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,47
Mapk8ip3Q9ESN9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Mapk8ip3Q9ESN9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Mapk8ip3Q9ESN9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Mapk8ip3Q9ESN9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms