RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	KIN4	Q01919	800 aa		13.19	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	MRC1	P25588	1096 aa		13.18	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	PXL1	P36166	706 aa		13.18	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	ICP55	P40051	511 aa		13.18	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	ASF1	P32447	279 aa		13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	HKR1	P41809	1802 aa		13.16	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	PET123	P17558	318 aa		13.15	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	AFT2	Q08957	416 aa		13.15	□□□□□ -0.3
YSC84	YHR016C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	CSC1	Q06538	782 aa		13.14	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	PTC5	Q12511	572 aa		13.14	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	STE11	P23561	717 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	ANP1	P32629	500 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MYO3	P36006	1272 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RXT2	P38255	430 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	GDE1	Q02979	1223 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MMR1	Q06324	491 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	GRX6	Q12438	231 aa		13.13	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	KRE2	P27809	442 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MAL31	P38156	614 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	YHL050C	P38721	697 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	SPL2	P38839	148 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RTT107	P38850	1070 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	PCI8	P40512	444 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MGA2	P40578	1113 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	ALF1	P53904	254 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MCM16	Q12262	181 aa		13.12	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	SAP190	P36123	1033 aa		13.11	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	YOR111W	Q99210	232 aa		13.11	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MYO1	P08964	1928 aa		13.1	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MSH3	P25336	1018 aa		13.1	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RAD26	P40352	1085 aa		13.1	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		13.1	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	MAK31	P23059	88 aa		13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	RTS1	P38903	757 aa		13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	CSM2	P40465	213 aa		13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	UBX2	Q04228	584 aa		13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	VPS38	Q05919	439 aa		13.09	□□□□□ -0.31
YSC84	YHR016C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	CCC2	P38995	1004 aa		13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	CAJ1	P39101	391 aa		13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	CEX1	Q12453	761 aa		13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	SEC65	P29478	273 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	YKU70	P32807	602 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	YET1	P35723	206 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	LYS14	P40971	790 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	YGR237C	P50089	785 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	IRC4	Q03036	179 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	FLO1	P32768	1537 aa		13.07	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	ALG1	P16661	449 aa		13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	ALG2	P43636	503 aa		13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		13.06	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	RIT1	P23796	513 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	DPB3	P27344	201 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	HIR1	P32479	840 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	BCD1	P38772	366 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	SEC9	P40357	651 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	YOR296W	Q08748	1289 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	ATG9	Q12142	997 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	CTM1	P38818	585 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	SET4	P42948	560 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	DAK2	P43550	591 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	SMC3	P47037	1230 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	YGL138C	P53122	345 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	MAL13	P53338	473 aa		13.05	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
YSC84	YHR016C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32

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