RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	MGM1	P32266	881 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	YJR115W	P47152	169 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	EAR1	Q03212	550 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	THI3	Q07471	609 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	GIN4	Q12263	1142 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	ARG82	P07250	355 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.4	□□□□□ -1.22	not detected
SYF2	YGR129W	IXR1	P33417	597 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	MAM1	P40065	302 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	IRC4	Q03036	179 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	YOL057W	Q08225	711 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	PPM2	Q08282	695 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SYF2	YGR129W	YJU3	P28321	313 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	YBR287W	P38355	427 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	VPS62	P53285	467 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	DNM1	P54861	757 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	SWI1	P09547	1314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	LDH1	P38139	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	ERG7	P38604	731 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	JJJ2	P46997	583 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	YJR008W	P47085	338 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	ITC1	P53125	1264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	SAC3	P46674	1301 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	FIR1	P40020	876 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	NET1	P47035	1189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	ADR1	P07248	1323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	PRD1	P25375	712 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	ATG1	P53104	897 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	ECM30	Q06673	1274 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	RAD53	P22216	821 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	PSF3	Q12146	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SYF2	YGR129W	FLO1	P32768	1537 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	PSH1	Q12161	406 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	NUP133	P36161	1157 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YDR306C	Q06640	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	TY3A-G	Q12173	290 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	TY3A-I	Q99219	290 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	VAC17	P25591	423 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	OCT1	P35999	772 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YFL040W	P43562	540 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	GYP7	P48365	746 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YPL034W	Q03083	165 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YFH7	P43591	353 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YDL176W	Q12027	708 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	CSN12	P47130	423 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	MTC5	Q03897	1148 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	ADP1	P25371	1049 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	MCD4	P36051	919 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	UIP5	P36137	443 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	AIM21	P40563	679 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	AHC1	Q12433	566 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SYF2	YGR129W	MRP7	P12687	371 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	ACA1	P39970	489 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	FMP30	Q02883	468 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	THI22	Q06490	572 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	ICL2	Q12031	575 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	YOR131C	Q12486	218 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	YJL007C	P47080	104 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	IOC4	Q04213	475 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	OPT2	Q06593	877 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	RTT109	Q07794	436 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	SRS2	P12954	1174 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	VAB2	P40003	282 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	LYS14	P40971	790 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	APL6	P46682	809 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	SRT1	Q03175	343 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	YLR346C	Q06139	101 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	SUT2	Q12286	268 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	HIP1	P06775	603 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	AFG3	P39925	761 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	CAF120	P53836	1060 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	SNF3	P10870	884 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	YBL028C	P38202	106 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	NUP85	P46673	744 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYF2	YGR129W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25

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