RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W DNF1P32660 1571 aa2.31□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W USO1P25386 1790 aa2.31□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W HSE1P38753 452 aa2.31□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ROM1P53046 1155 aa2.31□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ENT3P47160 408 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W BIO5P53744 561 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ECM2P38241 364 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W YOR223WQ12015 292 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W FET4P40988 552 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ELG1Q12050 791 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W YRF1-2P40105 1681 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ITC1P53125 1264 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W PMT7Q06644 662 aa2.3□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W INP51P40559 946 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ALD4P46367 519 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W CAB1Q04430 367 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W PUN1Q06991 263 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W YLR122CQ12312 125 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W FUR4P05316 633 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W NAP1P25293 417 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ACF4P47129 309 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W MSH6Q03834 1242 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W KAR2P16474 682 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W ITT1Q04638 464 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W GIC2Q06648 383 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W NNK1P36003 928 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W YBR197CP38306 217 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W RAD55P38953 406 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W FOL2P51601 243 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W PPT1P53043 513 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W YIG1Q08956 461 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W REC8Q12188 680 aa2.29□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W BRE4Q07660 1125 aa2.28□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W MMM1P41800 426 aa2.28□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W SNT2P53127 1403 aa2.28□□□□□ -2.04
MDS3YGL197W LIP5P32875 414 aa2.28□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W TOS1P38288 455 aa2.28□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W RKM2Q03942 479 aa2.28□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W TOM1Q03280 3268 aa2.28□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W CIC1P38779 376 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data2.27□□□□□ -2.05not detected
MDS3YGL197W BUD3P25558 1636 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W POL5P39985 1022 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SAM37P50110 327 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W YNL165WP53891 406 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W MEC3Q02574 474 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W UBX7P38349 436 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W HNT2P49775 206 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ATG1P53104 897 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W RSC4Q02206 625 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W MSN1P22148 382 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ISC10P32645 267 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ATG14P38270 344 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W PAN5P38787 379 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W UBP5P39944 805 aa2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W MYO4P32492 1471 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W PSY2P40164 858 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W PRY1P47032 299 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W LAP2Q10740 671 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W BOI1P38041 980 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W TRA1P38811 3744 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SRO9P25567 434 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W GCD6P32501 712 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W NEO1P40527 1151 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SAP155P43612 1002 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W GDB1Q06625 1536 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W DNF2Q12675 1612 aa2.26□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W RVS167P39743 482 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SNF7P39929 240 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W NCE103P53615 221 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ECM23Q02710 187 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W PNP1Q05788 311 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W IQG1Q12280 1495 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W TY4B-JP47024 1803 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W HVG1P0CE11 249 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W MDL2P33311 773 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ALD3P54114 506 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W ADP1P25371 1049 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W SMY2P32909 740 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W YKL077WP36081 392 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W YNR040WP53736 256 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W CYC7P00045 113 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W RIM8P53179 542 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W GLO4Q12320 285 aa2.25□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
MDS3YGL197W KTR7P40504 517 aa2.24□□□□□ -2.05
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