RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm156Q58A37 223 aa28.33■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Birc3O08863 600 aa28.32■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aplp1Q03157 653 aa28.32■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa28.31■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Phf14Q9D4H9 881 aa28.3■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rsph4aQ8BYM7 716 aa28.3■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ecm2Q5FW85 670 aa28.29■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif13aQ9EQW7 1749 aa28.29■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa28.27■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PplQ9R269 1755 aa28.27■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rsph3aQ3UFY4 516 aa28.26■■■□□ 2.12
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa28.26■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa28.26■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rfx1P48377 963 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nwd1A6H603 1563 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ddit3P35639 168 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pdcl3Q8BVF2 240 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Synj2Q9D2G5 1434 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim27Q62158 513 aa28.24■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Usp16Q99LG0 825 aa28.24■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Afap1Q80YS6 731 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rsph6aQ8CDR2 708 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sos1Q62245 1319 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plcb2A3KGF7 1181 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif20aP97329 887 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cgnl1Q6AW69 1298 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Spef2Q8C9J3 1734 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cabp2Q9JLK4 216 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nek4Q9Z1J2 792 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Idi2Q8BFZ6 227 aa28.19■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mcm10Q0VBD2 885 aa28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aldh8a1Q8BH00 487 aa28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kcnn1Q9EQR3 537 aa28.17■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ric3Q8BPM6 367 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 GorabQ8BRM2 368 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif1aP33173 1695 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hoxb7P09024 217 aa28.15■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf316Q6PGE4 1016 aa28.15■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Il4rP16382 810 aa28.14■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CenppQ9CZ92 286 aa28.14■■■□□ 2.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aldh1l2Q8K009 923 aa28.14■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Asxl2Q8BZ32 1370 aa28.13■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtpruB1AUH1 1446 aa28.13■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gcc1Q9D4H2 778 aa28.13■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa28.12■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa28.12■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa28.11■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Klhdc4Q921I2 584 aa28.11■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dip2aQ8BWT5 1523 aa28.1■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mcm2P97310 904 aa28.09■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gtf2a1Q99PM3 378 aa28.09■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif24Q6NWW5 1356 aa28.09■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc146E9Q9F7 977 aa28.09■■■□□ 2.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stk31Q99MW1 1018 aa28.07■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa28.06■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tm6sf1P58749 370 aa28.06■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 FanclQ9CR14 375 aa28.06■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CatipB9EKE5 520 aa28.05■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 EngaseQ8BX80 734 aa28.05■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Triml2E9PW10 424 aa28.04■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plin1Q8CGN5 517 aa28.04■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Casq1O09165 405 aa28.03■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chl1P70232 1209 aa28.03■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa28.03■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eif4a2P10630 407 aa28.03■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Psme1P97371 249 aa28.02■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam13aQ8BGI4 693 aa28.02■■■□□ 2.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aifm3Q3TY86 605 aa28.01■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp6r3Q922D4 844 aa28.01■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa28.01■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 MpripP97434 1024 aa27.99■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cps1Q8C196 1500 aa27.97■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NpatQ8BMA5 1420 aa27.97■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Phf23Q8BSN5 401 aa27.96■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27.95■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Txndc2Q6P902 515 aa27.95■■■□□ 2.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Bloc1s4Q8VED2 215 aa27.95■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Bag4Q8CI61 457 aa27.94■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa27.94■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prkar2bP31324 416 aa27.94■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Astn2Q80Z10 1352 aa27.93■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.7 ms