Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
1700010I14RikQ7TPG0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
1700010I14RikQ7TPG0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
1700010I14RikQ7TPG0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
1700010I14RikQ7TPG0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
1700010I14RikQ7TPG0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
1700010I14RikQ7TPG0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
1700010I14RikQ7TPG0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
1700010I14RikQ7TPG0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
1700010I14RikQ7TPG0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
1700010I14RikQ7TPG0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
1700010I14RikQ7TPG0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
1700010I14RikQ7TPG0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
1700010I14RikQ7TPG0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
1700010I14RikQ7TPG0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
1700010I14RikQ7TPG0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
1700010I14RikQ7TPG0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
1700010I14RikQ7TPG0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
1700010I14RikQ7TPG0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
1700010I14RikQ7TPG0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
1700010I14RikQ7TPG0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
1700010I14RikQ7TPG0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
1700010I14RikQ7TPG0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
1700010I14RikQ7TPG0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
1700010I14RikQ7TPG0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
1700010I14RikQ7TPG0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
1700010I14RikQ7TPG0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
1700010I14RikQ7TPG0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
1700010I14RikQ7TPG0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
1700010I14RikQ7TPG0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
1700010I14RikQ7TPG0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
1700010I14RikQ7TPG0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
1700010I14RikQ7TPG0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
1700010I14RikQ7TPG0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
1700010I14RikQ7TPG0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
1700010I14RikQ7TPG0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
1700010I14RikQ7TPG0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
1700010I14RikQ7TPG0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
1700010I14RikQ7TPG0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
1700010I14RikQ7TPG0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
1700010I14RikQ7TPG0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
1700010I14RikQ7TPG0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
1700010I14RikQ7TPG0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
1700010I14RikQ7TPG0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
1700010I14RikQ7TPG0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
1700010I14RikQ7TPG0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
1700010I14RikQ7TPG0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
1700010I14RikQ7TPG0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
1700010I14RikQ7TPG0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
1700010I14RikQ7TPG0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
1700010I14RikQ7TPG0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
1700010I14RikQ7TPG0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
1700010I14RikQ7TPG0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
1700010I14RikQ7TPG0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
1700010I14RikQ7TPG0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
1700010I14RikQ7TPG0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
1700010I14RikQ7TPG0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
1700010I14RikQ7TPG0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
1700010I14RikQ7TPG0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
1700010I14RikQ7TPG0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
1700010I14RikQ7TPG0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
1700010I14RikQ7TPG0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
1700010I14RikQ7TPG0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
1700010I14RikQ7TPG0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
1700010I14RikQ7TPG0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
1700010I14RikQ7TPG0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
1700010I14RikQ7TPG0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
1700010I14RikQ7TPG0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
1700010I14RikQ7TPG0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
1700010I14RikQ7TPG0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
1700010I14RikQ7TPG0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
1700010I14RikQ7TPG0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
1700010I14RikQ7TPG0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
1700010I14RikQ7TPG0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
1700010I14RikQ7TPG0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
1700010I14RikQ7TPG0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
1700010I14RikQ7TPG0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
1700010I14RikQ7TPG0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
1700010I14RikQ7TPG0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
1700010I14RikQ7TPG0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms