Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Triml2E9PW10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Triml2E9PW10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Triml2E9PW10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Triml2E9PW10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Triml2E9PW10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Triml2E9PW10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Triml2E9PW10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Triml2E9PW10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Triml2E9PW10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Triml2E9PW10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Triml2E9PW10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Triml2E9PW10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Triml2E9PW10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Triml2E9PW10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Triml2E9PW10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Triml2E9PW10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Triml2E9PW10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Triml2E9PW10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Triml2E9PW10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Triml2E9PW10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Triml2E9PW10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Triml2E9PW10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Triml2E9PW10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Triml2E9PW10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Triml2E9PW10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Triml2E9PW10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Triml2E9PW10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Triml2E9PW10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Triml2E9PW10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Triml2E9PW10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Triml2E9PW10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Triml2E9PW10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Triml2E9PW10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Triml2E9PW10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Triml2E9PW10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Triml2E9PW10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Triml2E9PW10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Triml2E9PW10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Triml2E9PW10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Triml2E9PW10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Triml2E9PW10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Triml2E9PW10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Triml2E9PW10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Triml2E9PW10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Triml2E9PW10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Triml2E9PW10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Triml2E9PW10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Triml2E9PW10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Triml2E9PW10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Triml2E9PW10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Triml2E9PW10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Triml2E9PW10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Triml2E9PW10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Triml2E9PW10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Triml2E9PW10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Triml2E9PW10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Triml2E9PW10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Triml2E9PW10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Triml2E9PW10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Triml2E9PW10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Triml2E9PW10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Triml2E9PW10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Triml2E9PW10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Triml2E9PW10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Triml2E9PW10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Triml2E9PW10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Triml2E9PW10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Triml2E9PW10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Triml2E9PW10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Triml2E9PW10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Triml2E9PW10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Triml2E9PW10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Triml2E9PW10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Triml2E9PW10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Triml2E9PW10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Triml2E9PW10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Triml2E9PW10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Triml2E9PW10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Triml2E9PW10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Triml2E9PW10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Triml2E9PW10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Triml2E9PW10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Triml2E9PW10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Triml2E9PW10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Triml2E9PW10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Triml2E9PW10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Triml2E9PW10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Triml2E9PW10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Triml2E9PW10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Triml2E9PW10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Triml2E9PW10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Triml2E9PW10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Triml2E9PW10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Triml2E9PW10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Triml2E9PW10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Triml2E9PW10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Triml2E9PW10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Triml2E9PW10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Triml2E9PW10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms