Protein–RNA interactions for Protein: P31324

Prkar2b, cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar2bP31324 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
Prkar2bP31324 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Prkar2bP31324 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Prkar2bP31324 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Prkar2bP31324 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Prkar2bP31324 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Prkar2bP31324 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Prkar2bP31324 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Prkar2bP31324 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Prkar2bP31324 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Prkar2bP31324 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Prkar2bP31324 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Prkar2bP31324 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Prkar2bP31324 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Prkar2bP31324 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Prkar2bP31324 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Prkar2bP31324 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Prkar2bP31324 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Prkar2bP31324 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Prkar2bP31324 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Prkar2bP31324 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Prkar2bP31324 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Prkar2bP31324 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Prkar2bP31324 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Prkar2bP31324 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Prkar2bP31324 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Prkar2bP31324 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Prkar2bP31324 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Prkar2bP31324 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Prkar2bP31324 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Prkar2bP31324 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Prkar2bP31324 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Prkar2bP31324 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Prkar2bP31324 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Prkar2bP31324 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Prkar2bP31324 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Prkar2bP31324 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Prkar2bP31324 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Prkar2bP31324 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Prkar2bP31324 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Prkar2bP31324 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Prkar2bP31324 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Prkar2bP31324 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Prkar2bP31324 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Prkar2bP31324 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Prkar2bP31324 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Prkar2bP31324 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Prkar2bP31324 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Prkar2bP31324 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prkar2bP31324 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Prkar2bP31324 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Prkar2bP31324 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Prkar2bP31324 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Prkar2bP31324 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Prkar2bP31324 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Prkar2bP31324 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Prkar2bP31324 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Prkar2bP31324 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Prkar2bP31324 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Prkar2bP31324 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prkar2bP31324 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Prkar2bP31324 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Prkar2bP31324 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Prkar2bP31324 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Prkar2bP31324 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Prkar2bP31324 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Prkar2bP31324 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Prkar2bP31324 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Prkar2bP31324 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Prkar2bP31324 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Prkar2bP31324 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Prkar2bP31324 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Prkar2bP31324 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Prkar2bP31324 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prkar2bP31324 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Prkar2bP31324 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Prkar2bP31324 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prkar2bP31324 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Prkar2bP31324 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Prkar2bP31324 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Prkar2bP31324 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prkar2bP31324 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Prkar2bP31324 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prkar2bP31324 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Prkar2bP31324 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Prkar2bP31324 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Prkar2bP31324 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Prkar2bP31324 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Prkar2bP31324 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Prkar2bP31324 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Prkar2bP31324 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Prkar2bP31324 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Prkar2bP31324 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Prkar2bP31324 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Prkar2bP31324 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Prkar2bP31324 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Prkar2bP31324 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Prkar2bP31324 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Prkar2bP31324 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Prkar2bP31324 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms