Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Casq1O09165 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Casq1O09165 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,76■■■■□ 3,96
Casq1O09165 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Casq1O09165 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,6■■■■□ 3,77
Casq1O09165 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Casq1O09165 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
Casq1O09165 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Casq1O09165 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Casq1O09165 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Casq1O09165 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Casq1O09165 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Casq1O09165 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Casq1O09165 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Casq1O09165 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Casq1O09165 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,77■■■■□ 3,48
Casq1O09165 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Casq1O09165 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Casq1O09165 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Casq1O09165 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Casq1O09165 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Casq1O09165 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Casq1O09165 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Casq1O09165 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Casq1O09165 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Casq1O09165 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Casq1O09165 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Casq1O09165 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Casq1O09165 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Casq1O09165 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,49■■■■□ 3,27
Casq1O09165 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Casq1O09165 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Casq1O09165 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Casq1O09165 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Casq1O09165 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Casq1O09165 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Casq1O09165 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Casq1O09165 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Casq1O09165 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Casq1O09165 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Casq1O09165 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Casq1O09165 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Casq1O09165 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Casq1O09165 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Casq1O09165 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Casq1O09165 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Casq1O09165 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Casq1O09165 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Casq1O09165 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Casq1O09165 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Casq1O09165 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Casq1O09165 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Casq1O09165 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Casq1O09165 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Casq1O09165 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Casq1O09165 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Casq1O09165 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Casq1O09165 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Casq1O09165 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Casq1O09165 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Casq1O09165 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Casq1O09165 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Casq1O09165 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Casq1O09165 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Casq1O09165 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Casq1O09165 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Casq1O09165 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Casq1O09165 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Casq1O09165 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Casq1O09165 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Casq1O09165 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Casq1O09165 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Casq1O09165 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Casq1O09165 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Casq1O09165 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Casq1O09165 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Casq1O09165 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Casq1O09165 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Casq1O09165 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Casq1O09165 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Casq1O09165 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Casq1O09165 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Casq1O09165 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Casq1O09165 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Casq1O09165 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Casq1O09165 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Casq1O09165 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Casq1O09165 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Casq1O09165 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Casq1O09165 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Casq1O09165 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Casq1O09165 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Casq1O09165 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Casq1O09165 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Casq1O09165 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Casq1O09165 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Casq1O09165 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Casq1O09165 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Casq1O09165 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Casq1O09165 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
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