Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Casq1O09165 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Casq1O09165 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Casq1O09165 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Casq1O09165 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Casq1O09165 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Casq1O09165 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Casq1O09165 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Casq1O09165 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Casq1O09165 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Casq1O09165 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Casq1O09165 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Casq1O09165 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Casq1O09165 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Casq1O09165 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Casq1O09165 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Casq1O09165 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Casq1O09165 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Casq1O09165 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Casq1O09165 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Casq1O09165 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Casq1O09165 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Casq1O09165 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Casq1O09165 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Casq1O09165 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Casq1O09165 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Casq1O09165 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Casq1O09165 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Casq1O09165 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Casq1O09165 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Casq1O09165 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Casq1O09165 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Casq1O09165 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Casq1O09165 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Casq1O09165 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Casq1O09165 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Casq1O09165 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Casq1O09165 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Casq1O09165 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Casq1O09165 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Casq1O09165 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Casq1O09165 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Casq1O09165 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Casq1O09165 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Casq1O09165 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Casq1O09165 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Casq1O09165 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Casq1O09165 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Casq1O09165 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Casq1O09165 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Casq1O09165 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Casq1O09165 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Casq1O09165 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Casq1O09165 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Casq1O09165 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Casq1O09165 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Casq1O09165 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Casq1O09165 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Casq1O09165 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Casq1O09165 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Casq1O09165 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Casq1O09165 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Casq1O09165 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Casq1O09165 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Casq1O09165 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Casq1O09165 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Casq1O09165 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Casq1O09165 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Casq1O09165 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Casq1O09165 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Casq1O09165 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Casq1O09165 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Casq1O09165 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Casq1O09165 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Casq1O09165 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Casq1O09165 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Casq1O09165 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Casq1O09165 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Casq1O09165 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Casq1O09165 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Casq1O09165 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Casq1O09165 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Casq1O09165 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Casq1O09165 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Casq1O09165 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Casq1O09165 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Casq1O09165 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Casq1O09165 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Casq1O09165 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Casq1O09165 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Casq1O09165 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Casq1O09165 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Casq1O09165 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Casq1O09165 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Casq1O09165 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Casq1O09165 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Casq1O09165 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Casq1O09165 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Casq1O09165 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Casq1O09165 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
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