Protein–RNA interactions for Protein: P97329

Kif20a, Kinesin-like protein KIF20A, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif20aP97329 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
Kif20aP97329 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Kif20aP97329 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Kif20aP97329 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Kif20aP97329 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Kif20aP97329 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Kif20aP97329 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Kif20aP97329 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Kif20aP97329 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Kif20aP97329 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Kif20aP97329 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kif20aP97329 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Kif20aP97329 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kif20aP97329 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Kif20aP97329 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kif20aP97329 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Kif20aP97329 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Kif20aP97329 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Kif20aP97329 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kif20aP97329 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kif20aP97329 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kif20aP97329 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kif20aP97329 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kif20aP97329 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kif20aP97329 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kif20aP97329 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kif20aP97329 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kif20aP97329 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kif20aP97329 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Kif20aP97329 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kif20aP97329 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kif20aP97329 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kif20aP97329 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Kif20aP97329 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kif20aP97329 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kif20aP97329 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kif20aP97329 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kif20aP97329 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kif20aP97329 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kif20aP97329 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kif20aP97329 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kif20aP97329 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kif20aP97329 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kif20aP97329 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kif20aP97329 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kif20aP97329 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kif20aP97329 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kif20aP97329 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kif20aP97329 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kif20aP97329 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kif20aP97329 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Kif20aP97329 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Kif20aP97329 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kif20aP97329 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Kif20aP97329 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kif20aP97329 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kif20aP97329 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kif20aP97329 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kif20aP97329 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Kif20aP97329 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kif20aP97329 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Kif20aP97329 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kif20aP97329 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Kif20aP97329 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kif20aP97329 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Kif20aP97329 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kif20aP97329 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kif20aP97329 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kif20aP97329 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kif20aP97329 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kif20aP97329 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kif20aP97329 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kif20aP97329 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Kif20aP97329 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kif20aP97329 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kif20aP97329 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kif20aP97329 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kif20aP97329 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kif20aP97329 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Kif20aP97329 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kif20aP97329 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kif20aP97329 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kif20aP97329 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kif20aP97329 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kif20aP97329 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kif20aP97329 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kif20aP97329 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kif20aP97329 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kif20aP97329 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kif20aP97329 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kif20aP97329 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kif20aP97329 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kif20aP97329 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kif20aP97329 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kif20aP97329 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kif20aP97329 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kif20aP97329 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Kif20aP97329 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kif20aP97329 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kif20aP97329 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms