RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NischQ80TM9 1593 aa42.87■■■■■ 4.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41.96■■■■■ 4.31
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abcc9P70170 1546 aa41.68■■■■■ 4.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abcc8B2RUS7 1588 aa40.62■■■■■ 4.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rhox8Q6VSS7 320 aa40.09■■■■■ 4.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rtl1Q7M732 1744 aa39.98■■■■□ 3.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39.34■■■■□ 3.89
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dcaf1Q80TR8 1506 aa38.03■■■■□ 3.68
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa38■■■■□ 3.67
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ScribQ80U72 1612 aa37.61■■■■□ 3.61
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37.59■■■■□ 3.61
Ccsap-201ENSMUST00000034452 HrcG5E8J6 738 aa37.49■■■■□ 3.59
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Baz1aO88379 1555 aa37.19■■■■□ 3.54
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa37.13■■■■□ 3.53
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm5dQ62240 1548 aa37.03■■■■□ 3.52
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NacadQ5SWP3 1504 aa36.71■■■■□ 3.47
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim41Q5NCC3 630 aa36.54■■■■□ 3.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Crybg2B7ZCC2 1516 aa36.48■■■■□ 3.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Smarca2Q6DIC0 1577 aa36.39■■■■□ 3.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep164Q5DU05 1446 aa36.22■■■■□ 3.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35.89■■■■□ 3.34
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pcgf6Q99NA9 353 aa35.84■■■■□ 3.33
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chic1Q8CBW7 227 aa35.48■■■■□ 3.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cngb1E1AZ71 1325 aa35.47■■■■□ 3.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa35.37■■■■□ 3.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Golga3P55937 1487 aa35.33■■■■□ 3.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35.25■■■■□ 3.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gab3Q8BSM5 595 aa35.24■■■■□ 3.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Synj1Q8CHC4 1574 aa35.18■■■■□ 3.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 BicraF8VPZ9 1578 aa35.01■■■■□ 3.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CftrP26361 1476 aa34.95■■■■□ 3.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NefmP08553 848 aa34.89■■■■□ 3.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Top2bQ64511 1612 aa34.85■■■■□ 3.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mier1Q5UAK0 511 aa34.78■■■■□ 3.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.71■■■■□ 3.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zeb1Q64318 1117 aa34.62■■■■□ 3.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34.45■■■■□ 3.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa34.42■■■■□ 3.1
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Neurod1Q60867 357 aa34.36■■■■□ 3.09
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fmn1Q05860 1466 aa34.32■■■■□ 3.08
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sall2Q9QX96 1004 aa34.22■■■■□ 3.07
Ccsap-201ENSMUST00000034452 UbtfP25976 765 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep162Q6ZQ06 1403 aa34.11■■■■□ 3.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33.9■■■■□ 3.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myt1lP97500 1187 aa33.87■■■■□ 3.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Npm2Q80W85 207 aa33.74■■■□□ 2.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Wdr66E9Q743 1299 aa33.7■■■□□ 2.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Anks4bQ8K3X6 423 aa33.68■■■□□ 2.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Clip1Q922J3 1391 aa33.67■■■□□ 2.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ClspnQ80YR7 1315 aa33.63■■■□□ 2.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TnnQ80Z71 1560 aa33.6■■■□□ 2.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TonslQ6NZL6 1363 aa33.51■■■□□ 2.95
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa33.49■■■□□ 2.95
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33.47■■■□□ 2.95
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arhgap35Q91YM2 1499 aa33.41■■■□□ 2.94
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NrkQ9R0G8 1455 aa33.34■■■□□ 2.93
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtprkP35822 1457 aa33.27■■■□□ 2.92
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eea1Q8BL66 1411 aa33.25■■■□□ 2.91
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arap1Q4LDD4 1452 aa33.21■■■□□ 2.91
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33.2■■■□□ 2.91
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Csrnp3P59055 597 aa33.19■■■□□ 2.9
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Frmpd1A2AKB4 1549 aa33.19■■■□□ 2.9
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Wdr62Q3U3T8 1523 aa33.15■■■□□ 2.9
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa33.14■■■□□ 2.9
Ccsap-201ENSMUST00000034452 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa33.13■■■□□ 2.89
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa33.12■■■□□ 2.89
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Shroom4Q1W617 1475 aa33.1■■■□□ 2.89
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Map3k1P53349 1493 aa33.09■■■□□ 2.89
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc18Q640L5 1455 aa33.09■■■□□ 2.89
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Setd5Q5XJV7 1441 aa33.05■■■□□ 2.88
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm5bQ80Y84 1544 aa33.04■■■□□ 2.88
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif15Q6P9L6 1387 aa33■■■□□ 2.87
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.99■■■□□ 2.87
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Il27Q8K3I6 234 aa32.96■■■□□ 2.87
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa32.94■■■□□ 2.86
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tiam1Q60610 1591 aa32.9■■■□□ 2.86
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aplp2Q06335 707 aa32.85■■■□□ 2.85
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32.85■■■□□ 2.85
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Grin2bQ01097 1482 aa32.82■■■□□ 2.84
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32.81■■■□□ 2.84
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ercc6F8VPZ5 1481 aa32.79■■■□□ 2.84
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Erich3F6QRE9 1637 aa32.78■■■□□ 2.84
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eid3Q3V124 375 aa32.77■■■□□ 2.84
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Naip1Q9QWK5 1403 aa32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 128.5 ms