Protein–RNA interactions for Protein: Q8K009

Aldh1l2, Mitochondrial 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1l2Q8K009 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,47■■■■■ 5,03
Aldh1l2Q8K009 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Aldh1l2Q8K009 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Aldh1l2Q8K009 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Aldh1l2Q8K009 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Aldh1l2Q8K009 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,54■■■■■ 4,24
Aldh1l2Q8K009 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,17■■■■■ 4,18
Aldh1l2Q8K009 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,43■■■■■ 4,06
Aldh1l2Q8K009 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Aldh1l2Q8K009 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,06■■■■■ 4
Aldh1l2Q8K009 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,87■■■■□ 3,97
Aldh1l2Q8K009 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Aldh1l2Q8K009 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39,41■■■■□ 3,9
Aldh1l2Q8K009 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Aldh1l2Q8K009 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Aldh1l2Q8K009 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Aldh1l2Q8K009 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,87■■■■□ 3,81
Aldh1l2Q8K009 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Aldh1l2Q8K009 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Aldh1l2Q8K009 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Aldh1l2Q8K009 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Aldh1l2Q8K009 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Aldh1l2Q8K009 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Aldh1l2Q8K009 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Aldh1l2Q8K009 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38,48■■■■□ 3,75
Aldh1l2Q8K009 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Aldh1l2Q8K009 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Aldh1l2Q8K009 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Aldh1l2Q8K009 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Aldh1l2Q8K009 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Aldh1l2Q8K009 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,96■■■■□ 3,67
Aldh1l2Q8K009 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Aldh1l2Q8K009 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Aldh1l2Q8K009 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,76■■■■□ 3,64
Aldh1l2Q8K009 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Aldh1l2Q8K009 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Aldh1l2Q8K009 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Aldh1l2Q8K009 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Aldh1l2Q8K009 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Aldh1l2Q8K009 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,29■■■■□ 3,56
Aldh1l2Q8K009 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Aldh1l2Q8K009 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Aldh1l2Q8K009 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Aldh1l2Q8K009 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Aldh1l2Q8K009 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Aldh1l2Q8K009 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Aldh1l2Q8K009 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
Aldh1l2Q8K009 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Aldh1l2Q8K009 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Aldh1l2Q8K009 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Aldh1l2Q8K009 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Aldh1l2Q8K009 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Aldh1l2Q8K009 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Aldh1l2Q8K009 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,51■■■■□ 3,44
Aldh1l2Q8K009 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Aldh1l2Q8K009 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Aldh1l2Q8K009 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Aldh1l2Q8K009 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Aldh1l2Q8K009 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Aldh1l2Q8K009 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,24■■■■□ 3,39
Aldh1l2Q8K009 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Aldh1l2Q8K009 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Aldh1l2Q8K009 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Aldh1l2Q8K009 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Aldh1l2Q8K009 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Aldh1l2Q8K009 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Aldh1l2Q8K009 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Aldh1l2Q8K009 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,05■■■■□ 3,36
Aldh1l2Q8K009 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Aldh1l2Q8K009 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Aldh1l2Q8K009 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Aldh1l2Q8K009 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
Aldh1l2Q8K009 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Aldh1l2Q8K009 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Aldh1l2Q8K009 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Aldh1l2Q8K009 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Aldh1l2Q8K009 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Aldh1l2Q8K009 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,53■■■■□ 3,28
Aldh1l2Q8K009 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Aldh1l2Q8K009 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Aldh1l2Q8K009 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Aldh1l2Q8K009 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Aldh1l2Q8K009 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Aldh1l2Q8K009 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Aldh1l2Q8K009 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Aldh1l2Q8K009 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Aldh1l2Q8K009 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Aldh1l2Q8K009 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Aldh1l2Q8K009 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Aldh1l2Q8K009 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Aldh1l2Q8K009 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Aldh1l2Q8K009 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Aldh1l2Q8K009 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Aldh1l2Q8K009 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Aldh1l2Q8K009 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Aldh1l2Q8K009 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Aldh1l2Q8K009 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Aldh1l2Q8K009 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Aldh1l2Q8K009 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Aldh1l2Q8K009 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,8 ms